290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4215 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4215  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 
279 aa  546  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0336  IclR family transcriptional regulator  71.91 
 
 
268 aa  358  4e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0425  IclR family transcriptional regulator  68.73 
 
 
296 aa  328  6e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000742162  normal  0.768795 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4053  IclR family transcriptional regulator  66.67 
 
 
269 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0738351  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7212  transcriptional regulator, IclR family  67.62 
 
 
295 aa  322  4e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.858542  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3216  IclR family transcriptional regulator  60.9 
 
 
547 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4064  IclR family transcriptional regulator  60.53 
 
 
551 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4302  IclR family transcriptional regulator  60.53 
 
 
551 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.750126 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1712  IclR family transcriptional regulator  60.84 
 
 
549 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3720  IclR family transcriptional regulator  62.36 
 
 
554 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.261625 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4304  IclR family transcriptional regulator  61.89 
 
 
569 aa  276  4e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.443184 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4196  IclR family transcriptional regulator  61.6 
 
 
576 aa  271  6e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.858157  normal  0.133552 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4674  putative transcriptional regulatory protein  44.49 
 
 
263 aa  195  9e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0293  transcriptional regulator, IclR family  42.29 
 
 
287 aa  188  9e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4298  IclR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
279 aa  186  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0848  transcriptional regulator, IclR family  41.39 
 
 
275 aa  169  4e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.130407  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4052  IclR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000104088  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4216  IclR family transcriptional regulator  39.92 
 
 
264 aa  159  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0581  IclR family transcriptional regulator  37.55 
 
 
297 aa  155  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0113  IclR family transcriptional regulator  38.31 
 
 
277 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4236  IclR family transcriptional regulator  38.41 
 
 
299 aa  152  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.375859 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7213  transcriptional regulator, IclR family  41.67 
 
 
295 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.33644  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0448  IclR family transcriptional regulator  40.53 
 
 
262 aa  149  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0481  transcriptional regulator, IclR family  37.28 
 
 
300 aa  148  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0082  IclR family transcriptional regulator  37.4 
 
 
285 aa  145  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2825  IclR family transcriptional regulator  37.45 
 
 
291 aa  145  9e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.619636 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0439  transcriptional regulator, IclR family  40.3 
 
 
262 aa  145  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.545927  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1125  IclR family transcriptional regulator  39 
 
 
259 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2962  IclR family transcriptional regulator  37.07 
 
 
291 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2928  IclR family transcriptional regulator  37.16 
 
 
288 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2299  IclR family transcriptional regulator  37.16 
 
 
288 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2913  IclR family transcriptional regulator  37.16 
 
 
290 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.464233  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4533  IclR family transcriptional regulator  37.02 
 
 
276 aa  142  7e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000115279  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6256  IclR family transcriptional regulator  36.78 
 
 
288 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0391  IclR family transcriptional regulator  36.4 
 
 
288 aa  139  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797378  normal  0.0181315 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0804  regulatory proteins, IclR  34.77 
 
 
266 aa  138  8.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000542062  unclonable  0.0000000637978 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0437  IclR family transcriptional regulator  35.61 
 
 
317 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0417  IclR family transcriptional regulator  35.61 
 
 
308 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0599  IclR family transcriptional regulator  35.61 
 
 
315 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0246  IclR family transcriptional regulator  35.61 
 
 
317 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3215  IclR family transcriptional regulator  35.61 
 
 
317 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0361  IclR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
340 aa  138  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1348  IclR family transcriptional regulator  35.61 
 
 
317 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.102339  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0078  IclR family transcriptional regulator  35.61 
 
 
315 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.493125  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0195  IclR family transcriptional regulator  36.3 
 
 
296 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0161  transcriptional regulator, IclR family  36.13 
 
 
290 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.567451  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0154  transcriptional regulator, IclR family  35.91 
 
 
292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.351671 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4659  transcriptional regulator, IclR family  36.19 
 
