More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0581 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0581  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 297 aa  592  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0293  transcriptional regulator, IclR family  51.65 
 
 		 287 aa  255  6e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4298  IclR family transcriptional regulator  53.2 
 
 		 279 aa  246  4e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0848  transcriptional regulator, IclR family  47.25 
 
 		 275 aa  207  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.130407  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4674  putative transcriptional regulatory protein  47.06 
 
 		 263 aa  206  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0804  regulatory proteins, IclR  38.67 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000542062  unclonable  0.0000000637978 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0448  IclR family transcriptional regulator  43.03 
 
 		 262 aa  168  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1125  IclR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1712  IclR family transcriptional regulator  39.54 
 
 		 549 aa  166  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3720  IclR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 554 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.261625 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2962  IclR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2825  IclR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 291 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.619636 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0361  IclR family transcriptional regulator  41.34 
 
 		 340 aa  162  6e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0437  IclR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 317 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0599  IclR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 315 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1348  IclR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 317 aa  162  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.102339  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3215  IclR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 317 aa  162  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0417  IclR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 308 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0246  IclR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 317 aa  162  7e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0302  transcription regulator protein  39.62 
 
 		 295 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0078  IclR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 315 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.493125  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0439  transcriptional regulator, IclR family  41.9 
 
 		 262 aa  162  9e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.545927  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4196  IclR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 576 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.858157  normal  0.133552 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4064  IclR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 551 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4302  IclR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 551 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.750126 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0391  IclR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 288 aa  160  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797378  normal  0.0181315 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0161  transcriptional regulator, IclR family  38.97 
 
 		 290 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.567451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0154  transcriptional regulator, IclR family  38.97 
 
 		 292 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.351671 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3216  IclR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 547 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4304  IclR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 569 aa  157  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.443184 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4236  IclR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.375859 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2928  IclR family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 288 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2299  IclR family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 288 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2913  IclR family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 290 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.464233  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6256  IclR family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 288 aa  156  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0481  transcriptional regulator, IclR family  37.32 
 
 		 300 aa  156  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4215  IclR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 279 aa  155  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0113  IclR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 277 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4052  IclR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000104088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0082  IclR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 285 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0195  IclR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 296 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0300  transcription regulator protein  38.75 
 
 		 290 aa  149  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.9672 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0741  IclR family transcriptional regulator  42.69 
 
 		 260 aa  148  9e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0425  IclR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000742162  normal  0.768795 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1516  transcriptional regulator, IclR family  37.94 
 
 		 271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.371505  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0384  IclR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 265 aa  146  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0235844  hitchhiker  0.00703834 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4527  transcriptional regulator, IclR family  38.32 
 
 		 295 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0675359  normal  0.540679 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4659  transcriptional regulator, IclR family  38.32 
 
 		 295 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880576  normal  0.215321 
 
 
-
 
NC_003296  RS01745  transcription regulator protein  37.78 
 
 		 311 aa  146  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.264626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0445  IclR family transcriptional regulator  44.31 
 
 		 287 aa  145  6e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.915056 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4053  IclR family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 269 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0738351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0163  transcriptional regulator, IclR family  36.75 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0336  IclR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 268 aa  142  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0156  transcriptional regulator, IclR family  37.74 
 
 		 302 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7212  transcriptional regulator, IclR family  37.68 
 
 		 295 aa  142  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.858542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4533  IclR family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 276 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000115279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3394  regulatory protein, IclR  37.39 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101533  normal  0.0303831 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4482  IclR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 277 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4622  IclR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 277 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1458  transcriptional regulator, IclR family  34.1 
 
 		 262 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3279  putative transcriptional regulator  34.94 
 
 		 267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38500  IclR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 267 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4216  IclR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 264 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0909  IclR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 264 aa  129  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0816  IclR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 260 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7213  transcriptional regulator, IclR family  36.54 
 
 		 295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.33644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4606  IclR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 262 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0481261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0337  IclR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3552  transcriptional regulator, IclR family  32.54 
 
 		 263 aa  122  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5959  IclR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 271 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0527246 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3598  transcriptional regulator, IclR family  34.27 
 
 		 273 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5276  regulatory protein, IclR  34.87 
 
 		 271 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.945753  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2311  IclR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.986469  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4742  regulatory proteins, IclR  31.67 
 
 		 281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3327  regulatory proteins, IclR  31.75 
 
 		 263 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736955 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0689  IclR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 274 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.933931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4086  regulatory protein IclR  31.25 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.406824  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0724  IclR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 303 aa  110  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.778685  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3632  putative transcription regulator protein  37.3 
 
 		 274 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.266279 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3889  IclR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 268 aa  109  7.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0628146  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1802  IclR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 285 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4930  putative IclR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.622933 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10190  putative transcriptional regulator  32.38 
 
 		 262 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.413507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1632  transcriptional regulator, IclR family  32.58 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3148  IclR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 263 aa  99.8  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174875  hitchhiker  0.0000000981116 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0169  regulatory proteins, IclR  30.34 
 
 		 275 aa  98.2  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0735  regulatory protein, IclR  29.73 
 
 		 277 aa  94  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000567454 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0426  IclR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 289 aa  93.6  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000895626  normal  0.732187 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3528  regulatory proteins, IclR  29.47 
 
 		 265 aa  92.4  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1560  regulatory proteins, IclR  30.37 
 
 		 286 aa  89  9e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  26.83 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1109  IclR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 108 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2258  transcriptional regulator, IclR family  26.82 
 
 		 280 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  25.81 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03426  predicted DNA-binding transcriptional repressor  29.96 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3303  IclR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.870247  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03377  hypothetical protein  29.96 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  30.12 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3778  IclR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3897  IclR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 282 aa  72.4  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>