More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0615 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0615  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  100 
 
 		 261 aa  522  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3441  regulatory proteins, IclR  75.97 
 
 		 260 aa  400  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5810  IclR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 286 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7431  Transcriptional regulator  38.94 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3613  IclR family transcriptional regulator  39.7 
 
 		 317 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6719  IclR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.182238  normal  0.45322 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6484  IclR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140944  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3331  IclR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 284 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.181508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3795  IclR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 247 aa  112  8.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433741 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0993  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 251 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.892724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5598  Transcriptional regulator  34.31 
 
 		 246 aa  105  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0201808  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0340  IclR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 272 aa  102  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.151352  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0473  regulatory protein IclR  26.42 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6466  transcriptional regulator, IclR family  36.04 
 
 		 266 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185933  normal  0.684135 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05447  hypothetical protein  27.78 
 
 		 244 aa  95.5  8e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2392  transcriptional regulator, IclR family  31.02 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2799  transcriptional regulator, IclR family  31.02 
 
 		 256 aa  93.6  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001509  transcriptional regulator  27.65 
 
 		 244 aa  88.2  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0105  putative transcriptional regulator  28.31 
 
 		 244 aa  87.8  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1955  putative transcriptional regulator  30.89 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0160  transcriptional regulator, IclR family  28.9 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23190  putative transcriptional regulator  30.49 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144138 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1684  transcriptional regulator, IclR family  28.74 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0925752  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4161  IclR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3303  IclR family transcriptional regulator  27 
 
 		 244 aa  72  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.870247  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1041  IclR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 258 aa  71.6  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0399426 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2778  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0655324  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1595  IclR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1583  IclR-type transcriptional regulator  28.57 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0587  transcriptional regulator, IclR family  29.67 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0391803 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5545  regulatory protein, IclR  28.75 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2078  transcriptional regulator, IclR family  27.13 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.341471 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0373  IclR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 275 aa  68.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4638  transcriptional regulator, IclR family  25.6 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214771  normal  0.0505557 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4506  transcriptional regulator, IclR family  25.6 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4402  regulatory proteins, IclR  26.58 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3214  transcriptional regulator, IclR family  29.61 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1130  transcriptional regulator, IclR family  27.65 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2824  transcriptional regulator, IclR family  27.73 
 
 		 260 aa  65.5  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00611258  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6032  IclR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0681  regulatory proteins, IclR  28.69 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2380  IclR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.610686  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3826  transcriptional regulator, IclR family  26.79 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  26.18 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  23.98 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2316  IclR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812394  normal  0.959704 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2051  IclR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0630504  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1950  IclR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400846  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0951  IclR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2914  IclR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3169  transcriptional regulator, IclR family  23.35 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2234  IclR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1332  IclR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0591  IclR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211243  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2498  IclR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0976  IclR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41754  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1311  IclR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512593  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3974  transcriptional regulator, IclR family  24.14 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.482822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1238  IclR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159312  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0492  IclR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0315  IclR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.301467  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  24.11 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4223  regulatory protein, IclR  36.69 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.918168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4564  IclR family transcriptional regulator  23.11 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  hitchhiker  0.000704701 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7080  Transcriptional regulator  26.42 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1966  regulatory proteins, IclR  29.9 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1900  regulatory proteins, IclR  29.9 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.417398 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1920  IclR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245854  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6267  transcriptional regulator, IclR family  28.7 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4099  IclR family transcriptional regulator  23.11 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.313873 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4172  transcriptional regulator, IclR family  25.93 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102148  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4369  IclR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 266 aa  58.5  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2181  transcriptional regulator, IclR family  27.75 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169308  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3754  regulatory protein, IclR  27.89 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  27.9 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0091  transcriptional regulator, IclR family  31.36 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4454  Transcriptional regulator IclR  26.42 
 
 		 254 aa  57  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3846  transcriptional regulator, IclR family  27.51 
 
 		 269 aa  57  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4781  transcriptional regulator, IclR family  28.63 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1836  transcriptional regulator, IclR family  29.44 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0146542 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4121  IclR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.101535  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5595  IclR family transcriptional regulator  23.11 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.328221 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2383  transcriptional regulator, IclR family  25.94 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151168  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3662  IclR family transcriptional regulator  23.11 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115277  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0364  IclR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4409  transcriptional regulator, IclR family  24.24 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4705  IclR family transcriptional regulator  23.11 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0690054  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1993  IclR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.080856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2619  IclR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 317 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.471262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  25.85 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2428  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7063  transcriptional regulator, IclR family  24.03 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2477  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245965  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>