More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3720 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_4304  IclR family transcriptional regulator  88.55 
 
 		 569 aa  862    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.443184 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4196  IclR family transcriptional regulator  98.18 
 
 		 576 aa  1044    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.858157  normal  0.133552 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4302  IclR family transcriptional regulator  89.11 
 
 		 551 aa  918    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.750126 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3216  IclR family transcriptional regulator  89.11 
 
 		 547 aa  891    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1712  IclR family transcriptional regulator  90.74 
 
 		 549 aa  930    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4064  IclR family transcriptional regulator  89.11 
 
 		 551 aa  918    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3720  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 554 aa  1073    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.261625 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4053  IclR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 269 aa  298  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0738351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4052  IclR family transcriptional regulator  60 
 
 		 281 aa  292  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000104088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4215  IclR family transcriptional regulator  62.36 
 
 		 279 aa  291  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0336  IclR family transcriptional regulator  61.3 
 
 		 268 aa  288  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0425  IclR family transcriptional regulator  60 
 
 		 296 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000742162  normal  0.768795 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7212  transcriptional regulator, IclR family  60.64 
 
 		 295 aa  281  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.858542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7213  transcriptional regulator, IclR family  62.26 
 
 		 295 aa  278  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.33644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4216  IclR family transcriptional regulator  55.86 
 
 		 264 aa  249  9e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0426  IclR family transcriptional regulator  64.73 
 
 		 289 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000895626  normal  0.732187 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0337  IclR family transcriptional regulator  54.44 
 
 		 261 aa  219  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4674  putative transcriptional regulatory protein  44.02 
 
 		 263 aa  190  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4298  IclR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 279 aa  183  6e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0293  transcriptional regulator, IclR family  41.28 
 
 		 287 aa  180  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0848  transcriptional regulator, IclR family  43.37 
 
 		 275 aa  173  6.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.130407  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0448  IclR family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 262 aa  173  7.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0439  transcriptional regulator, IclR family  45.28 
 
 		 262 aa  170  6e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.545927  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0581  IclR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 297 aa  166  8e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4533  IclR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 276 aa  160  5e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000115279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0195  IclR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 296 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0445  IclR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 287 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.915056 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1125  IclR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 259 aa  148  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0741  IclR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 260 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0113  IclR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 277 aa  148  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0154  transcriptional regulator, IclR family  39.39 
 
 		 292 aa  147  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.351671 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0804  regulatory proteins, IclR  35.25 
 
 		 266 aa  144  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000542062  unclonable  0.0000000637978 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0082  IclR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 285 aa  144  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0161  transcriptional regulator, IclR family  38.64 
 
 		 290 aa  144  6e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.567451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4236  IclR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 299 aa  140  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.375859 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0481  transcriptional regulator, IclR family  35.27 
 
 		 300 aa  136  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2825  IclR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 291 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.619636 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2962  IclR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 291 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2928  IclR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 288 aa  134  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2913  IclR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 290 aa  134  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.464233  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2299  IclR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 288 aa  134  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6256  IclR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 288 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0361  IclR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0391  IclR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 288 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797378  normal  0.0181315 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0246  IclR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 317 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3215  IclR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 317 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1348  IclR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 317 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.102339  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0437  IclR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 317 aa  131  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0078  IclR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 315 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.493125  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0599  IclR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 315 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0417  IclR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 308 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0300  transcription regulator protein  40.38 
 
 		 290 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.9672 
 
 
-
 
NC_003296  RS01745  transcription regulator protein  38.11 
 
 		 311 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.264626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3598  transcriptional regulator, IclR family  36.29 
 
 		 273 aa  127  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4659  transcriptional regulator, IclR family  36.46 
 
 		 295 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880576  normal  0.215321 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4527  transcriptional regulator, IclR family  36.46 
 
 		 295 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0675359  normal  0.540679 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5959  IclR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 271 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0527246 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0724  IclR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 303 aa  120  9e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.778685  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0156  transcriptional regulator, IclR family  35.17 
 
 		 302 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0384  IclR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 265 aa  117  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0235844  hitchhiker  0.00703834 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1458  transcriptional regulator, IclR family  31.01 
 
 		 262 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0163  transcriptional regulator, IclR family  34.95 
 
 		 302 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1516  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 		 271 aa  114  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.371505  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3889  IclR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 268 aa  112  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0628146  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5276  regulatory protein, IclR  35.79 
 
 		 271 aa  109  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.945753  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0302  transcription regulator protein  34.26 
 
 		 295 aa  108  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4930  putative IclR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 271 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.622933 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3632  putative transcription regulator protein  41.3 
 
 		 274 aa  108  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.266279 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0689  IclR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 274 aa  102  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.933931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2311  IclR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 262 aa  100  8e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.986469  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38500  IclR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 267 aa  100  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3279  putative transcriptional regulator  31.5 
 
 		 267 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1632  transcriptional regulator, IclR family  37.28 
 
 		 297 aa  97.1  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10190  putative transcriptional regulator  31.56 
 
 		 262 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.413507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0909  IclR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 264 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3394  regulatory protein, IclR  31.5 
 
 		 265 aa  93.6  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101533  normal  0.0303831 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0169  regulatory proteins, IclR  29.92 
 
 		 275 aa  93.6  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4742  regulatory proteins, IclR  28.45 
 
 		 281 aa  93.2  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0735  regulatory protein, IclR  26.88 
 
 		 277 aa  90.5  8e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000567454 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3528  regulatory proteins, IclR  30.36 
 
 		 265 aa  89.4  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4622  IclR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 277 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3148  IclR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 263 aa  86.7  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174875  hitchhiker  0.0000000981116 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4086  regulatory protein IclR  29.58 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.406824  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4482  IclR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 277 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1802  IclR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 285 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4606  IclR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 262 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0481261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2258  transcriptional regulator, IclR family  26.14 
 
 		 280 aa  79  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3479  regulatory proteins, IclR  29.09 
 
 		 251 aa  79.3  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0476526  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3552  transcriptional regulator, IclR family  28.82 
 
 		 263 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0816  IclR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 260 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3327  regulatory proteins, IclR  27.51 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736955 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1109  IclR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 108 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1087  transcriptional regulator, IclR family  28.74 
 
 		 258 aa  71.6  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2838  IclR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 601 aa  68.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.469664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  21.85 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 269 aa  67  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 268 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 		 247 aa  66.6  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  28.75 
 
 		 266 aa  65.9  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1714  IclR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>