More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0384 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0384  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 265 aa  537  9.999999999999999e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0235844  hitchhiker  0.00703834 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1516  transcriptional regulator, IclR family  67.83 
 
 		 271 aa  350  1e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.371505  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0113  IclR family transcriptional regulator  41.02 
 
 		 277 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0082  IclR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 285 aa  202  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1125  IclR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 259 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2825  IclR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 291 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.619636 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0391  IclR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 288 aa  186  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797378  normal  0.0181315 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0078  IclR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 315 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.493125  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0599  IclR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 315 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3215  IclR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 317 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0246  IclR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 317 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1348  IclR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 317 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.102339  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0417  IclR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 308 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2962  IclR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 291 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0437  IclR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 317 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0361  IclR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 340 aa  185  7e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0448  IclR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0481  transcriptional regulator, IclR family  37.79 
 
 		 300 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2913  IclR family transcriptional regulator  37.94 
 
 		 290 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.464233  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6256  IclR family transcriptional regulator  37.94 
 
 		 288 aa  183  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2928  IclR family transcriptional regulator  37.94 
 
 		 288 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2299  IclR family transcriptional regulator  37.94 
 
 		 288 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4236  IclR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 299 aa  181  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.375859 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0195  IclR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 296 aa  180  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0804  regulatory proteins, IclR  40.47 
 
 		 266 aa  179  4.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000542062  unclonable  0.0000000637978 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4674  putative transcriptional regulatory protein  39.76 
 
 		 263 aa  177  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0293  transcriptional regulator, IclR family  40 
 
 		 287 aa  177  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4298  IclR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 279 aa  176  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0848  transcriptional regulator, IclR family  42.8 
 
 		 275 aa  172  6.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.130407  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0439  transcriptional regulator, IclR family  42.86 
 
 		 262 aa  171  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.545927  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0154  transcriptional regulator, IclR family  38.17 
 
 		 292 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.351671 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0161  transcriptional regulator, IclR family  37.4 
 
 		 290 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.567451  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0300  transcription regulator protein  40.86 
 
 		 290 aa  166  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.9672 
 
 
-
 
NC_003296  RS01745  transcription regulator protein  39.53 
 
 		 311 aa  166  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.264626  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0302  transcription regulator protein  37.21 
 
 		 295 aa  166  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3279  putative transcriptional regulator  40.08 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0163  transcriptional regulator, IclR family  37.35 
 
 		 302 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0741  IclR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 260 aa  161  8.000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0156  transcriptional regulator, IclR family  36.96 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38500  IclR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4622  IclR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 277 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0909  IclR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 264 aa  158  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4659  transcriptional regulator, IclR family  37.21 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880576  normal  0.215321 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4527  transcriptional regulator, IclR family  37.21 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0675359  normal  0.540679 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4482  IclR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 277 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0169  regulatory proteins, IclR  35.98 
 
 		 275 aa  152  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0581  IclR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 297 aa  146  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0445  IclR family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.915056 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0816  IclR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5959  IclR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 271 aa  143  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0527246 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3552  transcriptional regulator, IclR family  34.85 
 
 		 263 aa  142  8e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3632  putative transcription regulator protein  38.04 
 
 		 274 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.266279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4606  IclR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0481261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3598  transcriptional regulator, IclR family  32.95 
 
 		 273 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3327  regulatory proteins, IclR  34.35 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736955 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4533  IclR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 276 aa  133  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000115279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4930  putative IclR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 271 aa  132  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.622933 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1458  transcriptional regulator, IclR family  32.94 
 
 		 262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5276  regulatory protein, IclR  32.42 
 
 		 271 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.945753  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0689  IclR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 274 aa  129  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.933931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0735  regulatory protein, IclR  36.57 
 
 		 277 aa  130  3e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000567454 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4742  regulatory proteins, IclR  33.88 
 
 		 281 aa  129  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4052  IclR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000104088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4215  IclR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0724  IclR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 303 aa  125  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.778685  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0425  IclR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000742162  normal  0.768795 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3889  IclR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0628146  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4064  IclR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 551 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4302  IclR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 551 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.750126 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3216  IclR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 547 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3528  regulatory proteins, IclR  31.74 
 
 		 265 aa  122  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7212  transcriptional regulator, IclR family  33.94 
 
 		 295 aa  122  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.858542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1712  IclR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 549 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4304  IclR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 569 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.443184 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3148  IclR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 263 aa  115  6.9999999999999995e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174875  hitchhiker  0.0000000981116 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3394  regulatory protein, IclR  32.69 
 
 		 265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101533  normal  0.0303831 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4196  IclR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 576 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.858157  normal  0.133552 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1632  transcriptional regulator, IclR family  35.48 
 
 		 297 aa  113  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3720  IclR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 554 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.261625 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4053  IclR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 269 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0738351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10190  putative transcriptional regulator  29.55 
 
 		 262 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.413507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7213  transcriptional regulator, IclR family  31.03 
 
 		 295 aa  112  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.33644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4216  IclR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4086  regulatory protein IclR  31.05 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.406824  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1802  IclR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0336  IclR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 268 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1560  regulatory proteins, IclR  29.81 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 262 aa  96.3  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2311  IclR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 262 aa  95.5  8e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.986469  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  30.08 
 
 		 280 aa  94.7  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0426  IclR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 289 aa  88.6  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000895626  normal  0.732187 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0337  IclR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 261 aa  87.8  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  24.4 
 
 		 275 aa  88.2  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 268 aa  87.8  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0118  IclR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 273 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  26.07 
 
 		 259 aa  86.7  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0349  IclR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 265 aa  86.3  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000127041  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2995  transcriptional regulator, IclR family  27.84 
 
 		 249 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.71341e-17 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1381  transcriptional regulator, IclR family  29.28 
 
 		 259 aa  85.5  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2997  IclR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 249 aa  85.5  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>