More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0445 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0445  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 287 aa  562  1.0000000000000001e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.915056 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0448  IclR family transcriptional regulator  67.43 
 
 		 262 aa  341  8e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0741  IclR family transcriptional regulator  70.66 
 
 		 260 aa  333  2e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1125  IclR family transcriptional regulator  63.46 
 
 		 259 aa  329  3e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0439  transcriptional regulator, IclR family  68.6 
 
 		 262 aa  328  7e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.545927  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0082  IclR family transcriptional regulator  54.83 
 
 		 285 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0113  IclR family transcriptional regulator  54.79 
 
 		 277 aa  269  5e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0391  IclR family transcriptional regulator  54.44 
 
 		 288 aa  261  8e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797378  normal  0.0181315 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0195  IclR family transcriptional regulator  53.67 
 
 		 296 aa  260  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2825  IclR family transcriptional regulator  54.05 
 
 		 291 aa  259  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.619636 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2962  IclR family transcriptional regulator  54.05 
 
 		 291 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6256  IclR family transcriptional regulator  53.28 
 
 		 288 aa  257  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2913  IclR family transcriptional regulator  53.28 
 
 		 290 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.464233  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2299  IclR family transcriptional regulator  53.28 
 
 		 288 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2928  IclR family transcriptional regulator  53.28 
 
 		 288 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0078  IclR family transcriptional regulator  52.9 
 
 		 315 aa  250  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.493125  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0599  IclR family transcriptional regulator  52.9 
 
 		 315 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0361  IclR family transcriptional regulator  53.28 
 
 		 340 aa  251  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1348  IclR family transcriptional regulator  52.9 
 
 		 317 aa  250  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.102339  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3215  IclR family transcriptional regulator  52.9 
 
 		 317 aa  250  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0246  IclR family transcriptional regulator  52.9 
 
 		 317 aa  250  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0437  IclR family transcriptional regulator  52.9 
 
 		 317 aa  250  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0417  IclR family transcriptional regulator  52.9 
 
 		 308 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4236  IclR family transcriptional regulator  50.71 
 
 		 299 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.375859 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0481  transcriptional regulator, IclR family  51.72 
 
 		 300 aa  247  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0154  transcriptional regulator, IclR family  49.48 
 
 		 292 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.351671 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0161  transcriptional regulator, IclR family  50.56 
 
 		 290 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.567451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0804  regulatory proteins, IclR  46.59 
 
 		 266 aa  224  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000542062  unclonable  0.0000000637978 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0300  transcription regulator protein  48.59 
 
 		 290 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.9672 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4674  putative transcriptional regulatory protein  47.84 
 
 		 263 aa  205  9e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0848  transcriptional regulator, IclR family  46.72 
 
 		 275 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.130407  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01745  transcription regulator protein  43.8 
 
 		 311 aa  190  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.264626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4298  IclR family transcriptional regulator  44.06 
 
 		 279 aa  190  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4659  transcriptional regulator, IclR family  44.53 
 
 		 295 aa  188  7e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880576  normal  0.215321 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4527  transcriptional regulator, IclR family  44.53 
 
 		 295 aa  188  7e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0675359  normal  0.540679 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3632  putative transcription regulator protein  49.42 
 
 		 274 aa  186  4e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.266279 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0293  transcriptional regulator, IclR family  42.86 
 
 		 287 aa  186  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4533  IclR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 276 aa  179  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000115279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0163  transcriptional regulator, IclR family  40.85 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0156  transcriptional regulator, IclR family  40.29 
 
 		 302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0302  transcription regulator protein  40.38 
 
 		 295 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3720  IclR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 554 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.261625 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4196  IclR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 576 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.858157  normal  0.133552 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4304  IclR family transcriptional regulator  44.11 
 
 		 569 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.443184 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4052  IclR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000104088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0384  IclR family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0235844  hitchhiker  0.00703834 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1712  IclR family transcriptional regulator  42.8 
 
 		 549 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0581  IclR family transcriptional regulator  44.31 
 
 		 297 aa  166  5e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5959  IclR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 271 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0527246 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4302  IclR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 551 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.750126 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4064  IclR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 551 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1458  transcriptional regulator, IclR family  37.21 
 
 		 262 aa  162  7e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3216  IclR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 547 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3279  putative transcriptional regulator  39.92 
 
 		 267 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1516  transcriptional regulator, IclR family  39.26 
 
 		 271 aa  157  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.371505  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38500  IclR family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0909  IclR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 264 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4622  IclR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 277 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3598  transcriptional regulator, IclR family  39.63 
 
 		 273 aa  147  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4482  IclR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7213  transcriptional regulator, IclR family  40.78 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.33644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5276  regulatory protein, IclR  39.1 
 
 		 271 aa  146  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.945753  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4216  IclR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1632  transcriptional regulator, IclR family  39.92 
 
 		 297 aa  142  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0689  IclR family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 274 aa  142  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.933931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4930  putative IclR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 271 aa  142  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.622933 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0816  IclR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 260 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4215  IclR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 279 aa  135  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2311  IclR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 262 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.986469  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4606  IclR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 262 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0481261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4053  IclR family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 269 aa  135  9e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0738351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10190  putative transcriptional regulator  36.67 
 
 		 262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.413507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3528  regulatory proteins, IclR  35.16 
 
 		 265 aa  133  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3148  IclR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 263 aa  132  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174875  hitchhiker  0.0000000981116 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0169  regulatory proteins, IclR  37.9 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1802  IclR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 285 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3552  transcriptional regulator, IclR family  33.86 
 
 		 263 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0425  IclR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000742162  normal  0.768795 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7212  transcriptional regulator, IclR family  36.11 
 
 		 295 aa  126  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.858542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3394  regulatory protein, IclR  36.4 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101533  normal  0.0303831 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0336  IclR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0724  IclR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 303 aa  123  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.778685  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4086  regulatory protein IclR  34.32 
 
 		 291 aa  122  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.406824  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3327  regulatory proteins, IclR  35.35 
 
 		 263 aa  122  8e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736955 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0337  IclR family transcriptional regulator  38.15 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3889  IclR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 268 aa  119  4.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0628146  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4742  regulatory proteins, IclR  31.15 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0426  IclR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 289 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000895626  normal  0.732187 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2258  transcriptional regulator, IclR family  26.27 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0735  regulatory protein, IclR  30.36 
 
 		 277 aa  99.8  5e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000567454 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1560  regulatory proteins, IclR  30.96 
 
 		 286 aa  89  9e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6634  IclR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0992864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4095  IclR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 269 aa  80.1  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129203  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3687  transcriptional regulator, IclR family  26.07 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  28.18 
 
 		 259 aa  79  0.00000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  29.32 
 
 		 273 aa  79  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3884  transcriptional regulator, IclR family  26.07 
 
 		 272 aa  78.6  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  28.83 
 
 		 280 aa  79  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  26.84 
 
 		 265 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1109  IclR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 108 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>