218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3613 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3613  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 317 aa  640    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5810  IclR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 286 aa  170  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7431  Transcriptional regulator  33.6 
 
 		 257 aa  158  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3441  regulatory proteins, IclR  40.7 
 
 		 260 aa  142  7e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3795  IclR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 247 aa  142  9e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433741 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0615  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  39.7 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0340  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 272 aa  137  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.151352  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0993  IclR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 251 aa  129  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.892724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6484  IclR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 242 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140944  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6719  IclR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 242 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.182238  normal  0.45322 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3331  IclR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.181508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5598  Transcriptional regulator  34 
 
 		 246 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0201808  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0473  regulatory protein IclR  29.41 
 
 		 244 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2799  transcriptional regulator, IclR family  29.25 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2392  transcriptional regulator, IclR family  29.03 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6466  transcriptional regulator, IclR family  31.2 
 
 		 266 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185933  normal  0.684135 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2078  transcriptional regulator, IclR family  25.31 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.341471 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1041  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 258 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0399426 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2875  IclR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3326  transcriptional regulator, IclR family  30.84 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.021393  hitchhiker  0.00795692 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2324  regulatory protein IclR  22.4 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000642248  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2316  IclR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812394  normal  0.959704 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3089  transcriptional regulator, IclR family  23.27 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3031  transcriptional regulator, IclR family  22.58 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2785  IclR family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 249 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253598  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2715  IclR family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 249 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000240532  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5545  regulatory protein, IclR  28.57 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2514  IclR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 277 aa  62.4  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2997  IclR family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 249 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2147  transcriptional regulator, IclR family  23.27 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5397  transcriptional regulator, IclR family  25.11 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  23.14 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2995  transcriptional regulator, IclR family  22.18 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.71341e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3122  IclR family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.255406  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2997  transcriptional regulator, IclR family  21.77 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000293237  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4172  transcriptional regulator, IclR family  24.08 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102148  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2734  IclR family transcriptional regulator  22.18 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.16584e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4161  IclR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2883  IclR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0306717  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2850  IclR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526346  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3098  IclR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0903257  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0160  transcriptional regulator, IclR family  25.67 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3103  transcriptional regulator, IclR family  23.27 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3033  IclR family transcriptional regulator  22.18 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000487376  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2248  transcriptional regulator, IclR family  21.77 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.000278056 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3121  transcriptional regulator, IclR family  24.08 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5543  regulatory protein, IclR  25.87 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.452687  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0373  IclR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6032  IclR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2811  IclR family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.667309  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4413  transcriptional regulator, IclR family  27.94 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1265  IclR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 280 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38230  Transcriptional regulator PcaR  25.51 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1955  putative transcriptional regulator  25.49 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0587  transcriptional regulator, IclR family  24.11 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0391803 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1795  IclR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0248874  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1991  regulatory proteins, IclR  25 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0527624  normal  0.0427076 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001509  transcriptional regulator  21.92 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  23.43 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0222  Transcriptional regulator IclR  22.71 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.300165  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2181  transcriptional regulator, IclR family  24.89 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169308  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1595  IclR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23190  putative transcriptional regulator  24.71 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144138 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2149  IclR family transcriptional regulator, putative  23.17 
 
 		 248 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1836  transcriptional regulator, IclR family  29.89 
 
 		 274 aa  55.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0146542 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1830  transcriptional regulator, IclR family  27.49 
 
 		 264 aa  55.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135773  normal  0.345416 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3551  IclR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 267 aa  55.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780381  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3826  transcriptional regulator, IclR family  23.86 
 
 		 278 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2874  transcriptional regulator, IclR family  24.18 
 
 		 267 aa  55.1  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3639  IclR family transcriptional regulator family  22.68 
 
 		 303 aa  55.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0190  IclR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 241 aa  55.1  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.49367  normal  0.390724 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  28.5 
 
 		 249 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5560  IclR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 294 aa  54.3  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.15712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3846  transcriptional regulator, IclR family  25.64 
 
 		 269 aa  54.3  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2051  IclR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 249 aa  53.9  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0630504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4409  transcriptional regulator, IclR family  26.54 
 
 		 249 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4000  regulatory proteins, IclR  23.94 
 
 		 294 aa  53.5  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  25.18 
 
 		 262 aa  53.5  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0198  Transcriptional regulator IclR  25.13 
 
 		 265 aa  53.5  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101079  normal  0.134776 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1595  IclR-type transcriptional regulator  26.6 
 
 		 266 aa  53.5  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  23.46 
 
 		 255 aa  53.5  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05447  hypothetical protein  20.55 
 
 		 244 aa  53.1  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0951  IclR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 268 aa  53.1  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0378  IclR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 263 aa  53.1  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.105767  normal  0.274067 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2810  IclR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 247 aa  52.8  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.162852  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2063  transcriptional regulator IclR  24.73 
 
 		 255 aa  52.8  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0428372  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4374  transcriptional regulator, IclR family  25 
 
 		 250 aa  53.1  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4095  IclR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 269 aa  52.8  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129203  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3476  IclR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 261 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1123  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  24.24 
 
 		 258 aa  52.8  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0492  IclR family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 302 aa  52.8  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1015  IclR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 291 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  hitchhiker  0.00000271522 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  26.32 
 
 		 278 aa  52.4  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4617  IclR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 242 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2380  IclR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 291 aa  52.4  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.610686  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2803  IclR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 241 aa  52  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.323912 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4310  Pca regulon regulatory protein PcaR  23.08 
 
 		 280 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 260 aa  51.6  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0105  putative transcriptional regulator  22.22 
 
 		 244 aa  51.6  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>