More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0154 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0154  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 292 aa  590  1e-168  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.351671 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0161  transcriptional regulator, IclR family  94.83 
 
 		 290 aa  537  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.567451  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0300  transcription regulator protein  81.85 
 
 		 290 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.9672 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0113  IclR family transcriptional regulator  65.79 
 
 		 277 aa  347  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0082  IclR family transcriptional regulator  63.88 
 
 		 285 aa  330  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2962  IclR family transcriptional regulator  56.82 
 
 		 291 aa  288  7e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2825  IclR family transcriptional regulator  56.44 
 
 		 291 aa  286  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.619636 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0437  IclR family transcriptional regulator  57.53 
 
 		 317 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0246  IclR family transcriptional regulator  57.53 
 
 		 317 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0417  IclR family transcriptional regulator  57.53 
 
 		 308 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0078  IclR family transcriptional regulator  57.53 
 
 		 315 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.493125  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0599  IclR family transcriptional regulator  57.53 
 
 		 315 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3215  IclR family transcriptional regulator  57.53 
 
 		 317 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1348  IclR family transcriptional regulator  57.53 
 
 		 317 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.102339  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6256  IclR family transcriptional regulator  54.61 
 
 		 288 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2299  IclR family transcriptional regulator  54.61 
 
 		 288 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2928  IclR family transcriptional regulator  54.61 
 
 		 288 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2913  IclR family transcriptional regulator  54.61 
 
 		 290 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.464233  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0361  IclR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 340 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0195  IclR family transcriptional regulator  54.84 
 
 		 296 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0391  IclR family transcriptional regulator  54.48 
 
 		 288 aa  279  4e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797378  normal  0.0181315 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4236  IclR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 299 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.375859 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0481  transcriptional regulator, IclR family  51.25 
 
 		 300 aa  267  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4527  transcriptional regulator, IclR family  53.15 
 
 		 295 aa  263  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0675359  normal  0.540679 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4659  transcriptional regulator, IclR family  53.15 
 
 		 295 aa  263  3e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880576  normal  0.215321 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0448  IclR family transcriptional regulator  53.64 
 
 		 262 aa  259  3e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01745  transcription regulator protein  50.87 
 
 		 311 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.264626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1125  IclR family transcriptional regulator  53.64 
 
 		 259 aa  258  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0439  transcriptional regulator, IclR family  53.26 
 
 		 262 aa  251  9.000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.545927  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0741  IclR family transcriptional regulator  52.9 
 
 		 260 aa  236  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4674  putative transcriptional regulatory protein  47.47 
 
 		 263 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0445  IclR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 287 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.915056 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0804  regulatory proteins, IclR  43.89 
 
 		 266 aa  212  5.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000542062  unclonable  0.0000000637978 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0293  transcriptional regulator, IclR family  43.33 
 
 		 287 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0848  transcriptional regulator, IclR family  44.81 
 
 		 275 aa  195  8.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.130407  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4298  IclR family transcriptional regulator  43.58 
 
 		 279 aa  194  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4533  IclR family transcriptional regulator  41.97 
 
 		 276 aa  192  5e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000115279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1516  transcriptional regulator, IclR family  40.75 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.371505  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0384  IclR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 265 aa  177  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0235844  hitchhiker  0.00703834 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4052  IclR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 281 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000104088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0909  IclR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 264 aa  169  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0163  transcriptional regulator, IclR family  38.52 
 
 		 302 aa  166  5e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0302  transcription regulator protein  39.23 
 
 		 295 aa  163  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0156  transcriptional regulator, IclR family  37.81 
 
 		 302 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3632  putative transcription regulator protein  44.03 
 
 		 274 aa  163  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.266279 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0581  IclR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 297 aa  162  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1712  IclR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 549 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3720  IclR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 554 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.261625 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4482  IclR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 277 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4304  IclR family transcriptional regulator  39.54 
 
 		 569 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.443184 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5959  IclR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 271 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0527246 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4196  IclR family transcriptional regulator  39 
 
 		 576 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.858157  normal  0.133552 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4302  IclR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 551 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.750126 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4064  IclR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 551 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4622  IclR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 277 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3216  IclR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 547 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0425  IclR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000742162  normal  0.768795 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7212  transcriptional regulator, IclR family  35.23 
 
 		 295 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.858542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3598  transcriptional regulator, IclR family  37.64 
 
 		 273 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5276  regulatory protein, IclR  40.68 
 
 		 271 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.945753  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4053  IclR family transcriptional regulator  37.26 
 
 		 269 aa  149  8e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0738351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3279  putative transcriptional regulator  34.46 
 
 		 267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0169  regulatory proteins, IclR  36.4 
 
 		 275 aa  146  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4216  IclR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 264 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0816  IclR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0336  IclR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 268 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4930  putative IclR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 271 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.622933 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4215  IclR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 279 aa  143  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38500  IclR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 267 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0735  regulatory protein, IclR  33.64 
 
 		 277 aa  142  5e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000567454 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4606  IclR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 262 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0481261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7213  transcriptional regulator, IclR family  37.16 
 
 		 295 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.33644  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3552  transcriptional regulator, IclR family  34.08 
 
 		 263 aa  139  6e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1560  regulatory proteins, IclR  33.47 
 
 		 286 aa  132  6e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0689  IclR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.933931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1458  transcriptional regulator, IclR family  30.57 
 
 		 262 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4742  regulatory proteins, IclR  32.48 
 
 		 281 aa  127  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3394  regulatory protein, IclR  36.24 
 
 		 265 aa  127  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101533  normal  0.0303831 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3327  regulatory proteins, IclR  32.35 
 
 		 263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736955 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1632  transcriptional regulator, IclR family  36.55 
 
 		 297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3889  IclR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 268 aa  124  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0628146  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2311  IclR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 262 aa  122  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.986469  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0724  IclR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.778685  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3528  regulatory proteins, IclR  30.49 
 
 		 265 aa  116  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0337  IclR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 261 aa  116  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10190  putative transcriptional regulator  31.67 
 
 		 262 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.413507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1802  IclR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0426  IclR family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000895626  normal  0.732187 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3148  IclR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 263 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174875  hitchhiker  0.0000000981116 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4086  regulatory protein IclR  30.36 
 
 		 291 aa  106  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.406824  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2258  transcriptional regulator, IclR family  23.46 
 
 		 280 aa  86.3  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3303  IclR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 244 aa  82  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.870247  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4574  IclR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 289 aa  79.7  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0696248  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1109  IclR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 108 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5288  regulatory protein, IclR  26.2 
 
 		 278 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.497587 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3687  transcriptional regulator, IclR family  24.82 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3884  transcriptional regulator, IclR family  24.91 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  23.48 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  23.83 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>