More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3858 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3858  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 278 aa  561  1.0000000000000001e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.8679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0920  IclR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 282 aa  113  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687031  normal  0.0182204 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3479  regulatory proteins, IclR  31.9 
 
 		 251 aa  113  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0476526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 268 aa  109  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 260 aa  105  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  27.67 
 
 		 280 aa  105  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 272 aa  97.8  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0118  IclR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 273 aa  95.5  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0364  IclR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 265 aa  94.4  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  30.39 
 
 		 254 aa  92.8  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2149  IclR family transcriptional regulator, putative  26.75 
 
 		 248 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 267 aa  92  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5126  transcriptional regulator, IclR family  28.85 
 
 		 255 aa  90.5  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  23.9 
 
 		 256 aa  90.5  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  24.3 
 
 		 261 aa  88.6  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4095  IclR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 269 aa  88.6  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129203  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2325  transcriptional regulator, IclR family  28.32 
 
 		 258 aa  87.4  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  25.9 
 
 		 252 aa  86.7  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5545  regulatory protein, IclR  26.58 
 
 		 251 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2316  IclR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 246 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812394  normal  0.959704 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  24.67 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  27.88 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 260 aa  85.1  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2285  transcriptional regulator, IclR family  25.67 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  24.67 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0302  transcription regulator protein  27.8 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 259 aa  84  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0416  regulatory proteins, IclR  25.71 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000505949  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 267 aa  83.6  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  24.22 
 
 		 275 aa  82.8  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 265 aa  82  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1652  IclR family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 257 aa  82  0.000000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2380  IclR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 291 aa  82  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.610686  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  24.89 
 
 		 260 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  25 
 
 		 265 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0804  regulatory proteins, IclR  27.11 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000542062  unclonable  0.0000000637978 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3261  IclR family transcriptional regulator  24.45 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  24.23 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  23.14 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2008  transcriptional regulator IclR  26.01 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7484  IclR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4608  IclR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249268  normal  0.348784 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0496  regulatory protein, IclR  26.15 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2258  transcriptional regulator, IclR family  23.44 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  24.17 
 
 		 277 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  24.7 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 258 aa  78.6  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1458  transcriptional regulator, IclR family  26.72 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2760  regulatory protein IclR  35.37 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1885  IclR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.216873 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0222  Transcriptional regulator IclR  28.24 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.300165  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2380  IclR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.102909  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  25.46 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  24.34 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0163  transcriptional regulator, IclR family  27.57 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6211  IclR family transcriptional regulator  27 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0156  transcriptional regulator, IclR family  27.57 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0430  IclR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0855586  normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0293  transcriptional regulator, IclR family  24.25 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 275 aa  75.9  0.0000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  23.51 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6211  IclR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 282 aa  75.5  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.253024 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4406  IclR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 258 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.41646 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3857  transcriptional regulator, IclR family  28.43 
 
 		 287 aa  75.5  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4081  IclR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  23.89 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0101  transcriptional regulator, TrmB  26.34 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  24.9 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0465  IclR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0093222  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1087  transcriptional regulator, IclR family  28.43 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  24.7 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4521  IclR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.948737 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3586  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.58 
 
 		 569 aa  73.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2252  transcriptional regulator, IclR family  28.32 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.128917  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  23.39 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4647  transcriptional regulator, IclR family  26.75 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5397  transcriptional regulator, IclR family  26.17 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3416  transcriptional regulator, IclR family  25.79 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4432  IclR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  28.5 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1912  IclR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0082  IclR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 285 aa  73.2  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  24.67 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  25.63 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  22.58 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0796  IclR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.060065  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3950  IclR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 267 aa  72.4  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000408149  normal  0.169274 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4000  regulatory proteins, IclR  29.94 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1930  IclR family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3826  transcriptional regulator, IclR family  28.8 
 
 		 278 aa  72  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>