More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3441 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3441  regulatory proteins, IclR  100 
 
 		 260 aa  515  1.0000000000000001e-145  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0615  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  75.97 
 
 		 261 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5810  IclR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 286 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3613  IclR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 317 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7431  Transcriptional regulator  37.13 
 
 		 257 aa  142  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3331  IclR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 284 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.181508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6719  IclR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 242 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.182238  normal  0.45322 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6484  IclR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 242 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140944  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3795  IclR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433741 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0340  IclR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 272 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.151352  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0473  regulatory protein IclR  26.79 
 
 		 244 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0993  IclR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 251 aa  105  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.892724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5598  Transcriptional regulator  32.75 
 
 		 246 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0201808  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2799  transcriptional regulator, IclR family  30.61 
 
 		 256 aa  92.8  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05447  hypothetical protein  27.04 
 
 		 244 aa  92.4  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2392  transcriptional regulator, IclR family  30.2 
 
 		 256 aa  91.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6466  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 266 aa  90.1  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185933  normal  0.684135 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001509  transcriptional regulator  26.81 
 
 		 244 aa  86.3  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23190  putative transcriptional regulator  29.67 
 
 		 242 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144138 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4161  IclR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0105  putative transcriptional regulator  26.61 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1955  putative transcriptional regulator  32.39 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1041  IclR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0399426 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1595  IclR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 264 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0160  transcriptional regulator, IclR family  28.9 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3303  IclR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.870247  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2078  transcriptional regulator, IclR family  29.27 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.341471 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2824  transcriptional regulator, IclR family  29.91 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00611258  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0587  transcriptional regulator, IclR family  28.85 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0391803 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4402  regulatory proteins, IclR  27.93 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0492  IclR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 302 aa  68.9  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2778  IclR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 253 aa  68.6  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0655324  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  26.53 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1583  IclR-type transcriptional regulator  29.61 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0373  IclR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  25 
 
 		 255 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1684  transcriptional regulator, IclR family  27.09 
 
 		 283 aa  67  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0925752  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2380  IclR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.610686  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3214  transcriptional regulator, IclR family  29.76 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3839  IclR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5545  regulatory protein, IclR  28.45 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2316  IclR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812394  normal  0.959704 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3754  regulatory protein, IclR  27.55 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3169  transcriptional regulator, IclR family  23.83 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0190  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 241 aa  62  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.49367  normal  0.390724 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4506  transcriptional regulator, IclR family  23.97 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4638  transcriptional regulator, IclR family  23.97 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214771  normal  0.0505557 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2051  IclR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0630504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  27.83 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4223  regulatory protein, IclR  37.86 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.918168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6032  IclR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4215  regulatory proteins, IclR  26.24 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1966  regulatory proteins, IclR  31.63 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1900  regulatory proteins, IclR  31.63 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.417398 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1920  IclR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245854  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4564  IclR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  hitchhiker  0.000704701 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3846  transcriptional regulator, IclR family  28.93 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1993  IclR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.080856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1440  regulatory protein IclR  27.17 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21696  hitchhiker  0.00000381695 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  22.5 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  24.39 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1905  IclR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1130  transcriptional regulator, IclR family  27.57 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1109  IclR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0131457  normal  0.23204 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4705  IclR family transcriptional regulator  22.69 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0690054  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3662  IclR family transcriptional regulator  22.69 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115277  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5595  IclR family transcriptional regulator  22.69 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.328221 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  23.43 
 
 		 319 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0681  regulatory proteins, IclR  27.23 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7080  Transcriptional regulator  27.43 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2149  IclR family transcriptional regulator, putative  22.5 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  27.12 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5543  regulatory protein, IclR  30.66 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.452687  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3974  transcriptional regulator, IclR family  25.75 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.482822  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2850  IclR family transcriptional regulator  22.08 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2811  IclR family transcriptional regulator  22.5 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.667309  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3826  transcriptional regulator, IclR family  26.73 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2270  transcriptional regulator, IclR family  33.09 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4409  transcriptional regulator, IclR family  24.14 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4099  IclR family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.313873 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2399  regulatory protein, IclR  29.72 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3080  transcriptional regulator, IclR family  26.29 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3121  transcriptional regulator, IclR family  22.08 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4172  transcriptional regulator, IclR family  25.7 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102148  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1072  IclR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0478344  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2181  transcriptional regulator, IclR family  27.85 
 
 		 269 aa  57  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169308  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1332  IclR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0976  IclR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41754  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3103  transcriptional regulator, IclR family  22.08 
 
 		 250 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3296  IclR family transcriptional regulator  27 
 
 		 250 aa  57  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>