More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1560 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1560  regulatory proteins, IclR  100 
 
 		 286 aa  593  1e-168  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0735  regulatory protein, IclR  61.01 
 
 		 277 aa  336  1.9999999999999998e-91  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000567454 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0300  transcription regulator protein  34.19 
 
 		 290 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.9672 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0161  transcriptional regulator, IclR family  33.9 
 
 		 290 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.567451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0154  transcriptional regulator, IclR family  33.47 
 
 		 292 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.351671 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0113  IclR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 277 aa  123  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0804  regulatory proteins, IclR  30.63 
 
 		 266 aa  118  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000542062  unclonable  0.0000000637978 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4236  IclR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 299 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.375859 
 
 
-
 
NC_003296  RS01745  transcription regulator protein  30.73 
 
 		 311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.264626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1516  transcriptional regulator, IclR family  31.25 
 
 		 271 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.371505  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4659  transcriptional regulator, IclR family  30.6 
 
 		 295 aa  109  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880576  normal  0.215321 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4527  transcriptional regulator, IclR family  30.6 
 
 		 295 aa  109  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0675359  normal  0.540679 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0384  IclR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 265 aa  108  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0235844  hitchhiker  0.00703834 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0082  IclR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0481  transcriptional regulator, IclR family  35.14 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4674  putative transcriptional regulatory protein  30.14 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0361  IclR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 340 aa  104  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0391  IclR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 288 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797378  normal  0.0181315 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0078  IclR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.493125  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0599  IclR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3215  IclR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0417  IclR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0246  IclR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0437  IclR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1348  IclR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.102339  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6256  IclR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 288 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0169  regulatory proteins, IclR  27.64 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2299  IclR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 288 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0195  IclR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 296 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2928  IclR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 288 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2913  IclR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 290 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.464233  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0302  transcription regulator protein  29.91 
 
 		 295 aa  102  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2962  IclR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 291 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2825  IclR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 291 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.619636 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4482  IclR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 277 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1125  IclR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 259 aa  98.2  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4622  IclR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 277 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1458  transcriptional regulator, IclR family  29.67 
 
 		 262 aa  97.8  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0816  IclR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 260 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0448  IclR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 262 aa  96.3  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4742  regulatory proteins, IclR  25.46 
 
 		 281 aa  95.5  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4606  IclR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 262 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0481261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2258  transcriptional regulator, IclR family  23.57 
 
 		 280 aa  93.6  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0163  transcriptional regulator, IclR family  27.73 
 
 		 302 aa  93.2  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0156  transcriptional regulator, IclR family  27.65 
 
 		 302 aa  92.8  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0848  transcriptional regulator, IclR family  33.18 
 
 		 275 aa  92.8  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.130407  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0439  transcriptional regulator, IclR family  31.05 
 
 		 262 aa  90.5  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.545927  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0293  transcriptional regulator, IclR family  28.32 
 
 		 287 aa  90.1  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4298  IclR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 279 aa  90.1  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0909  IclR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 264 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0581  IclR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 297 aa  89  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0741  IclR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 260 aa  87.8  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3327  regulatory proteins, IclR  30 
 
 		 263 aa  87  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736955 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3552  transcriptional regulator, IclR family  30.19 
 
 		 263 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38500  IclR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 267 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4533  IclR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 276 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000115279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3279  putative transcriptional regulator  26.32 
 
 		 267 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  29.55 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3889  IclR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0628146  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3394  regulatory protein, IclR  27.1 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101533  normal  0.0303831 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4930  putative IclR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 271 aa  81.6  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.622933 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3632  putative transcription regulator protein  32.94 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.266279 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0445  IclR family transcriptional regulator  31 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.915056 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5959  IclR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0527246 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0689  IclR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 274 aa  71.6  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.933931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5276  regulatory protein, IclR  29.38 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.945753  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 262 aa  68.9  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  23.72 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1632  transcriptional regulator, IclR family  26.13 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  22.86 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  27.57 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4216  IclR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  24.31 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3009  transcriptional regulator, IclR family  27.65 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.592723  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4052  IclR family transcriptional regulator  23.17 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000104088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  24.88 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4196  IclR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 576 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.858157  normal  0.133552 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  24.76 
 
 		 246 aa  62  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2360  regulatory proteins, IclR  26.36 
 
 		 263 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.123058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3720  IclR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 554 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.261625 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 246 aa  62  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1912  IclR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0337  IclR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4749  transcriptional regulator, IclR family  22.75 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  24.76 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7213  transcriptional regulator, IclR family  26.02 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.33644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3598  transcriptional regulator, IclR family  26.29 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08220  transcriptional regulator, IclR family  22.87 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0816  IclR family transcriptional regulator  21.56 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0667  regulatory protein IclR  27.88 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  23.22 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0308  regulatory protein IclR  23.64 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0724  IclR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 303 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.778685  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2024  transcriptional regulator, IclR family  23.64 
 
 		 281 aa  58.9  0.00000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.276218  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4064  IclR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 551 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4302  IclR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 551 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.750126 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  25.82 
 
 		 252 aa  58.9  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>