 
295 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880576  normal  0.215321 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4527  transcriptional regulator, IclR family  36.19 
 
 
295 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0675359  normal  0.540679 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0384  IclR family transcriptional regulator  33.46 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0235844  hitchhiker  0.00703834 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0300  transcription regulator protein  35.56 
 
 
290 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.9672 
 
 
-
 
NC_003296  RS01745  transcription regulator protein  34.73 
 
 
311 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.264626  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1516  transcriptional regulator, IclR family  36.23 
 
 
271 aa  125  9e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.371505  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0741  IclR family transcriptional regulator  39.08 
 
 
260 aa  124  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0163  transcriptional regulator, IclR family  35.29 
 
 
302 aa  122  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0156  transcriptional regulator, IclR family  35.69 
 
 
302 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0689  IclR family transcriptional regulator  34.1 
 
 
274 aa  118  9e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.933931  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5276  regulatory protein, IclR  33.57 
 
 
271 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.945753  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0426  IclR family transcriptional regulator  43.85 
 
 
289 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000895626  normal  0.732187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0302  transcription regulator protein  33.07 
 
 
295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0445  IclR family transcriptional regulator  40.07 
 
 
287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.915056 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0337  IclR family transcriptional regulator  36.8 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3598  transcriptional regulator, IclR family  30.5 
 
 
273 aa  108  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5959  IclR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
271 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0527246 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1458  transcriptional regulator, IclR family  29.85 
 
 
262 aa  104  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3632  putative transcription regulator protein  38.04 
 
 
274 aa  103  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.266279 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1632  transcriptional regulator, IclR family  34.02 
 
 
297 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4930  putative IclR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
271 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.622933 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0724  IclR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
303 aa  99  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.778685  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38500  IclR family transcriptional regulator  32.09 
 
 
267 aa  99  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3279  putative transcriptional regulator  30.15 
 
 
267 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4622  IclR family transcriptional regulator  30.34 
 
 
277 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4482  IclR family transcriptional regulator  30.34 
 
 
277 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0169  regulatory proteins, IclR  29.14 
 
 
275 aa  95.1  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4606  IclR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
262 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0481261  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0816  IclR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
260 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3394  regulatory protein, IclR  31.69 
 
 
265 aa  89  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101533  normal  0.0303831 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0909  IclR family transcriptional regulator  28.36 
 
 
264 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3528  regulatory proteins, IclR  28.11 
 
 
265 aa  85.1  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2311  IclR family transcriptional regulator  30.61 
 
 
262 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.986469  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3552  transcriptional regulator, IclR family  26.3 
 
 
263 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0735  regulatory protein, IclR  30 
 
 
277 aa  73.6  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000567454 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4742  regulatory proteins, IclR  25.2 
 
 
281 aa  71.6  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  24.71 
 
 
254 aa  71.2  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3327  regulatory proteins, IclR  24.72 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00736955 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3889  IclR family transcriptional regulator  26.02 
 
 
268 aa  69.3  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0628146  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3148  IclR family transcriptional regulator  27.73 
 
 
263 aa  67  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174875  hitchhiker  0.0000000981116 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  26.07 
 
 
259 aa  67  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1802  IclR family transcriptional regulator  26.69 
 
 
285 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4086  regulatory protein IclR  27.02 
 
 
291 aa  65.9  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.406824  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10190  putative transcriptional regulator  27.8 
 
 
262 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.413507  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2285  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 
259 aa  63.9  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3303  IclR family transcriptional regulator  32.09 
 
 
244 aa  63.9  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.870247  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  20.95 
 
 
246 aa  62.4  0.000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  20.95 
 
 
246 aa  62.4  0.000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1109  IclR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
108 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  25.1 
 
 
268 aa  62  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0920  IclR family transcriptional regulator  24.44 
 
 
282 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687031  normal  0.0182204 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2380  IclR family transcriptional regulator  25.87 
 
 
291 aa  59.3  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.610686  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1175  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
350 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>