More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3327 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3327  regulatory proteins, IclR  100 
 
 		 263 aa  526  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736955 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3552  transcriptional regulator, IclR family  88.85 
 
 		 263 aa  461  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0909  IclR family transcriptional regulator  61.39 
 
 		 264 aa  300  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4482  IclR family transcriptional regulator  60.24 
 
 		 277 aa  297  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4622  IclR family transcriptional regulator  60.55 
 
 		 277 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3279  putative transcriptional regulator  62.75 
 
 		 267 aa  294  9e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38500  IclR family transcriptional regulator  63.35 
 
 		 267 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0816  IclR family transcriptional regulator  61.47 
 
 		 260 aa  286  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4606  IclR family transcriptional regulator  59.77 
 
 		 262 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0481261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3598  transcriptional regulator, IclR family  37.69 
 
 		 273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0082  IclR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 285 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0302  transcription regulator protein  37.9 
 
 		 295 aa  149  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0804  regulatory proteins, IclR  32.94 
 
 		 266 aa  149  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000542062  unclonable  0.0000000637978 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0113  IclR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 277 aa  149  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5276  regulatory protein, IclR  38.2 
 
 		 271 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.945753  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0448  IclR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 262 aa  143  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0391  IclR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 288 aa  139  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797378  normal  0.0181315 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0361  IclR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 340 aa  138  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0689  IclR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 274 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.933931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1458  transcriptional regulator, IclR family  32.54 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0848  transcriptional regulator, IclR family  39.04 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.130407  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0163  transcriptional regulator, IclR family  35.63 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0156  transcriptional regulator, IclR family  35.63 
 
 		 302 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4930  putative IclR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 271 aa  135  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.622933 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5959  IclR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 271 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0527246 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0384  IclR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0235844  hitchhiker  0.00703834 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4674  putative transcriptional regulatory protein  33.33 
 
 		 263 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4236  IclR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.375859 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0481  transcriptional regulator, IclR family  36.64 
 
 		 300 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_003296  RS01745  transcription regulator protein  37.83 
 
 		 311 aa  133  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.264626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0439  transcriptional regulator, IclR family  38.05 
 
 		 262 aa  133  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.545927  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0724  IclR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 303 aa  133  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.778685  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0246  IclR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 317 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1348  IclR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 317 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.102339  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0078  IclR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 315 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.493125  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0599  IclR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 315 aa  132  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3215  IclR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 317 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0437  IclR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 317 aa  132  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0417  IclR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 308 aa  132  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2962  IclR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 291 aa  132  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2825  IclR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 291 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.619636 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2913  IclR family transcriptional regulator  36 
 
 		 290 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.464233  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6256  IclR family transcriptional regulator  36 
 
 		 288 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2928  IclR family transcriptional regulator  36 
 
 		 288 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2299  IclR family transcriptional regulator  36 
 
 		 288 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4527  transcriptional regulator, IclR family  36.25 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0675359  normal  0.540679 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4659  transcriptional regulator, IclR family  36.25 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880576  normal  0.215321 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0195  IclR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 296 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1125  IclR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1516  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 		 271 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.371505  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4298  IclR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 279 aa  122  5e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3889  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 268 aa  122  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0628146  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1632  transcriptional regulator, IclR family  34.9 
 
 		 297 aa  122  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4533  IclR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 276 aa  115  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000115279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0154  transcriptional regulator, IclR family  32.35 
 
 		 292 aa  115  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.351671 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0741  IclR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 260 aa  115  6e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0161  transcriptional regulator, IclR family  31.62 
 
 		 290 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.567451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0445  IclR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.915056 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0581  IclR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0293  transcriptional regulator, IclR family  28.68 
 
 		 287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4742  regulatory proteins, IclR  31.78 
 
 		 281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0300  transcription regulator protein  34.76 
 
 		 290 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.9672 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2311  IclR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 262 aa  104  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.986469  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0169  regulatory proteins, IclR  31.98 
 
 		 275 aa  102  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2258  transcriptional regulator, IclR family  25.82 
 
 		 280 aa  102  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1802  IclR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 285 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 262 aa  95.9  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  29.48 
 
 		 280 aa  94.4  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4086  regulatory protein IclR  26.09 
 
 		 291 aa  92.8  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.406824  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0735  regulatory protein, IclR  29.44 
 
 		 277 aa  92  8e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000567454 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 272 aa  92  9e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3394  regulatory protein, IclR  30.18 
 
 		 265 aa  90.5  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101533  normal  0.0303831 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3632  putative transcription regulator protein  33.47 
 
 		 274 aa  90.9  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.266279 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10190  putative transcriptional regulator  25.78 
 
 		 262 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.413507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3148  IclR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 263 aa  89.7  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174875  hitchhiker  0.0000000981116 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  25.5 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4052  IclR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 281 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000104088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1560  regulatory proteins, IclR  30 
 
 		 286 aa  87  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6634  IclR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 283 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0992864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3528  regulatory proteins, IclR  25.82 
 
 		 265 aa  85.9  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  25.21 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  26.86 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  24.7 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  24 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3928  IclR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4053  IclR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 269 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0738351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1712  IclR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 549 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 267 aa  75.9  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4304  IclR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 569 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.443184 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 275 aa  75.9  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  24.03 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4196  IclR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 576 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.858157  normal  0.133552 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3720  IclR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 554 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.261625 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3884  transcriptional regulator, IclR family  23.46 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3687  transcriptional regulator, IclR family  23.46 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  28.08 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  27.76 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>