More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0425 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0425  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 296 aa  573  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000742162  normal  0.768795 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7212  transcriptional regulator, IclR family  91.19 
 
 		 295 aa  498  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.858542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4053  IclR family transcriptional regulator  71.92 
 
 		 269 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0738351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4215  IclR family transcriptional regulator  68.73 
 
 		 279 aa  342  2.9999999999999997e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0336  IclR family transcriptional regulator  64.13 
 
 		 268 aa  317  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4302  IclR family transcriptional regulator  61.59 
 
 		 551 aa  309  5e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.750126 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4064  IclR family transcriptional regulator  61.59 
 
 		 551 aa  309  5e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3216  IclR family transcriptional regulator  61.59 
 
 		 547 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1712  IclR family transcriptional regulator  59.66 
 
 		 549 aa  296  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4304  IclR family transcriptional regulator  60.76 
 
 		 569 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.443184 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4196  IclR family transcriptional regulator  60.35 
 
 		 576 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.858157  normal  0.133552 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3720  IclR family transcriptional regulator  60 
 
 		 554 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.261625 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4674  putative transcriptional regulatory protein  44.24 
 
 		 263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0293  transcriptional regulator, IclR family  42.45 
 
 		 287 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4298  IclR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 279 aa  183  4.0000000000000006e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4052  IclR family transcriptional regulator  43.77 
 
 		 281 aa  179  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000104088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0848  transcriptional regulator, IclR family  39.36 
 
 		 275 aa  166  5e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.130407  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0113  IclR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 277 aa  162  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0804  regulatory proteins, IclR  36.75 
 
 		 266 aa  159  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000542062  unclonable  0.0000000637978 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4216  IclR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 264 aa  155  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0581  IclR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 297 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4533  IclR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 276 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000115279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0154  transcriptional regulator, IclR family  35.71 
 
 		 292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.351671 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0161  transcriptional regulator, IclR family  35.71 
 
 		 290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.567451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0082  IclR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7213  transcriptional regulator, IclR family  40.55 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.33644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0448  IclR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 262 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4236  IclR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 299 aa  139  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.375859 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1125  IclR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 259 aa  139  7.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0439  transcriptional regulator, IclR family  37.32 
 
 		 262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.545927  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0384  IclR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0235844  hitchhiker  0.00703834 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0741  IclR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0481  transcriptional regulator, IclR family  34.51 
 
 		 300 aa  126  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1516  transcriptional regulator, IclR family  34.59 
 
 		 271 aa  126  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.371505  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0426  IclR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000895626  normal  0.732187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0300  transcription regulator protein  36.77 
 
 		 290 aa  123  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.9672 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0195  IclR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 296 aa  123  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0246  IclR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 317 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0437  IclR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 317 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3215  IclR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 317 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1348  IclR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 317 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.102339  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0078  IclR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 315 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.493125  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0599  IclR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 315 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0361  IclR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 340 aa  122  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0417  IclR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 308 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2825  IclR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 291 aa  122  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.619636 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0156  transcriptional regulator, IclR family  34.34 
 
 		 302 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0391  IclR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797378  normal  0.0181315 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2962  IclR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2928  IclR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 288 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2299  IclR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 288 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6256  IclR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 288 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2913  IclR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 290 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.464233  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0337  IclR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 261 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_003296  RS01745  transcription regulator protein  32.84 
 
 		 311 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.264626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4527  transcriptional regulator, IclR family  32.35 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0675359  normal  0.540679 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4659  transcriptional regulator, IclR family  32.35 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880576  normal  0.215321 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0163  transcriptional regulator, IclR family  33.56 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0445  IclR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 287 aa  113  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.915056 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0689  IclR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 274 aa  109  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.933931  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0302  transcription regulator protein  32.13 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3598  transcriptional regulator, IclR family  32.27 
 
 		 273 aa  106  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5959  IclR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 271 aa  105  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0527246 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0724  IclR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.778685  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4930  putative IclR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 271 aa  99  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.622933 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3632  putative transcription regulator protein  34.56 
 
 		 274 aa  98.2  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.266279 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38500  IclR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 267 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5276  regulatory protein, IclR  29.66 
 
 		 271 aa  97.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.945753  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3394  regulatory protein, IclR  32.68 
 
 		 265 aa  98.2  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101533  normal  0.0303831 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3279  putative transcriptional regulator  29.64 
 
 		 267 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0909  IclR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 264 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0169  regulatory proteins, IclR  30.71 
 
 		 275 aa  90.1  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1458  transcriptional regulator, IclR family  28.1 
 
 		 262 aa  89.7  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1632  transcriptional regulator, IclR family  37.75 
 
 		 297 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4622  IclR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4482  IclR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 277 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4742  regulatory proteins, IclR  25.87 
 
 		 281 aa  80.9  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3552  transcriptional regulator, IclR family  24.91 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2311  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 262 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.986469  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0735  regulatory protein, IclR  32 
 
 		 277 aa  76.3  0.0000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000567454 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0816  IclR family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3889  IclR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 268 aa  75.9  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0628146  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4606  IclR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0481261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3528  regulatory proteins, IclR  28.06 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3327  regulatory proteins, IclR  24.21 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736955 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  22.51 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3148  IclR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174875  hitchhiker  0.0000000981116 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1109  IclR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 108 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  27.08 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1802  IclR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 285 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4086  regulatory protein IclR  33.33 
 
 		 291 aa  62  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.406824  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10190  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.413507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  23.92 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3303  IclR family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.870247  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2381  IclR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1560  regulatory proteins, IclR  23.6 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  23.47 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2705  transcriptional regulator, IclR family  23.76 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2586  transcriptional regulator, IclR family  26.79 
 
 		 268 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119641 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>