More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0735 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0735  regulatory protein, IclR  100 
 
 		 277 aa  570  1e-161  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000567454 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1560  regulatory proteins, IclR  61.01 
 
 		 286 aa  336  1.9999999999999998e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0300  transcription regulator protein  34.43 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.9672 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0391  IclR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 288 aa  133  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797378  normal  0.0181315 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0154  transcriptional regulator, IclR family  33.64 
 
 		 292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.351671 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0161  transcriptional regulator, IclR family  33.18 
 
 		 290 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.567451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0113  IclR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 277 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2825  IclR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 291 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.619636 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0384  IclR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 265 aa  130  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0235844  hitchhiker  0.00703834 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6256  IclR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 288 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4236  IclR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.375859 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2299  IclR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 288 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2928  IclR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 288 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2913  IclR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 290 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.464233  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2962  IclR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 291 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1516  transcriptional regulator, IclR family  35.65 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.371505  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0481  transcriptional regulator, IclR family  37.27 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4659  transcriptional regulator, IclR family  35.94 
 
 		 295 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880576  normal  0.215321 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4527  transcriptional regulator, IclR family  35.94 
 
 		 295 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0675359  normal  0.540679 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0082  IclR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 285 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0195  IclR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 296 aa  122  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4674  putative transcriptional regulatory protein  33.64 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0361  IclR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 340 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0246  IclR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 317 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0078  IclR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 315 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.493125  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0417  IclR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0804  regulatory proteins, IclR  34.72 
 
 		 266 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000542062  unclonable  0.0000000637978 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0599  IclR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 315 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0437  IclR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 317 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3215  IclR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 317 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1348  IclR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 317 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.102339  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01745  transcription regulator protein  33.95 
 
 		 311 aa  118  9e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.264626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0448  IclR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 262 aa  114  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4298  IclR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0848  transcriptional regulator, IclR family  36.94 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.130407  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0302  transcription regulator protein  29.17 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1125  IclR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 259 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0169  regulatory proteins, IclR  28.97 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0439  transcriptional regulator, IclR family  34.88 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.545927  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1458  transcriptional regulator, IclR family  27.17 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0293  transcriptional regulator, IclR family  29.06 
 
 		 287 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0156  transcriptional regulator, IclR family  27.83 
 
 		 302 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0163  transcriptional regulator, IclR family  27.83 
 
 		 302 aa  105  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3279  putative transcriptional regulator  29.15 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38500  IclR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4533  IclR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 276 aa  99.4  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000115279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4482  IclR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 277 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0909  IclR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 264 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4742  regulatory proteins, IclR  27.19 
 
 		 281 aa  97.1  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0741  IclR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 260 aa  97.1  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4622  IclR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 277 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0816  IclR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 260 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0581  IclR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 297 aa  94  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3327  regulatory proteins, IclR  29.44 
 
 		 263 aa  92  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736955 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4196  IclR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 576 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.858157  normal  0.133552 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3632  putative transcription regulator protein  37.89 
 
 		 274 aa  91.3  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.266279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4606  IclR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 262 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0481261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3720  IclR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 554 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.261625 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5959  IclR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 271 aa  89.4  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0527246 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2258  transcriptional regulator, IclR family  25.09 
 
 		 280 aa  89  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3552  transcriptional regulator, IclR family  29.86 
 
 		 263 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0445  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 287 aa  86.7  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.915056 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  29.22 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3394  regulatory protein, IclR  27.95 
 
 		 265 aa  84.7  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101533  normal  0.0303831 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4930  putative IclR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 271 aa  84.3  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.622933 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3889  IclR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 268 aa  84  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0628146  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4304  IclR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 569 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.443184 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4302  IclR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 551 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.750126 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4064  IclR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 551 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5276  regulatory protein, IclR  30.05 
 
 		 271 aa  79  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.945753  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3216  IclR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 547 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3598  transcriptional regulator, IclR family  26.13 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1712  IclR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 549 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0336  IclR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4216  IclR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0689  IclR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.933931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4215  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1632  transcriptional regulator, IclR family  28.44 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1912  IclR family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 283 aa  72  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7212  transcriptional regulator, IclR family  27.47 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.858542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0724  IclR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 303 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.778685  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0425  IclR family transcriptional regulator  32 
 
 		 296 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000742162  normal  0.768795 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4053  IclR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 269 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0738351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  25.34 
 
 		 252 aa  68.6  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2822  IclR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  23.92 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  24.48 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4052  IclR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 281 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000104088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  26.49 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2185  transcriptional regulator, IclR family  24.39 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2287  transcriptional regulator, IclR family  23.79 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  0.385963 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0816  IclR family transcriptional regulator  21.58 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  25.11 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0337  IclR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7213  transcriptional regulator, IclR family  25.31 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.33644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  27.09 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0162  transcriptional regulator, IclR family  23.89 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  23.47 
 
 		 252 aa  62  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2434  IclR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>