More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0195 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0195  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 296 aa  597  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0481  transcriptional regulator, IclR family  79.87 
 
 		 300 aa  483  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4236  IclR family transcriptional regulator  81.08 
 
 		 299 aa  483  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.375859 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3215  IclR family transcriptional regulator  81.06 
 
 		 317 aa  434  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0437  IclR family transcriptional regulator  81.06 
 
 		 317 aa  434  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0417  IclR family transcriptional regulator  81.06 
 
 		 308 aa  434  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0599  IclR family transcriptional regulator  81.06 
 
 		 315 aa  434  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0361  IclR family transcriptional regulator  81.06 
 
 		 340 aa  434  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0246  IclR family transcriptional regulator  81.06 
 
 		 317 aa  434  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0391  IclR family transcriptional regulator  80.84 
 
 		 288 aa  434  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797378  normal  0.0181315 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1348  IclR family transcriptional regulator  81.06 
 
 		 317 aa  434  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.102339  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0078  IclR family transcriptional regulator  81.06 
 
 		 315 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.493125  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6256  IclR family transcriptional regulator  80.08 
 
 		 288 aa  432  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2913  IclR family transcriptional regulator  80.08 
 
 		 290 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.464233  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2299  IclR family transcriptional regulator  80.08 
 
 		 288 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2928  IclR family transcriptional regulator  80.08 
 
 		 288 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2825  IclR family transcriptional regulator  80.38 
 
 		 291 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.619636 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2962  IclR family transcriptional regulator  80.38 
 
 		 291 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0113  IclR family transcriptional regulator  60.77 
 
 		 277 aa  312  4.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0082  IclR family transcriptional regulator  60.08 
 
 		 285 aa  298  5e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0448  IclR family transcriptional regulator  55.98 
 
 		 262 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0161  transcriptional regulator, IclR family  54.23 
 
 		 290 aa  271  8.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.567451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0154  transcriptional regulator, IclR family  54.84 
 
 		 292 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.351671 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1125  IclR family transcriptional regulator  54.86 
 
 		 259 aa  270  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0741  IclR family transcriptional regulator  57.03 
 
 		 260 aa  260  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0439  transcriptional regulator, IclR family  55.6 
 
 		 262 aa  259  3e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.545927  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0300  transcription regulator protein  53.17 
 
 		 290 aa  241  7e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.9672 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0445  IclR family transcriptional regulator  53.67 
 
 		 287 aa  241  9e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.915056 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4659  transcriptional regulator, IclR family  50.38 
 
 		 295 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880576  normal  0.215321 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4527  transcriptional regulator, IclR family  50.38 
 
 		 295 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0675359  normal  0.540679 
 
 
-
 
NC_003296  RS01745  transcription regulator protein  47.44 
 
 		 311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.264626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0804  regulatory proteins, IclR  43.19 
 
 		 266 aa  207  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000542062  unclonable  0.0000000637978 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4674  putative transcriptional regulatory protein  44.84 
 
 		 263 aa  203  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0848  transcriptional regulator, IclR family  47.92 
 
 		 275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.130407  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0293  transcriptional regulator, IclR family  41.95 
 
 		 287 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4533  IclR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 276 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000115279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4298  IclR family transcriptional regulator  42.29 
 
 		 279 aa  187  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0384  IclR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 265 aa  180  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0235844  hitchhiker  0.00703834 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3632  putative transcription regulator protein  48.05 
 
 		 274 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.266279 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1516  transcriptional regulator, IclR family  41.5 
 
 		 271 aa  176  4e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.371505  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0302  transcription regulator protein  38.28 
 
 		 295 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0163  transcriptional regulator, IclR family  36.82 
 
 		 302 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0156  transcriptional regulator, IclR family  36.33 
 
 		 302 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1712  IclR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 549 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4622  IclR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 277 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0816  IclR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 260 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4482  IclR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 277 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4304  IclR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 569 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.443184 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4052  IclR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 281 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000104088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0581  IclR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 297 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4606  IclR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 262 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0481261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3720  IclR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 554 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.261625 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4196  IclR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 576 aa  148  9e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.858157  normal  0.133552 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4302  IclR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 551 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.750126 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4064  IclR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 551 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5959  IclR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0527246 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0909  IclR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 264 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3216  IclR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 547 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3889  IclR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 268 aa  144  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0628146  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3279  putative transcriptional regulator  34.57 
 
 		 267 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3552  transcriptional regulator, IclR family  34.51 
 
 		 263 aa  142  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4216  IclR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 264 aa  142  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3598  transcriptional regulator, IclR family  36.12 
 
 		 273 aa  142  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7213  transcriptional regulator, IclR family  35.45 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.33644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5276  regulatory protein, IclR  38.18 
 
 		 271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.945753  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38500  IclR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 267 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1632  transcriptional regulator, IclR family  40.17 
 
 		 297 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1802  IclR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 285 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3528  regulatory proteins, IclR  31.66 
 
 		 265 aa  138  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4215  IclR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 279 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0169  regulatory proteins, IclR  37 
 
 		 275 aa  136  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2311  IclR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 262 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.986469  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4930  putative IclR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.622933 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3327  regulatory proteins, IclR  35.59 
 
 		 263 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736955 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3394  regulatory protein, IclR  35.29 
 
 		 265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101533  normal  0.0303831 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3148  IclR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174875  hitchhiker  0.0000000981116 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4086  regulatory protein IclR  32.17 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.406824  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1458  transcriptional regulator, IclR family  31.76 
 
 		 262 aa  127  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10190  putative transcriptional regulator  32.91 
 
 		 262 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.413507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0735  regulatory protein, IclR  36.99 
 
 		 277 aa  122  5e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000567454 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4742  regulatory proteins, IclR  31.09 
 
 		 281 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0426  IclR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 289 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000895626  normal  0.732187 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0689  IclR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.933931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0724  IclR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 303 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.778685  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0425  IclR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 296 aa  116  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000742162  normal  0.768795 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7212  transcriptional regulator, IclR family  32.07 
 
 		 295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.858542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0337  IclR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 261 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0336  IclR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 268 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4053  IclR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 269 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0738351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1560  regulatory proteins, IclR  33.04 
 
 		 286 aa  103  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2258  transcriptional regulator, IclR family  22.96 
 
 		 280 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4860  IclR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 274 aa  78.6  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  26.5 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  25.53 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  24.68 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  24.68 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  24.68 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  24.68 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  24.68 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>