More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4742 on replicon NC_008760
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008760  Pnap_4742  regulatory proteins, IclR  100 
 
 		 281 aa  566  1e-160  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0082  IclR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0113  IclR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 277 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3279  putative transcriptional regulator  34.13 
 
 		 267 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0804  regulatory proteins, IclR  30.56 
 
 		 266 aa  135  9e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000542062  unclonable  0.0000000637978 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38500  IclR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 267 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1516  transcriptional regulator, IclR family  36.48 
 
 		 271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.371505  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4236  IclR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.375859 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4674  putative transcriptional regulatory protein  33.19 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0384  IclR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0235844  hitchhiker  0.00703834 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0481  transcriptional regulator, IclR family  29.52 
 
 		 300 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0741  IclR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0161  transcriptional regulator, IclR family  32.48 
 
 		 290 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.567451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4482  IclR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 277 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4622  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 277 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0909  IclR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 264 aa  126  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0154  transcriptional regulator, IclR family  32.48 
 
 		 292 aa  125  9e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.351671 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0448  IclR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 262 aa  124  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4606  IclR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 262 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0481261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0816  IclR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1125  IclR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 259 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0848  transcriptional regulator, IclR family  31.84 
 
 		 275 aa  123  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.130407  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4533  IclR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 276 aa  122  7e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000115279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3394  regulatory protein, IclR  33.91 
 
 		 265 aa  122  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101533  normal  0.0303831 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3552  transcriptional regulator, IclR family  32.55 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0195  IclR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 296 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2825  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 291 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.619636 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2928  IclR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 288 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2299  IclR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 288 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2913  IclR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 290 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.464233  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6256  IclR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 288 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2962  IclR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0391  IclR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 288 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797378  normal  0.0181315 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0439  transcriptional regulator, IclR family  34.32 
 
 		 262 aa  116  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.545927  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4298  IclR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 279 aa  115  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0293  transcriptional regulator, IclR family  30.54 
 
 		 287 aa  115  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01745  transcription regulator protein  31.68 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.264626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3598  transcriptional regulator, IclR family  31.76 
 
 		 273 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0078  IclR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.493125  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3215  IclR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 317 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0599  IclR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1348  IclR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 317 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.102339  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0417  IclR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0437  IclR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 317 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0246  IclR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 317 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4659  transcriptional regulator, IclR family  30.33 
 
 		 295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880576  normal  0.215321 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0581  IclR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4527  transcriptional regulator, IclR family  30.33 
 
 		 295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0675359  normal  0.540679 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4930  putative IclR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 271 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.622933 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0300  transcription regulator protein  31.82 
 
 		 290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.9672 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3327  regulatory proteins, IclR  31.78 
 
 		 263 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736955 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0361  IclR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 340 aa  110  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0445  IclR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 287 aa  108  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.915056 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0156  transcriptional regulator, IclR family  28.98 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0163  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 		 302 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5276  regulatory protein, IclR  32.34 
 
 		 271 aa  105  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.945753  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0302  transcription regulator protein  27.87 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1458  transcriptional regulator, IclR family  26.97 
 
 		 262 aa  97.4  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0735  regulatory protein, IclR  27.19 
 
 		 277 aa  97.1  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000567454 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2311  IclR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 262 aa  96.7  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.986469  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0689  IclR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 274 aa  95.9  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.933931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3632  putative transcription regulator protein  30.7 
 
 		 274 aa  95.1  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.266279 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1560  regulatory proteins, IclR  25.46 
 
 		 286 aa  95.5  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4052  IclR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 281 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000104088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3720  IclR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 554 aa  93.2  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.261625 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10190  putative transcriptional regulator  28.9 
 
 		 262 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.413507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3148  IclR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 263 aa  92.8  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174875  hitchhiker  0.0000000981116 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4196  IclR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 576 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.858157  normal  0.133552 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1712  IclR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 549 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1802  IclR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 285 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3889  IclR family transcriptional regulator  24.15 
 
 		 268 aa  88.2  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0628146  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0169  regulatory proteins, IclR  26.43 
 
 		 275 aa  88.2  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0724  IclR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 303 aa  87.8  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.778685  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4086  regulatory protein IclR  27.07 
 
 		 291 aa  87  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.406824  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4304  IclR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 569 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.443184 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4064  IclR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 551 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4302  IclR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 551 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.750126 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3216  IclR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 547 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5959  IclR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 271 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0527246 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 262 aa  81.3  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7213  transcriptional regulator, IclR family  28.15 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.33644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1632  transcriptional regulator, IclR family  28.52 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3528  regulatory proteins, IclR  25 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4216  IclR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 264 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4053  IclR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0738351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7212  transcriptional regulator, IclR family  25.68 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.858542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  28.38 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  24.58 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0381  IclR family transcriptional regulator  23.87 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4215  IclR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0425  IclR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000742162  normal  0.768795 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  23.75 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00456  DNA-binding transcriptional repressor  25.41 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.832726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3106  transcriptional regulator, IclR family  25.41 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00461  hypothetical protein  25.41 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0580  DNA-binding transcriptional repressor AllR  25.41 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3116  DNA-binding transcriptional repressor AllR  25.41 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.129581 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0543  DNA-binding transcriptional repressor AllR  25.41 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>