More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0426 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0426  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 289 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000895626  normal  0.732187 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7213  transcriptional regulator, IclR family  86.46 
 
 		 295 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.33644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4052  IclR family transcriptional regulator  73.33 
 
 		 281 aa  381  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000104088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4216  IclR family transcriptional regulator  64.93 
 
 		 264 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3720  IclR family transcriptional regulator  63.95 
 
 		 554 aa  296  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.261625 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4196  IclR family transcriptional regulator  63.57 
 
 		 576 aa  296  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.858157  normal  0.133552 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4302  IclR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 551 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.750126 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4064  IclR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 551 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1712  IclR family transcriptional regulator  62.6 
 
 		 549 aa  280  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3216  IclR family transcriptional regulator  60.98 
 
 		 547 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4304  IclR family transcriptional regulator  59.53 
 
 		 569 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.443184 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0337  IclR family transcriptional regulator  62.1 
 
 		 261 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4298  IclR family transcriptional regulator  42.97 
 
 		 279 aa  191  9e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4674  putative transcriptional regulatory protein  43.53 
 
 		 263 aa  189  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0293  transcriptional regulator, IclR family  42.37 
 
 		 287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0448  IclR family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0848  transcriptional regulator, IclR family  41.22 
 
 		 275 aa  171  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.130407  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4053  IclR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 269 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0738351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4215  IclR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 279 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0439  transcriptional regulator, IclR family  43.31 
 
 		 262 aa  167  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.545927  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7212  transcriptional regulator, IclR family  41.91 
 
 		 295 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.858542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0425  IclR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 296 aa  166  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000742162  normal  0.768795 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4533  IclR family transcriptional regulator  41.29 
 
 		 276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000115279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0336  IclR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1125  IclR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 259 aa  163  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0195  IclR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 296 aa  156  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0154  transcriptional regulator, IclR family  39.61 
 
 		 292 aa  152  7e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.351671 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0741  IclR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 260 aa  151  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0361  IclR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 340 aa  151  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0082  IclR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 285 aa  151  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0161  transcriptional regulator, IclR family  38.11 
 
 		 290 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.567451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0113  IclR family transcriptional regulator  36.58 
 
 		 277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0246  IclR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 317 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0078  IclR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 315 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.493125  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0599  IclR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 315 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0437  IclR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 317 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3215  IclR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 317 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0417  IclR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 308 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1348  IclR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 317 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.102339  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0804  regulatory proteins, IclR  36.76 
 
 		 266 aa  145  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000542062  unclonable  0.0000000637978 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0391  IclR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 288 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797378  normal  0.0181315 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6256  IclR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2928  IclR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0445  IclR family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.915056 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2913  IclR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.464233  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2299  IclR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2825  IclR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 291 aa  142  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.619636 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4236  IclR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 299 aa  142  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.375859 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2962  IclR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 291 aa  142  9e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0581  IclR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4659  transcriptional regulator, IclR family  35.25 
 
 		 295 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880576  normal  0.215321 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4527  transcriptional regulator, IclR family  35.25 
 
 		 295 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0675359  normal  0.540679 
 
 
-
 
NC_003296  RS01745  transcription regulator protein  35.52 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.264626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0481  transcriptional regulator, IclR family  34.47 
 
 		 300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0300  transcription regulator protein  38.78 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.9672 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0384  IclR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0235844  hitchhiker  0.00703834 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1516  transcriptional regulator, IclR family  32.3 
 
 		 271 aa  129  8.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.371505  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3632  putative transcription regulator protein  40.48 
 
 		 274 aa  122  7e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.266279 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5959  IclR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 271 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0527246 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5276  regulatory protein, IclR  35.61 
 
 		 271 aa  119  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.945753  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0169  regulatory proteins, IclR  33.2 
 
 		 275 aa  116  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38500  IclR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 267 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3279  putative transcriptional regulator  33.6 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3598  transcriptional regulator, IclR family  34.12 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0909  IclR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 264 aa  113  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0724  IclR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 303 aa  112  9e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.778685  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0689  IclR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.933931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1458  transcriptional regulator, IclR family  30.8 
 
 		 262 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0302  transcription regulator protein  32.67 
 
 		 295 aa  109  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0163  transcriptional regulator, IclR family  33.08 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4930  putative IclR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.622933 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0156  transcriptional regulator, IclR family  33.08 
 
 		 302 aa  106  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4622  IclR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 277 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4482  IclR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 277 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3889  IclR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 268 aa  101  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0628146  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3528  regulatory proteins, IclR  32.22 
 
 		 265 aa  97.1  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1632  transcriptional regulator, IclR family  33.74 
 
 		 297 aa  95.5  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3394  regulatory protein, IclR  32.95 
 
 		 265 aa  94.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101533  normal  0.0303831 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2311  IclR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 262 aa  94.4  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.986469  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0816  IclR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 260 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4606  IclR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 262 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0481261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3148  IclR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 263 aa  92  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174875  hitchhiker  0.0000000981116 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10190  putative transcriptional regulator  32.05 
 
 		 262 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.413507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4742  regulatory proteins, IclR  27.19 
 
 		 281 aa  88.6  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3552  transcriptional regulator, IclR family  28.85 
 
 		 263 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4086  regulatory protein IclR  30.8 
 
 		 291 aa  86.3  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.406824  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3327  regulatory proteins, IclR  28.82 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736955 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1802  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 285 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0920  IclR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 282 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687031  normal  0.0182204 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0735  regulatory protein, IclR  25.97 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000567454 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  28.96 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2258  transcriptional regulator, IclR family  24.8 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1109  IclR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 108 aa  72  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2380  IclR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.610686  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4434  transcriptional regulator, IclR family  27.2 
 
 		 261 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0001758  normal  0.639145 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3479  regulatory proteins, IclR  26.78 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0476526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  29.76 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1560  regulatory proteins, IclR  24.44 
 
 		 286 aa  68.2  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3303  IclR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 244 aa  67  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.870247  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5126  transcriptional regulator, IclR family  26.69 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>