More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3303 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3303  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 244 aa  489  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.870247  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6466  transcriptional regulator, IclR family  31.31 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185933  normal  0.684135 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2778  IclR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 253 aa  82.8  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0655324  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0113  IclR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 277 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3441  regulatory proteins, IclR  27.85 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18570  transcriptional regulator, IclR family  33.18 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.424296  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3279  putative transcriptional regulator  31.98 
 
 		 267 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0302  transcription regulator protein  31.84 
 
 		 295 aa  78.6  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2381  IclR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 279 aa  78.6  0.00000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0082  IclR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0163  transcriptional regulator, IclR family  32.37 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0156  transcriptional regulator, IclR family  32.37 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5545  regulatory protein, IclR  24.58 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  24.79 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4052  IclR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000104088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  25.62 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0222  Transcriptional regulator IclR  28.11 
 
 		 267 aa  75.9  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.300165  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0909  IclR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4606  IclR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0481261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0448  IclR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 262 aa  75.5  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4622  IclR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 277 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4482  IclR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 277 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0581  IclR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0816  IclR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3360  IclR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233757  normal  0.0607813 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2358  transcriptional regulator, IclR family  35.18 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0154  transcriptional regulator, IclR family  30.73 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.351671 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0161  transcriptional regulator, IclR family  29.76 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.567451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0615  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27 
 
 		 261 aa  72  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0480  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  25.69 
 
 		 261 aa  72  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0382  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  25.69 
 
 		 261 aa  72  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4095  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 269 aa  72  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129203  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2127  IclR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 285 aa  72  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0439  transcriptional regulator, IclR family  29.96 
 
 		 262 aa  72  0.000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.545927  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4674  putative transcriptional regulatory protein  26.36 
 
 		 263 aa  72  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0797  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  25.69 
 
 		 261 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2114  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  25.69 
 
 		 261 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.247685  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1491  IclR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1811  IclR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3795  IclR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 247 aa  71.6  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433741 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5247  IclR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38500  IclR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1686  transcriptional regulator, IclR family  32.12 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.698509  normal  0.0109367 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  25.74 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2803  IclR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.323912 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4718  IclR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11090  transcriptional regulator, IclR family  31.61 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1381  transcriptional regulator, IclR family  33.85 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  26.43 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3492  regulatory proteins, IclR  29.27 
 
 		 258 aa  68.9  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4901  IclR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0262  IclR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  26.79 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5369  IclR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0293  transcriptional regulator, IclR family  26.19 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2849  transcriptional regulator, IclR family  32.54 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4784  transcriptional regulator, IclR family  28.4 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.820047  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3717  IclR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 259 aa  68.2  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0598808 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2997  IclR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3768  IclR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0804  regulatory proteins, IclR  27.59 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000542062  unclonable  0.0000000637978 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3299  regulatory proteins, IclR  32.23 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395884  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1966  regulatory proteins, IclR  30.11 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  23.87 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1900  regulatory proteins, IclR  30.11 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.417398 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4533  IclR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000115279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4298  IclR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1920  IclR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245854  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  24.88 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8019  putative transcriptional regulator, IclR  33.82 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4053  IclR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 269 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0738351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3216  Transcriptional regulator IclR  31.02 
 
 		 244 aa  67  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15602  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01745  transcription regulator protein  31.75 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.264626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20720  transcriptional regulator  29.2 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.439734  normal  0.149667 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5933  transcriptional regulator, IclR family  26.39 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.196761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  29.58 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1357  Transcriptional regulator IclR  32.57 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.775388 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1148  IclR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.554824  unclonable  0.0000000376636 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1239  IclR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2134  regulatory proteins, IclR  31.87 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3464  transcriptional regulator, IclR family  31.02 
 
 		 239 aa  65.9  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108588  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4659  transcriptional regulator, IclR family  30.3 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880576  normal  0.215321 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4527  transcriptional regulator, IclR family  30.3 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0675359  normal  0.540679 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2257  transcriptional regulator, IclR family  30.26 
 
 		 239 aa  65.9  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000173115 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2317  transcriptional regulator, IclR family  32.42 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1572  transcriptional regulator, IclR family  31.87 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.358394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4228  regulatory protein, IclR  31.69 
 
 		 233 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2718  transcriptional regulator, IclR family  26.99 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  25.91 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2520  IclR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.463274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>