More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3279 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3279  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 267 aa  531  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38500  IclR family transcriptional regulator  97 
 
 		 267 aa  510  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0909  IclR family transcriptional regulator  77.36 
 
 		 264 aa  400  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4482  IclR family transcriptional regulator  74.81 
 
 		 277 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4622  IclR family transcriptional regulator  74.9 
 
 		 277 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4606  IclR family transcriptional regulator  76.63 
 
 		 262 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0481261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0816  IclR family transcriptional regulator  75.86 
 
 		 260 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3327  regulatory proteins, IclR  62.75 
 
 		 263 aa  294  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736955 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3552  transcriptional regulator, IclR family  60.56 
 
 		 263 aa  287  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0302  transcription regulator protein  40.16 
 
 		 295 aa  177  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0163  transcriptional regulator, IclR family  37.64 
 
 		 302 aa  169  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0156  transcriptional regulator, IclR family  37.64 
 
 		 302 aa  168  8e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0082  IclR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 285 aa  167  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0113  IclR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0384  IclR family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0235844  hitchhiker  0.00703834 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5276  regulatory protein, IclR  39.54 
 
 		 271 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.945753  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0448  IclR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4930  putative IclR family transcriptional regulator  41.02 
 
 		 271 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.622933 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3598  transcriptional regulator, IclR family  38.93 
 
 		 273 aa  161  9e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5959  IclR family transcriptional regulator  37.64 
 
 		 271 aa  160  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0527246 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4674  putative transcriptional regulatory protein  39.6 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1516  transcriptional regulator, IclR family  40.16 
 
 		 271 aa  154  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.371505  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0439  transcriptional regulator, IclR family  41.43 
 
 		 262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.545927  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0391  IclR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 288 aa  152  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797378  normal  0.0181315 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0804  regulatory proteins, IclR  34.9 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000542062  unclonable  0.0000000637978 
 
 
-
 
NC_003296  RS01745  transcription regulator protein  41.45 
 
 		 311 aa  148  8e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.264626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2825  IclR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.619636 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4527  transcriptional regulator, IclR family  40.49 
 
 		 295 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0675359  normal  0.540679 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4659  transcriptional regulator, IclR family  40.49 
 
 		 295 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880576  normal  0.215321 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0848  transcriptional regulator, IclR family  39.85 
 
 		 275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.130407  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2962  IclR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1125  IclR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0361  IclR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4236  IclR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 299 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.375859 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0724  IclR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 303 aa  145  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.778685  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2299  IclR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 288 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2928  IclR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 288 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2913  IclR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 290 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.464233  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6256  IclR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 288 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0195  IclR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 296 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0445  IclR family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.915056 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0078  IclR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 315 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.493125  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1348  IclR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 317 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.102339  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0246  IclR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 317 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0599  IclR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 315 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0417  IclR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 308 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0437  IclR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 317 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0741  IclR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3215  IclR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 317 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4298  IclR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 279 aa  142  4e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0154  transcriptional regulator, IclR family  34.46 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.351671 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0481  transcriptional regulator, IclR family  35.66 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0689  IclR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 274 aa  139  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.933931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1458  transcriptional regulator, IclR family  32.45 
 
 		 262 aa  138  7e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0161  transcriptional regulator, IclR family  34.08 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.567451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4742  regulatory proteins, IclR  34.13 
 
 		 281 aa  135  7.000000000000001e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0581  IclR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 297 aa  131  9e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0300  transcription regulator protein  35.34 
 
 		 290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.9672 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0293  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 287 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1632  transcriptional regulator, IclR family  38.99 
 
 		 297 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4533  IclR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 276 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000115279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0169  regulatory proteins, IclR  34.05 
 
 		 275 aa  120  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4052  IclR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 281 aa  116  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000104088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3148  IclR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 263 aa  113  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174875  hitchhiker  0.0000000981116 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  33.6 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3889  IclR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0628146  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4086  regulatory protein IclR  30.42 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.406824  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  28.81 
 
 		 275 aa  106  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3528  regulatory proteins, IclR  29.44 
 
 		 265 aa  106  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10190  putative transcriptional regulator  31.56 
 
 		 262 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.413507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2311  IclR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 262 aa  105  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.986469  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1802  IclR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3632  putative transcription regulator protein  36.6 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.266279 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0735  regulatory protein, IclR  29.15 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000567454 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4304  IclR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 569 aa  102  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.443184 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4196  IclR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 576 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.858157  normal  0.133552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6634  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 283 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0992864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4053  IclR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 269 aa  99  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0738351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3720  IclR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 554 aa  98.6  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.261625 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4215  IclR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 279 aa  98.2  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  26.67 
 
 		 257 aa  98.2  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1712  IclR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 549 aa  97.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 276 aa  96.7  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7213  transcriptional regulator, IclR family  33.74 
 
 		 295 aa  96.3  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.33644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7212  transcriptional regulator, IclR family  31.75 
 
 		 295 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.858542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4064  IclR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 551 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4302  IclR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 551 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.750126 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 272 aa  93.2  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 269 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0425  IclR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 296 aa  93.2  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000742162  normal  0.768795 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2258  transcriptional regulator, IclR family  30.28 
 
 		 280 aa  93.2  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  29.84 
 
 		 259 aa  92.8  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3216  IclR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 547 aa  92  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4095  IclR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 269 aa  92  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129203  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4216  IclR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 264 aa  90.1  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0336  IclR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 268 aa  89.7  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3394  regulatory protein, IclR  30.58 
 
 		 265 aa  89.7  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101533  normal  0.0303831 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  26.78 
 
 		 263 aa  89.4  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  26.86 
 
 		 263 aa  89  8e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 263 aa  88.2  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>