More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4216 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4216  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 264 aa  519  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4052  IclR family transcriptional regulator  60.92 
 
 		 281 aa  298  4e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000104088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0337  IclR family transcriptional regulator  67.63 
 
 		 261 aa  289  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7213  transcriptional regulator, IclR family  64.39 
 
 		 295 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.33644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4302  IclR family transcriptional regulator  56.37 
 
 		 551 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.750126 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4064  IclR family transcriptional regulator  56.37 
 
 		 551 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4196  IclR family transcriptional regulator  54.62 
 
 		 576 aa  258  9e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.858157  normal  0.133552 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1712  IclR family transcriptional regulator  55.25 
 
 		 549 aa  257  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3720  IclR family transcriptional regulator  55.86 
 
 		 554 aa  257  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.261625 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3216  IclR family transcriptional regulator  55.64 
 
 		 547 aa  251  7e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4304  IclR family transcriptional regulator  53.99 
 
 		 569 aa  250  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.443184 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0426  IclR family transcriptional regulator  65.53 
 
 		 289 aa  241  9e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000895626  normal  0.732187 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4298  IclR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 279 aa  187  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4674  putative transcriptional regulatory protein  40.48 
 
 		 263 aa  176  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4053  IclR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 269 aa  169  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0738351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0293  transcriptional regulator, IclR family  38.15 
 
 		 287 aa  165  6.9999999999999995e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4215  IclR family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0336  IclR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 268 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7212  transcriptional regulator, IclR family  38.71 
 
 		 295 aa  159  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.858542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0848  transcriptional regulator, IclR family  38.25 
 
 		 275 aa  156  4e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.130407  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0425  IclR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 296 aa  155  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000742162  normal  0.768795 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0448  IclR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0113  IclR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 277 aa  152  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4533  IclR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 276 aa  151  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000115279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0439  transcriptional regulator, IclR family  37.55 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.545927  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0195  IclR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 296 aa  145  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0804  regulatory proteins, IclR  33.73 
 
 		 266 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000542062  unclonable  0.0000000637978 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0082  IclR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 285 aa  145  9e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0361  IclR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 340 aa  144  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0078  IclR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 315 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.493125  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3215  IclR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 317 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1348  IclR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 317 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.102339  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0599  IclR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 315 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0246  IclR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 317 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0437  IclR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 317 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4236  IclR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 299 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.375859 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0417  IclR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 308 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0154  transcriptional regulator, IclR family  35.58 
 
 		 292 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.351671 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0391  IclR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 288 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797378  normal  0.0181315 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0161  transcriptional regulator, IclR family  34.46 
 
 		 290 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.567451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1125  IclR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2928  IclR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2913  IclR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.464233  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2299  IclR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6256  IclR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 288 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0481  transcriptional regulator, IclR family  34.24 
 
 		 300 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2825  IclR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 291 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.619636 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2962  IclR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 291 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0581  IclR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 297 aa  136  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0445  IclR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 287 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.915056 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1516  transcriptional regulator, IclR family  33.6 
 
 		 271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.371505  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0741  IclR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0300  transcription regulator protein  34.65 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.9672 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4527  transcriptional regulator, IclR family  32.8 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0675359  normal  0.540679 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4659  transcriptional regulator, IclR family  32.8 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880576  normal  0.215321 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0302  transcription regulator protein  33.07 
 
 		 295 aa  115  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5959  IclR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 271 aa  115  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0527246 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0384  IclR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 265 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0235844  hitchhiker  0.00703834 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0163  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 		 302 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0156  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 		 302 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_003296  RS01745  transcription regulator protein  32.93 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.264626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5276  regulatory protein, IclR  35.58 
 
 		 271 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.945753  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3598  transcriptional regulator, IclR family  33.85 
 
 		 273 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0909  IclR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0724  IclR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.778685  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38500  IclR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 267 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0689  IclR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.933931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4930  putative IclR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.622933 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0169  regulatory proteins, IclR  35.67 
 
 		 275 aa  99  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3279  putative transcriptional regulator  32.05 
 
 		 267 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4482  IclR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 277 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4622  IclR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 277 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3889  IclR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 268 aa  94.7  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0628146  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3632  putative transcription regulator protein  32.94 
 
 		 274 aa  94.7  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.266279 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1632  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 297 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3528  regulatory proteins, IclR  31.8 
 
 		 265 aa  93.2  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1458  transcriptional regulator, IclR family  26.91 
 
 		 262 aa  92.4  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2311  IclR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 262 aa  91.7  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.986469  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3394  regulatory protein, IclR  31.22 
 
 		 265 aa  88.2  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101533  normal  0.0303831 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3552  transcriptional regulator, IclR family  25.71 
 
 		 263 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0816  IclR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 260 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4606  IclR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0481261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2258  transcriptional regulator, IclR family  26.04 
 
 		 280 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3148  IclR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 263 aa  82  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174875  hitchhiker  0.0000000981116 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4086  regulatory protein IclR  31.14 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.406824  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10190  putative transcriptional regulator  34.94 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.413507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1109  IclR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 108 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0758  IclR family transcriptional regulator  21.59 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00765311  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1802  IclR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 285 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3327  regulatory proteins, IclR  25.31 
 
 		 263 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736955 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4742  regulatory proteins, IclR  30.14 
 
 		 281 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0735  regulatory protein, IclR  29.94 
 
 		 277 aa  74.3  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000567454 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3648  transcriptional regulator, IclR family  34.48 
 
 		 263 aa  72  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3858  IclR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 278 aa  72  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.8679  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0136  transcriptional regulator, IclR family  25.68 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3897  IclR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 282 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0140  IclR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2370  IclR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3881  hth-type tranScriptional regulator yiaj  26.46 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3990  hth-type tranScriptional regulator yiaj  26.46 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.776659  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>