More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS01745 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01745  transcription regulator protein  100 
 
 		 311 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.264626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4659  transcriptional regulator, IclR family  81.85 
 
 		 295 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880576  normal  0.215321 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4527  transcriptional regulator, IclR family  81.85 
 
 		 295 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0675359  normal  0.540679 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0113  IclR family transcriptional regulator  56.57 
 
 		 277 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0082  IclR family transcriptional regulator  55.78 
 
 		 285 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0161  transcriptional regulator, IclR family  51.56 
 
 		 290 aa  249  4e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.567451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0154  transcriptional regulator, IclR family  50.87 
 
 		 292 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.351671 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4236  IclR family transcriptional regulator  49.62 
 
 		 299 aa  235  8e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.375859 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0195  IclR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2962  IclR family transcriptional regulator  50.81 
 
 		 291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2825  IclR family transcriptional regulator  50.81 
 
 		 291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.619636 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0300  transcription regulator protein  53.79 
 
 		 290 aa  232  8.000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.9672 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0391  IclR family transcriptional regulator  50.39 
 
 		 288 aa  230  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797378  normal  0.0181315 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6256  IclR family transcriptional regulator  49.8 
 
 		 288 aa  229  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2928  IclR family transcriptional regulator  49.8 
 
 		 288 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2913  IclR family transcriptional regulator  49.8 
 
 		 290 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.464233  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2299  IclR family transcriptional regulator  49.8 
 
 		 288 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0481  transcriptional regulator, IclR family  48.47 
 
 		 300 aa  228  7e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0361  IclR family transcriptional regulator  50 
 
 		 340 aa  225  9e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0078  IclR family transcriptional regulator  50 
 
 		 315 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.493125  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1348  IclR family transcriptional regulator  50 
 
 		 317 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.102339  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0599  IclR family transcriptional regulator  50 
 
 		 315 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0437  IclR family transcriptional regulator  50 
 
 		 317 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0417  IclR family transcriptional regulator  50 
 
 		 308 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3215  IclR family transcriptional regulator  50 
 
 		 317 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0246  IclR family transcriptional regulator  50 
 
 		 317 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0448  IclR family transcriptional regulator  49.2 
 
 		 262 aa  218  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0439  transcriptional regulator, IclR family  49.2 
 
 		 262 aa  211  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.545927  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1125  IclR family transcriptional regulator  47.43 
 
 		 259 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0741  IclR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 260 aa  189  5e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4298  IclR family transcriptional regulator  42.29 
 
 		 279 aa  187  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0302  transcription regulator protein  42.5 
 
 		 295 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4674  putative transcriptional regulatory protein  42.75 
 
 		 263 aa  176  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1516  transcriptional regulator, IclR family  43.48 
 
 		 271 aa  172  7.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.371505  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0163  transcriptional regulator, IclR family  39.16 
 
 		 302 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0156  transcriptional regulator, IclR family  39.62 
 
 		 302 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0445  IclR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 287 aa  170  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.915056 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0293  transcriptional regulator, IclR family  38.43 
 
 		 287 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0384  IclR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 265 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0235844  hitchhiker  0.00703834 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3632  putative transcription regulator protein  44.23 
 
 		 274 aa  159  6e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.266279 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0848  transcriptional regulator, IclR family  41.95 
 
 		 275 aa  152  8.999999999999999e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.130407  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0804  regulatory proteins, IclR  37.39 
 
 		 266 aa  151  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000542062  unclonable  0.0000000637978 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3279  putative transcriptional regulator  41.45 
 
 		 267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0581  IclR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 297 aa  146  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0816  IclR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 260 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38500  IclR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 267 aa  145  9e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4622  IclR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 277 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0909  IclR family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4482  IclR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 277 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3552  transcriptional regulator, IclR family  37.99 
 
 		 263 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4606  IclR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 262 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0481261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2311  IclR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 262 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.986469  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3327  regulatory proteins, IclR  37.83 
 
 		 263 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736955 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4052  IclR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 281 aa  133  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000104088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4533  IclR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 276 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000115279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3528  regulatory proteins, IclR  36.17 
 
 		 265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0169  regulatory proteins, IclR  36.05 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1458  transcriptional regulator, IclR family  31.75 
 
 		 262 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3720  IclR family transcriptional regulator  38.11 
 
 		 554 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.261625 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4304  IclR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 569 aa  126  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.443184 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1802  IclR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 285 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4215  IclR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 279 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1632  transcriptional regulator, IclR family  39.73 
 
 		 297 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1712  IclR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 549 aa  123  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4196  IclR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 576 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.858157  normal  0.133552 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10190  putative transcriptional regulator  34.78 
 
 		 262 aa  123  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.413507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3394  regulatory protein, IclR  35.65 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101533  normal  0.0303831 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5959  IclR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 271 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0527246 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0336  IclR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 268 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4302  IclR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 551 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.750126 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4064  IclR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 551 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7213  transcriptional regulator, IclR family  35.5 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.33644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0735  regulatory protein, IclR  33.95 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000567454 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3216  IclR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 547 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4086  regulatory protein IclR  33.19 
 
 		 291 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.406824  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4053  IclR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 269 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0738351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3148  IclR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 263 aa  116  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174875  hitchhiker  0.0000000981116 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4742  regulatory proteins, IclR  31.68 
 
 		 281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3598  transcriptional regulator, IclR family  32.95 
 
 		 273 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3889  IclR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 268 aa  112  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0628146  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0337  IclR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 261 aa  112  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1560  regulatory proteins, IclR  30.73 
 
 		 286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4930  putative IclR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 271 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.622933 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5276  regulatory protein, IclR  34.62 
 
 		 271 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.945753  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4216  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 264 aa  109  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7212  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 295 aa  109  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.858542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0425  IclR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 296 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000742162  normal  0.768795 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0724  IclR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 303 aa  105  9e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.778685  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0689  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 274 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.933931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0426  IclR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 289 aa  90.5  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000895626  normal  0.732187 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0381  IclR family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 301 aa  88.6  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2370  IclR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 268 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4338  IclR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 263 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6015  IclR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 263 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4028  IclR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 263 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0162  transcriptional regulator, IclR family  32.14 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  29.86 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  26.67 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  25.57 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1109  IclR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 108 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>