More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4304 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_4304  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 569 aa  1106    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.443184 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1712  IclR family transcriptional regulator  88.2 
 
 		 549 aa  891    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3216  IclR family transcriptional regulator  88.55 
 
 		 547 aa  877    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4196  IclR family transcriptional regulator  87.5 
 
 		 576 aa  893    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.858157  normal  0.133552 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4064  IclR family transcriptional regulator  87.48 
 
 		 551 aa  895    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3720  IclR family transcriptional regulator  88.73 
 
 		 554 aa  889    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.261625 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4302  IclR family transcriptional regulator  87.48 
 
 		 551 aa  895    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.750126 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4053  IclR family transcriptional regulator  67.45 
 
 		 269 aa  307  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0738351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0425  IclR family transcriptional regulator  60.76 
 
 		 296 aa  293  5e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000742162  normal  0.768795 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4215  IclR family transcriptional regulator  61.89 
 
 		 279 aa  289  8e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7212  transcriptional regulator, IclR family  61.35 
 
 		 295 aa  288  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.858542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4052  IclR family transcriptional regulator  58.87 
 
 		 281 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000104088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0336  IclR family transcriptional regulator  61.83 
 
 		 268 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7213  transcriptional regulator, IclR family  58.55 
 
 		 295 aa  270  7e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.33644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4216  IclR family transcriptional regulator  53.58 
 
 		 264 aa  244  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0337  IclR family transcriptional regulator  54.22 
 
 		 261 aa  219  7e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0426  IclR family transcriptional regulator  60.74 
 
 		 289 aa  209  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000895626  normal  0.732187 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4674  putative transcriptional regulatory protein  43.8 
 
 		 263 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0293  transcriptional regulator, IclR family  41.7 
 
 		 287 aa  184  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4298  IclR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 279 aa  182  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0848  transcriptional regulator, IclR family  42.02 
 
 		 275 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.130407  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0448  IclR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 262 aa  174  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0439  transcriptional regulator, IclR family  44.23 
 
 		 262 aa  168  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.545927  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0581  IclR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 297 aa  162  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0113  IclR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 277 aa  162  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4533  IclR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 276 aa  160  5e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000115279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0082  IclR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 285 aa  157  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0195  IclR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 296 aa  156  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0741  IclR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 260 aa  154  5.9999999999999996e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1125  IclR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 259 aa  153  8.999999999999999e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0154  transcriptional regulator, IclR family  39.27 
 
 		 292 aa  152  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.351671 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0445  IclR family transcriptional regulator  43.61 
 
 		 287 aa  151  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.915056 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0161  transcriptional regulator, IclR family  38.52 
 
 		 290 aa  150  6e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.567451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0804  regulatory proteins, IclR  36.82 
 
 		 266 aa  143  8e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000542062  unclonable  0.0000000637978 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6256  IclR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 288 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2928  IclR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 288 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2299  IclR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 288 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2825  IclR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 291 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.619636 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2913  IclR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 290 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.464233  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2962  IclR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 291 aa  140  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4236  IclR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 299 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.375859 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0300  transcription regulator protein  40.91 
 
 		 290 aa  139  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.9672 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0391  IclR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 288 aa  139  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797378  normal  0.0181315 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0481  transcriptional regulator, IclR family  35 
 
 		 300 aa  139  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0078  IclR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 315 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.493125  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0599  IclR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 315 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0417  IclR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 308 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1348  IclR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 317 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.102339  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0437  IclR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 317 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3215  IclR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 317 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0246  IclR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 317 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0361  IclR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 340 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01745  transcription regulator protein  36.84 
 
 		 311 aa  130  8.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.264626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4527  transcriptional regulator, IclR family  36.4 
 
 		 295 aa  127  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0675359  normal  0.540679 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4659  transcriptional regulator, IclR family  36.4 
 
 		 295 aa  127  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880576  normal  0.215321 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1516  transcriptional regulator, IclR family  33.46 
 
 		 271 aa  123  9e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.371505  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3598  transcriptional regulator, IclR family  34.39 
 
 		 273 aa  122  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0384  IclR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 265 aa  122  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0235844  hitchhiker  0.00703834 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1458  transcriptional regulator, IclR family  32.06 
 
 		 262 aa  121  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5959  IclR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 271 aa  120  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0527246 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0156  transcriptional regulator, IclR family  34.07 
 
 		 302 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4930  putative IclR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 271 aa  117  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.622933 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0302  transcription regulator protein  34.75 
 
 		 295 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0163  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 302 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5276  regulatory protein, IclR  35.02 
 
 		 271 aa  114  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.945753  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3632  putative transcription regulator protein  40.08 
 
 		 274 aa  113  9e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.266279 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0724  IclR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 303 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.778685  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0689  IclR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 274 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.933931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3279  putative transcriptional regulator  32.42 
 
 		 267 aa  104  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38500  IclR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 267 aa  104  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3889  IclR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 268 aa  102  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0628146  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2311  IclR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 262 aa  99.4  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.986469  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1632  transcriptional regulator, IclR family  36.24 
 
 		 297 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3394  regulatory protein, IclR  33.33 
 
 		 265 aa  95.1  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101533  normal  0.0303831 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0909  IclR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 264 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4622  IclR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 277 aa  90.1  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4742  regulatory proteins, IclR  28.09 
 
 		 281 aa  90.1  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0169  regulatory proteins, IclR  29.96 
 
 		 275 aa  89.4  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4482  IclR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 277 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3528  regulatory proteins, IclR  31.05 
 
 		 265 aa  87  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2258  transcriptional regulator, IclR family  24.65 
 
 		 280 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10190  putative transcriptional regulator  30.93 
 
 		 262 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.413507  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3552  transcriptional regulator, IclR family  27.48 
 
 		 263 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4086  regulatory protein IclR  29.57 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.406824  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4606  IclR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 262 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0481261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0735  regulatory protein, IclR  25.91 
 
 		 277 aa  81.6  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000567454 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0816  IclR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1802  IclR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 285 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3148  IclR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 263 aa  80.1  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174875  hitchhiker  0.0000000981116 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3327  regulatory proteins, IclR  27.95 
 
 		 263 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736955 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1109  IclR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 108 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3479  regulatory proteins, IclR  26.67 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0476526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1087  transcriptional regulator, IclR family  27.17 
 
 		 258 aa  71.2  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  23.08 
 
 		 254 aa  68.9  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0050  IclR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 257 aa  68.9  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2380  IclR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 291 aa  68.9  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.610686  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 268 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  28.73 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 269 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  28.76 
 
 		 247 aa  66.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>