More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_23190 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_23190  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 242 aa  475  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144138 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1955  putative transcriptional regulator  94.21 
 
 		 242 aa  450  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1595  IclR family transcriptional regulator  45.34 
 
 		 264 aa  179  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1041  IclR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 258 aa  172  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0399426 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0160  transcriptional regulator, IclR family  42.24 
 
 		 244 aa  172  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2799  transcriptional regulator, IclR family  42.44 
 
 		 256 aa  169  4e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4161  IclR family transcriptional regulator  42.26 
 
 		 247 aa  169  5e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4409  transcriptional regulator, IclR family  41.74 
 
 		 249 aa  168  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2392  transcriptional regulator, IclR family  42.37 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2051  IclR family transcriptional regulator  41 
 
 		 249 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0630504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001509  transcriptional regulator  40.43 
 
 		 244 aa  152  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05447  hypothetical protein  40 
 
 		 244 aa  149  5e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0105  putative transcriptional regulator  38.98 
 
 		 244 aa  148  8e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  32.93 
 
 		 256 aa  105  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3857  transcriptional regulator, IclR family  32.5 
 
 		 287 aa  103  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0416  regulatory proteins, IclR  25.33 
 
 		 246 aa  94.7  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000505949  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 254 aa  92.8  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4081  IclR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 291 aa  92  7e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  31.43 
 
 		 280 aa  88.2  9e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2785  IclR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 249 aa  87  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253598  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5810  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 286 aa  87.4  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2997  IclR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 249 aa  87  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2324  regulatory protein IclR  28.71 
 
 		 250 aa  87  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000642248  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2995  transcriptional regulator, IclR family  31.28 
 
 		 249 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.71341e-17 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0813  transcriptional regulator, IclR family  31.16 
 
 		 249 aa  87  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225314  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 260 aa  86.7  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2734  IclR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 249 aa  86.3  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.16584e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 268 aa  85.5  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  28.4 
 
 		 261 aa  85.5  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2715  IclR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 249 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000240532  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3031  transcriptional regulator, IclR family  30.73 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2997  transcriptional regulator, IclR family  29.61 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000293237  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  31.56 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  27.5 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3441  regulatory proteins, IclR  29.67 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3033  IclR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000487376  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 267 aa  83.6  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4689  transcriptional regulator, IclR family  28.1 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6466  transcriptional regulator, IclR family  34.4 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185933  normal  0.684135 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5598  Transcriptional regulator  25.91 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0201808  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  34.84 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1418  regulatory protein, IclR  28.73 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000240863  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  31.43 
 
 		 265 aa  81.6  0.000000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 283 aa  81.6  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2248  transcriptional regulator, IclR family  29.05 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.000278056 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4374  transcriptional regulator, IclR family  28.24 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1714  regulatory protein, IclR  26.05 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4416  transcriptional regulator, IclR family  31.16 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  27.46 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1592  IclR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.885509 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  28.37 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2670  transcriptional regulator, IclR family  26.72 
 
 		 252 aa  79  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 272 aa  78.6  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2968  IclR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.980752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0615  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  30.49 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 257 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  29.36 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0314  transcriptional regulator IclR-like protein  29.75 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3307  IclR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6906  IclR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 264 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.162528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4413  transcriptional regulator, IclR family  32.98 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  26.67 
 
 		 278 aa  76.3  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3795  IclR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433741 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0492  IclR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3031  regulatory protein, IclR  29.36 
 
 		 276 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 276 aa  75.9  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0381  IclR family transcriptional regulator  28 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2354  IclR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0547  transcriptional regulator, IclR family  30.54 
 
 		 265 aa  75.5  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  27.87 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 255 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 255 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3261  IclR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 284 aa  75.1  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 255 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 255 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 255 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 255 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4440  regulatory protein IclR  30.18 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4346  regulatory protein, IclR  25.99 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361524  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4433  regulatory proteins, IclR  29.2 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0681  regulatory proteins, IclR  31.6 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8145  transcriptional regulator IclR family  30.65 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.122254  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1249  transcriptional regulator, IclR family  30.63 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  30.81 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4515  IclR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 242 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.390313  normal  0.426328 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0340  IclR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 272 aa  74.3  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.151352  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3482  IclR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4298  IclR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1072  IclR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0478344  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>