294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3216 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3216  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 547 aa  1060    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1712  IclR family transcriptional regulator  90.38 
 
 		 549 aa  920    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4304  IclR family transcriptional regulator  88.16 
 
 		 569 aa  864    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.443184 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4302  IclR family transcriptional regulator  96.19 
 
 		 551 aa  1001    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.750126 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4196  IclR family transcriptional regulator  88.73 
 
 		 576 aa  894    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.858157  normal  0.133552 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4064  IclR family transcriptional regulator  96.19 
 
 		 551 aa  1001    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3720  IclR family transcriptional regulator  89.11 
 
 		 554 aa  896    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.261625 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0425  IclR family transcriptional regulator  61.38 
 
 		 296 aa  297  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000742162  normal  0.768795 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4053  IclR family transcriptional regulator  65.88 
 
 		 269 aa  296  8e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0738351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7212  transcriptional regulator, IclR family  61.54 
 
 		 295 aa  292  9e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.858542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4215  IclR family transcriptional regulator  60.9 
 
 		 279 aa  290  4e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0336  IclR family transcriptional regulator  62.07 
 
 		 268 aa  287  4e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4052  IclR family transcriptional regulator  59.07 
 
 		 281 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000104088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7213  transcriptional regulator, IclR family  60.23 
 
 		 295 aa  269  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.33644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4216  IclR family transcriptional regulator  56.03 
 
 		 264 aa  249  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0337  IclR family transcriptional regulator  54.84 
 
 		 261 aa  221  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0426  IclR family transcriptional regulator  61.13 
 
 		 289 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000895626  normal  0.732187 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4674  putative transcriptional regulatory protein  42.02 
 
 		 263 aa  179  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0293  transcriptional regulator, IclR family  39.93 
 
 		 287 aa  177  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4298  IclR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 279 aa  177  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0848  transcriptional regulator, IclR family  42.69 
 
 		 275 aa  173  7.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.130407  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0448  IclR family transcriptional regulator  42.8 
 
 		 262 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0581  IclR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 297 aa  165  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0439  transcriptional regulator, IclR family  42.8 
 
 		 262 aa  162  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.545927  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0195  IclR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 296 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4533  IclR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 276 aa  155  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000115279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0113  IclR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 277 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0154  transcriptional regulator, IclR family  38.64 
 
 		 292 aa  151  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.351671 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1125  IclR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 259 aa  151  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0741  IclR family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 260 aa  150  5e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0082  IclR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 285 aa  150  8e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0161  transcriptional regulator, IclR family  37.88 
 
 		 290 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.567451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0445  IclR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 287 aa  149  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.915056 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0804  regulatory proteins, IclR  36.58 
 
 		 266 aa  142  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000542062  unclonable  0.0000000637978 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0481  transcriptional regulator, IclR family  34.83 
 
 		 300 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4236  IclR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 299 aa  139  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.375859 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2825  IclR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 291 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.619636 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2962  IclR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 291 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0300  transcription regulator protein  40.59 
 
 		 290 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.9672 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0391  IclR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 288 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797378  normal  0.0181315 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2913  IclR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 290 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.464233  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6256  IclR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 288 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2928  IclR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 288 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2299  IclR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 288 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0361  IclR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 340 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3215  IclR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 317 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0078  IclR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 315 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.493125  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0599  IclR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 315 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0417  IclR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 308 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0246  IclR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 317 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1348  IclR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 317 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.102339  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0437  IclR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 317 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3598  transcriptional regulator, IclR family  35.41 
 
 		 273 aa  123  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1458  transcriptional regulator, IclR family  31.27 
 
 		 262 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0384  IclR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 265 aa  123  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0235844  hitchhiker  0.00703834 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5959  IclR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 271 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0527246 
 
 
-
 
NC_003296  RS01745  transcription regulator protein  34.89 
 
 		 311 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.264626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4527  transcriptional regulator, IclR family  34.29 
 
 		 295 aa  121  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0675359  normal  0.540679 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4659  transcriptional regulator, IclR family  34.29 
 
 		 295 aa  121  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880576  normal  0.215321 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5276  regulatory protein, IclR  35.36 
 
 		 271 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.945753  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0156  transcriptional regulator, IclR family  34.38 
 
 		 302 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1516  transcriptional regulator, IclR family  32.42 
 
 		 271 aa  118  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.371505  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3632  putative transcription regulator protein  39.06 
 
 		 274 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.266279 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4930  putative IclR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 271 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.622933 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0163  transcriptional regulator, IclR family  34.15 
 
 		 302 aa  115  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0302  transcription regulator protein  34.88 
 
 		 295 aa  114  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0724  IclR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 303 aa  114  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.778685  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0689  IclR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 274 aa  106  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.933931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3889  IclR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 268 aa  102  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0628146  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3394  regulatory protein, IclR  31.44 
 
 		 265 aa  98.6  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101533  normal  0.0303831 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1632  transcriptional regulator, IclR family  34.91 
 
 		 297 aa  97.8  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38500  IclR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 267 aa  96.7  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3279  putative transcriptional regulator  29.74 
 
 		 267 aa  93.6  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0169  regulatory proteins, IclR  30.47 
 
 		 275 aa  90.9  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0909  IclR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 264 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3528  regulatory proteins, IclR  29.8 
 
 		 265 aa  89.7  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2311  IclR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 262 aa  90.1  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.986469  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10190  putative transcriptional regulator  30.36 
 
 		 262 aa  87  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.413507  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4622  IclR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 277 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4086  regulatory protein IclR  28.93 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.406824  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4606  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 262 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0481261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4742  regulatory proteins, IclR  26.05 
 
 		 281 aa  82.4  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4482  IclR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1802  IclR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 285 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3148  IclR family transcriptional regulator  29 
 
 		 263 aa  79  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174875  hitchhiker  0.0000000981116 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2258  transcriptional regulator, IclR family  24.34 
 
 		 280 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0816  IclR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0735  regulatory protein, IclR  24.55 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000567454 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3552  transcriptional regulator, IclR family  27.24 
 
 		 263 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1109  IclR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 108 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3327  regulatory proteins, IclR  27.43 
 
 		 263 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736955 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0050  IclR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 257 aa  68.6  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  27.88 
 
 		 266 aa  66.6  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3479  regulatory proteins, IclR  25.11 
 
 		 251 aa  66.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0476526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2380  IclR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.610686  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  24.22 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1087  transcriptional regulator, IclR family  27.46 
 
 		 258 aa  62.8  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4433  regulatory proteins, IclR  28.31 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2169  IclR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>