More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0300 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0300  transcription regulator protein  100 
 
 		 290 aa  581  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.9672 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0161  transcriptional regulator, IclR family  83.39 
 
 		 290 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.567451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0154  transcriptional regulator, IclR family  82.47 
 
 		 292 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.351671 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0113  IclR family transcriptional regulator  64.5 
 
 		 277 aa  338  5.9999999999999996e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0082  IclR family transcriptional regulator  63.18 
 
 		 285 aa  322  4e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1348  IclR family transcriptional regulator  54.64 
 
 		 317 aa  277  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.102339  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0246  IclR family transcriptional regulator  54.64 
 
 		 317 aa  277  1e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0078  IclR family transcriptional regulator  54.64 
 
 		 315 aa  277  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.493125  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3215  IclR family transcriptional regulator  54.64 
 
 		 317 aa  277  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0437  IclR family transcriptional regulator  54.64 
 
 		 317 aa  277  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0417  IclR family transcriptional regulator  54.64 
 
 		 308 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0599  IclR family transcriptional regulator  56.49 
 
 		 315 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2962  IclR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 291 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2825  IclR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 291 aa  275  8e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.619636 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0195  IclR family transcriptional regulator  54.23 
 
 		 296 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0361  IclR family transcriptional regulator  56.11 
 
 		 340 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6256  IclR family transcriptional regulator  54.41 
 
 		 288 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2928  IclR family transcriptional regulator  54.41 
 
 		 288 aa  271  9e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2299  IclR family transcriptional regulator  54.41 
 
 		 288 aa  271  9e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2913  IclR family transcriptional regulator  54.41 
 
 		 290 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.464233  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0391  IclR family transcriptional regulator  53.82 
 
 		 288 aa  270  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797378  normal  0.0181315 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4659  transcriptional regulator, IclR family  53.45 
 
 		 295 aa  266  4e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880576  normal  0.215321 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4527  transcriptional regulator, IclR family  53.45 
 
 		 295 aa  266  4e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0675359  normal  0.540679 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4236  IclR family transcriptional regulator  50.74 
 
 		 299 aa  263  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.375859 
 
 
-
 
NC_003296  RS01745  transcription regulator protein  53.79 
 
 		 311 aa  263  3e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.264626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1125  IclR family transcriptional regulator  52.53 
 
 		 259 aa  253  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0448  IclR family transcriptional regulator  54.09 
 
 		 262 aa  253  3e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0481  transcriptional regulator, IclR family  48.24 
 
 		 300 aa  253  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0439  transcriptional regulator, IclR family  52.92 
 
 		 262 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.545927  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0741  IclR family transcriptional regulator  52.53 
 
 		 260 aa  229  4e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0445  IclR family transcriptional regulator  50.76 
 
 		 287 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.915056 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4674  putative transcriptional regulatory protein  47.06 
 
 		 263 aa  216  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0804  regulatory proteins, IclR  43.08 
 
 		 266 aa  205  8e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000542062  unclonable  0.0000000637978 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0848  transcriptional regulator, IclR family  45.66 
 
 		 275 aa  193  4e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.130407  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4298  IclR family transcriptional regulator  43.58 
 
 		 279 aa  191  8e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0384  IclR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 265 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0235844  hitchhiker  0.00703834 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0293  transcriptional regulator, IclR family  42.7 
 
 		 287 aa  189  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4533  IclR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 276 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000115279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1516  transcriptional regulator, IclR family  40.86 
 
 		 271 aa  181  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.371505  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0302  transcription regulator protein  40.31 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3632  putative transcription regulator protein  46.39 
 
 		 274 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.266279 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0581  IclR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 297 aa  172  5e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0163  transcriptional regulator, IclR family  38.46 
 
 		 302 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0156  transcriptional regulator, IclR family  38.55 
 
 		 302 aa  169  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0909  IclR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 264 aa  169  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3720  IclR family transcriptional regulator  41.7 
 
 		 554 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.261625 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4052  IclR family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 281 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000104088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5959  IclR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 271 aa  161  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0527246 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4304  IclR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 569 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.443184 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1712  IclR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 549 aa  159  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4196  IclR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 576 aa  158  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.858157  normal  0.133552 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5276  regulatory protein, IclR  41.98 
 
 		 271 aa  157  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.945753  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4064  IclR family transcriptional regulator  40.81 
 
 		 551 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4302  IclR family transcriptional regulator  40.81 
 
 		 551 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.750126 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4482  IclR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 277 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3279  putative transcriptional regulator  35.34 
 
 		 267 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3598  transcriptional regulator, IclR family  38.7 
 
 		 273 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0425  IclR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 296 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000742162  normal  0.768795 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3216  IclR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 547 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7212  transcriptional regulator, IclR family  36.52 
 
 		 295 aa  149  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.858542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7213  transcriptional regulator, IclR family  37.78 
 
 		 295 aa  149  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.33644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0169  regulatory proteins, IclR  35.71 
 
 		 275 aa  148  9e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38500  IclR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 267 aa  148  9e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4622  IclR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 277 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4930  putative IclR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 271 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.622933 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4215  IclR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4053  IclR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 269 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0738351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0735  regulatory protein, IclR  34.43 
 
 		 277 aa  146  5e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000567454 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0816  IclR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 260 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4606  IclR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 262 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0481261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0336  IclR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 268 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1560  regulatory proteins, IclR  34.62 
 
 		 286 aa  140  3e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3552  transcriptional regulator, IclR family  33.6 
 
 		 263 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3889  IclR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0628146  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1458  transcriptional regulator, IclR family  32.03 
 
 		 262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4216  IclR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 264 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0689  IclR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 274 aa  132  9e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.933931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0724  IclR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.778685  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3394  regulatory protein, IclR  35.84 
 
 		 265 aa  130  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101533  normal  0.0303831 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1632  transcriptional regulator, IclR family  39.08 
 
 		 297 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3327  regulatory proteins, IclR  33.74 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736955 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4742  regulatory proteins, IclR  31.54 
 
 		 281 aa  122  6e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3528  regulatory proteins, IclR  32.64 
 
 		 265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2311  IclR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.986469  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0337  IclR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0426  IclR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 289 aa  112  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000895626  normal  0.732187 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10190  putative transcriptional regulator  34.78 
 
 		 262 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.413507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4086  regulatory protein IclR  31.4 
 
 		 291 aa  109  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.406824  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3148  IclR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174875  hitchhiker  0.0000000981116 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1802  IclR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2258  transcriptional regulator, IclR family  24.12 
 
 		 280 aa  86.3  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3303  IclR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.870247  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  25.28 
 
 		 261 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 272 aa  75.5  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0381  IclR family transcriptional regulator  21.83 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1109  IclR family transcriptional regulator  38 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2032  transcriptional regulator, IclR family  30.96 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  23.94 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>