More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A0246 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_0437  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 
317 aa  641    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0078  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 
315 aa  636    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.493125  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0599  IclR family transcriptional regulator  99.68 
 
 
315 aa  634    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0246  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 
317 aa  641    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1348  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 
317 aa  641    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.102339  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3215  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 
317 aa  641    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0417  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 
308 aa  621  1e-177  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0361  IclR family transcriptional regulator  94.88 
 
 
340 aa  532  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6256  IclR family transcriptional regulator  89.35 
 
 
288 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2928  IclR family transcriptional regulator  89.35 
 
 
288 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2825  IclR family transcriptional regulator  89.31 
 
 
291 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.619636 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2913  IclR family transcriptional regulator  89.35 
 
 
290 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.464233  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2299  IclR family transcriptional regulator  89.35 
 
 
288 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2962  IclR family transcriptional regulator  89.31 
 
 
291 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0391  IclR family transcriptional regulator  88.59 
 
 
288 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797378  normal  0.0181315 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4236  IclR family transcriptional regulator  78.38 
 
 
299 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.375859 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0195  IclR family transcriptional regulator  76.87 
 
 
296 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0481  transcriptional regulator, IclR family  76.17 
 
 
300 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0113  IclR family transcriptional regulator  61.36 
 
 
277 aa  311  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0082  IclR family transcriptional regulator  61.92 
 
 
285 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0161  transcriptional regulator, IclR family  56.43 
 
 
290 aa  281  8.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.567451  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0154  transcriptional regulator, IclR family  56.23 
 
 
292 aa  275  9e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.351671 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0448  IclR family transcriptional regulator  56.81 
 
 
262 aa  267  2e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0439  transcriptional regulator, IclR family  56.42 
 
 
262 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.545927  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1125  IclR family transcriptional regulator  51.75 
 
 
259 aa  250  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0300  transcription regulator protein  55 
 
 
290 aa  248  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.9672 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0741  IclR family transcriptional regulator  54.26 
 
 
260 aa  240  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4659  transcriptional regulator, IclR family  49.06 
 
 
295 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880576  normal  0.215321 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4527  transcriptional regulator, IclR family  49.06 
 
 
295 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0675359  normal  0.540679 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0445  IclR family transcriptional regulator  52.9 
 
 
287 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.915056 
 
 
-
 
NC_003296  RS01745  transcription regulator protein  47.69 
 
 
311 aa  229  4e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.264626  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0804  regulatory proteins, IclR  43.48 
 
 
266 aa  210  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000542062  unclonable  0.0000000637978 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4674  putative transcriptional regulatory protein  45.06 
 
 
263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4533  IclR family transcriptional regulator  42.64 
 
 
276 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000115279  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0848  transcriptional regulator, IclR family  46.32 
 
 
275 aa  195  7e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.130407  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4298  IclR family transcriptional regulator  44.22 
 
 
279 aa  190  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0384  IclR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
265 aa  185  7e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0235844  hitchhiker  0.00703834 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0293  transcriptional regulator, IclR family  39.72 
 
 
287 aa  182  6e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3632  putative transcription regulator protein  47.24 
 
 
274 aa  176  6e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.266279 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1516  transcriptional regulator, IclR family  40.71 
 
 
271 aa  171  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.371505  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0302  transcription regulator protein  39.84 
 
 
295 aa  169  5e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0156  transcriptional regulator, IclR family  37.59 
 
 
302 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0581  IclR family transcriptional regulator  39.24 
 
 
297 aa  167  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0163  transcriptional regulator, IclR family  37.77 
 
 
302 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4482  IclR family transcriptional regulator  36.88 
 
 
277 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4622  IclR family transcriptional regulator  36.78 
 
 
277 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0816  IclR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
260 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4606  IclR family transcriptional regulator  37.16 
 
 
262 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0481261  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4052  IclR family transcriptional regulator  35.88 
 
 
281 aa  149  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000104088  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0909  IclR family transcriptional regulator  34.81 
 
 
264 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3552  transcriptional regulator, IclR family  35.94 
 
 
263 aa  145  9e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3279  putative transcriptional regulator  35.91 
 
 
267 aa  142  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38500  IclR family transcriptional regulator  37.31 
 
 
267 aa  142  8e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3598  transcriptional regulator, IclR family  37.64 
 
 
273 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4215  IclR family transcriptional regulator  35.84 
 
 
279 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2311  IclR family transcriptional regulator  34.3 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.986469  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4086  regulatory protein IclR  34.44 
 
 
291 aa  140  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.406824  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3528  regulatory proteins, IclR  34.58 
 
 
265 aa  140  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5959  IclR family transcriptional regulator  37.6 
 
 
271 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0527246 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4216  IclR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
264 aa  138  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1712  IclR family transcriptional regulator  35.98 
 
 
549 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3148  IclR family transcriptional regulator  35.04 
 
 
263 aa  136  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174875  hitchhiker  0.0000000981116 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1802  IclR family transcriptional regulator  34.57 
 
 
285 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3889  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0628146  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1458  transcriptional regulator, IclR family  33.85 
 
 
262 aa  132  5e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3327  regulatory proteins, IclR  37.44 
 
 
263 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00736955 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1632  transcriptional regulator, IclR family  37.99 
 
 
297 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3720  IclR family transcriptional regulator  35.25 
 
 
554 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.261625 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10190  putative transcriptional regulator  35.22 
 
 
262 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.413507  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4304  IclR family transcriptional regulator  34.63 
 
 
569 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.443184 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3394  regulatory protein, IclR  37.22 
 
 
265 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101533  normal  0.0303831 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4196  IclR family transcriptional regulator  35.47 
 
 
576 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.858157  normal  0.133552 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5276  regulatory protein, IclR  37.41 
 
 
271 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.945753  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7213  transcriptional regulator, IclR family  37.15 
 
 
295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.33644  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4930  putative IclR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.622933 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4064  IclR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
551 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4302  IclR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
551 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.750126 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0169  regulatory proteins, IclR  35.93 
 
 
275 aa  125  7e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3216  IclR family transcriptional regulator  34.35 
 
 
547 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0336  IclR family transcriptional regulator  31.97 
 
 
268 aa  119  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0735  regulatory protein, IclR  35.02 
 
 
277 aa  119  9e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000567454 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4742  regulatory proteins, IclR  29.85 
 
 
281 aa  115  8.999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0425  IclR family transcriptional regulator  32.63 
 
 
296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000742162  normal  0.768795 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7212  transcriptional regulator, IclR family  32.07 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.858542  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0724  IclR family transcriptional regulator  35.07 
 
 
303 aa  114  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.778685  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0689  IclR family transcriptional regulator  36.74 
 
 
274 aa  114  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.933931  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4053  IclR family transcriptional regulator  34.6 
 
 
269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0738351  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0426  IclR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000895626  normal  0.732187 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0337  IclR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1560  regulatory proteins, IclR  34.63 
 
 
286 aa  105  8e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2258  transcriptional regulator, IclR family  25.22 
 
 
280 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  25.68 
 
 
254 aa  74.7  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  27.74 
 
 
259 aa  73.9  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  25.19 
 
 
263 aa  73.2  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  24.89 
 
 
275 aa  73.2  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  26.07 
 
 
262 aa  72.4  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6262  IclR family transcriptional regulator  25.49 
 
 
260 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1109  IclR family transcriptional regulator  40.59 
 
 
108 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03426  predicted DNA-binding transcriptional repressor  25.81 
 
 
282 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03377  hypothetical protein  25.81 
 
 
282 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>