More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0724 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007650  BTH_II0724  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 303 aa  593  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.778685  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3598  transcriptional regulator, IclR family  70.82 
 
 		 273 aa  365  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5959  IclR family transcriptional regulator  71.6 
 
 		 271 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0527246 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4930  putative IclR family transcriptional regulator  71.08 
 
 		 271 aa  348  9e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.622933 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5276  regulatory protein, IclR  69.69 
 
 		 271 aa  332  3e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.945753  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0689  IclR family transcriptional regulator  64.81 
 
 		 274 aa  316  3e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.933931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38500  IclR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 267 aa  155  9e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0113  IclR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 277 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0082  IclR family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 285 aa  152  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3279  putative transcriptional regulator  39.29 
 
 		 267 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0909  IclR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 264 aa  149  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4622  IclR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 277 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4606  IclR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0481261  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3552  transcriptional regulator, IclR family  37.21 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4298  IclR family transcriptional regulator  36.58 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4482  IclR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 277 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0448  IclR family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 262 aa  142  6e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0302  transcription regulator protein  37.5 
 
 		 295 aa  142  9e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0163  transcriptional regulator, IclR family  38.28 
 
 		 302 aa  142  9e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3327  regulatory proteins, IclR  35.94 
 
 		 263 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736955 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0156  transcriptional regulator, IclR family  37.89 
 
 		 302 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0816  IclR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 260 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1125  IclR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0384  IclR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 265 aa  136  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0235844  hitchhiker  0.00703834 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0741  IclR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 260 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0439  transcriptional regulator, IclR family  39.61 
 
 		 262 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.545927  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4674  putative transcriptional regulatory protein  34.77 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4236  IclR family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.375859 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1516  transcriptional regulator, IclR family  35.04 
 
 		 271 aa  130  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.371505  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1712  IclR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 549 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3720  IclR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 554 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.261625 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0804  regulatory proteins, IclR  33.46 
 
 		 266 aa  127  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000542062  unclonable  0.0000000637978 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0848  transcriptional regulator, IclR family  34.93 
 
 		 275 aa  127  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.130407  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0195  IclR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4196  IclR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 576 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.858157  normal  0.133552 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0293  transcriptional regulator, IclR family  31.92 
 
 		 287 aa  126  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0481  transcriptional regulator, IclR family  36.08 
 
 		 300 aa  125  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4302  IclR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 551 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.750126 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4064  IclR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 551 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2825  IclR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 291 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.619636 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2928  IclR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 288 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2299  IclR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 288 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2913  IclR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.464233  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6256  IclR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 288 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4052  IclR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 281 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000104088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0391  IclR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 288 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797378  normal  0.0181315 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2962  IclR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0078  IclR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 315 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.493125  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4533  IclR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 276 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000115279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0599  IclR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 315 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0417  IclR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 308 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0437  IclR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 317 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1348  IclR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 317 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.102339  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3215  IclR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 317 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0246  IclR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 317 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0161  transcriptional regulator, IclR family  36.26 
 
 		 290 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.567451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1632  transcriptional regulator, IclR family  34.98 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0154  transcriptional regulator, IclR family  36.26 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.351671 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4304  IclR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 569 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.443184 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0361  IclR family transcriptional regulator  36.58 
 
 		 340 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0169  regulatory proteins, IclR  35.71 
 
 		 275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0581  IclR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 297 aa  113  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3216  IclR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 547 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0445  IclR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 287 aa  112  8.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.915056 
 
 
-
 
NC_003296  RS01745  transcription regulator protein  35.34 
 
 		 311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.264626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7213  transcriptional regulator, IclR family  31.46 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.33644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0425  IclR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 296 aa  106  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000742162  normal  0.768795 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1458  transcriptional regulator, IclR family  30.86 
 
 		 262 aa  105  7e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0300  transcription regulator protein  36.09 
 
 		 290 aa  105  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.9672 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0336  IclR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 268 aa  105  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4527  transcriptional regulator, IclR family  33.57 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0675359  normal  0.540679 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4659  transcriptional regulator, IclR family  33.57 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880576  normal  0.215321 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4216  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 264 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4215  IclR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 279 aa  99.8  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7212  transcriptional regulator, IclR family  30.83 
 
 		 295 aa  99  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.858542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4742  regulatory proteins, IclR  29.15 
 
 		 281 aa  97.4  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3889  IclR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 268 aa  96.3  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0628146  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4053  IclR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 269 aa  93.6  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0738351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0426  IclR family transcriptional regulator  35 
 
 		 289 aa  92  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000895626  normal  0.732187 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3394  regulatory protein, IclR  32.64 
 
 		 265 aa  88.6  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101533  normal  0.0303831 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 260 aa  86.7  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3632  putative transcription regulator protein  35.89 
 
 		 274 aa  85.9  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.266279 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  27.94 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3528  regulatory proteins, IclR  27.39 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3148  IclR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174875  hitchhiker  0.0000000981116 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0735  regulatory protein, IclR  27.83 
 
 		 277 aa  79.7  0.00000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000567454 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  24.81 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  31.51 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10190  putative transcriptional regulator  27.41 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.413507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4432  IclR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4086  regulatory protein IclR  24.89 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.406824  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  24.05 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  24.31 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  24.72 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  23.28 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1802  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>