More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2258 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2258  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 280 aa  577  1e-164  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0804  regulatory proteins, IclR  27.69 
 
 		 266 aa  115  7.999999999999999e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000542062  unclonable  0.0000000637978 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3552  transcriptional regulator, IclR family  26.23 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3327  regulatory proteins, IclR  25.82 
 
 		 263 aa  102  9e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736955 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1458  transcriptional regulator, IclR family  25.41 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  25.69 
 
 		 252 aa  94  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1560  regulatory proteins, IclR  23.57 
 
 		 286 aa  93.6  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3279  putative transcriptional regulator  30.28 
 
 		 267 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  26 
 
 		 252 aa  92.8  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0448  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 262 aa  93.2  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0909  IclR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 264 aa  92  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  25.6 
 
 		 256 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38500  IclR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 267 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0445  IclR family transcriptional regulator  28 
 
 		 287 aa  89.4  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.915056 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0735  regulatory protein, IclR  25.09 
 
 		 277 aa  89  7e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000567454 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0156  transcriptional regulator, IclR family  24.61 
 
 		 302 aa  89  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0439  transcriptional regulator, IclR family  24.8 
 
 		 262 aa  88.6  9e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.545927  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  25.2 
 
 		 252 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0163  transcriptional regulator, IclR family  24.61 
 
 		 302 aa  88.2  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4533  IclR family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 276 aa  88.2  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000115279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4304  IclR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 569 aa  85.5  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.443184 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  23.81 
 
 		 257 aa  85.5  9e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4622  IclR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 277 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4236  IclR family transcriptional regulator  24.45 
 
 		 299 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.375859 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0816  IclR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 260 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0302  transcription regulator protein  23.23 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4482  IclR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 277 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0361  IclR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 340 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0481  transcriptional regulator, IclR family  26.11 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4606  IclR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 262 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0481261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4298  IclR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0758  IclR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 262 aa  83.6  0.000000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00765311  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4674  putative transcriptional regulatory protein  22.09 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  24.3 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  24.3 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  24.3 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6256  IclR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 288 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  24.3 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  24.3 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  24.3 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  24.3 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  24.3 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1125  IclR family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 259 aa  83.2  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2299  IclR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 288 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2913  IclR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.464233  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2928  IclR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 288 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  25.39 
 
 		 275 aa  83.2  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  21.64 
 
 		 280 aa  82.4  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  21.64 
 
 		 280 aa  82.4  0.000000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  21.64 
 
 		 280 aa  82.4  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  23.2 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4052  IclR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 281 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000104088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3687  transcriptional regulator, IclR family  25.2 
 
 		 272 aa  82  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 261 aa  81.6  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1712  IclR family transcriptional regulator  24.33 
 
 		 549 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 268 aa  81.6  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  26.07 
 
 		 264 aa  82  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0391  IclR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797378  normal  0.0181315 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3884  transcriptional regulator, IclR family  25.2 
 
 		 272 aa  81.6  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0154  transcriptional regulator, IclR family  23.46 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.351671 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  23.81 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2825  IclR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.619636 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0293  transcriptional regulator, IclR family  22.93 
 
 		 287 aa  80.9  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2962  IclR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3928  IclR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0417  IclR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3945  HTH-type transcriptional regulator YiaJ  25.9 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3215  IclR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 317 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0078  IclR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.493125  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1348  IclR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 317 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.102339  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0599  IclR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0437  IclR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 317 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0161  transcriptional regulator, IclR family  23.08 
 
 		 290 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.567451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0581  IclR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0246  IclR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 317 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1516  transcriptional regulator, IclR family  25.59 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.371505  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3990  hth-type tranScriptional regulator yiaj  25.9 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.776659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3858  IclR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.8679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  22.89 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3881  hth-type tranScriptional regulator yiaj  25.9 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4051  HTH-type transcriptional regulator YiaJ  25.9 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.726111 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0848  transcriptional regulator, IclR family  26.91 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.130407  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0741  IclR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4196  IclR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 576 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.858157  normal  0.133552 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4216  IclR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  24.14 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0136  transcriptional regulator, IclR family  26.49 
 
 		 282 aa  79  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  27.75 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0140  IclR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 282 aa  79  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3720  IclR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 554 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.261625 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0516  transcriptional regulator, IclR family  26 
 
 		 272 aa  79  0.00000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3897  IclR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 282 aa  79  0.00000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0195  IclR family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0866  IclR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 260 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0543323  normal  0.324813 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3865  HTH-type transcriptional regulator  25.5 
 
 		 266 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03426  predicted DNA-binding transcriptional repressor  26.49 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03377  hypothetical protein  26.49 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0082  IclR family transcriptional regulator  22.53 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  25.89 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4527  transcriptional regulator, IclR family  26.17 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0675359  normal  0.540679 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>