More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0909 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0909  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 264 aa  534  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4482  IclR family transcriptional regulator  83.6 
 
 		 277 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4622  IclR family transcriptional regulator  81.08 
 
 		 277 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0816  IclR family transcriptional regulator  83.46 
 
 		 260 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4606  IclR family transcriptional regulator  81.99 
 
 		 262 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0481261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3279  putative transcriptional regulator  77.36 
 
 		 267 aa  400  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38500  IclR family transcriptional regulator  77.48 
 
 		 267 aa  400  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3327  regulatory proteins, IclR  61.39 
 
 		 263 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736955 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3552  transcriptional regulator, IclR family  59.3 
 
 		 263 aa  292  4e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0082  IclR family transcriptional regulator  37.94 
 
 		 285 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0113  IclR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 277 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0302  transcription regulator protein  37.25 
 
 		 295 aa  169  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0448  IclR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0163  transcriptional regulator, IclR family  36.47 
 
 		 302 aa  162  7e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0154  transcriptional regulator, IclR family  38.4 
 
 		 292 aa  161  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.351671 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0156  transcriptional regulator, IclR family  36.47 
 
 		 302 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0161  transcriptional regulator, IclR family  38.02 
 
 		 290 aa  159  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.567451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0384  IclR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 265 aa  158  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0235844  hitchhiker  0.00703834 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0439  transcriptional regulator, IclR family  41.2 
 
 		 262 aa  157  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.545927  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0391  IclR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797378  normal  0.0181315 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1516  transcriptional regulator, IclR family  39.29 
 
 		 271 aa  156  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.371505  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2825  IclR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 291 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.619636 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6256  IclR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 288 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2928  IclR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 288 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2299  IclR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 288 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2913  IclR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.464233  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4659  transcriptional regulator, IclR family  40.5 
 
 		 295 aa  152  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880576  normal  0.215321 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4527  transcriptional regulator, IclR family  40.5 
 
 		 295 aa  152  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0675359  normal  0.540679 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2962  IclR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 291 aa  152  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3598  transcriptional regulator, IclR family  38.49 
 
 		 273 aa  152  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5276  regulatory protein, IclR  37.4 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.945753  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0361  IclR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 340 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4236  IclR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 299 aa  149  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.375859 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0848  transcriptional regulator, IclR family  38.49 
 
 		 275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.130407  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0481  transcriptional regulator, IclR family  35.32 
 
 		 300 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0246  IclR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1348  IclR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.102339  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0417  IclR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0078  IclR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.493125  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0437  IclR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0804  regulatory proteins, IclR  33.08 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000542062  unclonable  0.0000000637978 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0599  IclR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3215  IclR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4930  putative IclR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.622933 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0300  transcription regulator protein  36.33 
 
 		 290 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.9672 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0195  IclR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 296 aa  145  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01745  transcription regulator protein  40.33 
 
 		 311 aa  144  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.264626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5959  IclR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 271 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0527246 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1125  IclR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 259 aa  142  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0724  IclR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 303 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.778685  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4298  IclR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0445  IclR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 287 aa  139  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.915056 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4674  putative transcriptional regulatory protein  33.73 
 
 		 263 aa  139  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0689  IclR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 274 aa  135  7.000000000000001e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.933931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0741  IclR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 260 aa  133  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0581  IclR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0169  regulatory proteins, IclR  34.39 
 
 		 275 aa  128  8.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0293  transcriptional regulator, IclR family  31.34 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4742  regulatory proteins, IclR  33.76 
 
 		 281 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4533  IclR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 276 aa  122  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000115279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1632  transcriptional regulator, IclR family  36.7 
 
 		 297 aa  122  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3889  IclR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 268 aa  116  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0628146  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1458  transcriptional regulator, IclR family  28.92 
 
 		 262 aa  116  5e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4052  IclR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 281 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000104088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3632  putative transcription regulator protein  35.44 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.266279 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3148  IclR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174875  hitchhiker  0.0000000981116 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4086  regulatory protein IclR  29.65 
 
 		 291 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.406824  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10190  putative transcriptional regulator  29.65 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.413507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1712  IclR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 549 aa  99.8  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7213  transcriptional regulator, IclR family  30.94 
 
 		 295 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.33644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3528  regulatory proteins, IclR  28.17 
 
 		 265 aa  98.6  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0735  regulatory protein, IclR  29.55 
 
 		 277 aa  97.8  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000567454 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2311  IclR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 262 aa  97.8  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.986469  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 272 aa  96.3  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4196  IclR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 576 aa  95.9  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.858157  normal  0.133552 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1802  IclR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 285 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3720  IclR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 554 aa  95.5  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.261625 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4216  IclR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 264 aa  95.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6634  IclR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 283 aa  95.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0992864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  30.12 
 
 		 256 aa  93.6  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4304  IclR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 569 aa  93.2  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.443184 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  25.95 
 
 		 275 aa  93.6  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2258  transcriptional regulator, IclR family  30.91 
 
 		 280 aa  92  9e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  26.89 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  27.31 
 
 		 263 aa  90.5  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4053  IclR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 269 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0738351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1560  regulatory proteins, IclR  30.48 
 
 		 286 aa  89.7  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 263 aa  89.4  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4302  IclR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 551 aa  89  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.750126 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3216  IclR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 547 aa  89  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4064  IclR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 551 aa  89  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 276 aa  87.8  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4215  IclR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 279 aa  87.4  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 267 aa  87.8  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0425  IclR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 296 aa  86.7  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000742162  normal  0.768795 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  28.51 
 
 		 280 aa  86.7  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  26.14 
 
 		 263 aa  85.5  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  26.14 
 
 		 263 aa  85.5  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  26.14 
 
 		 263 aa  85.5  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>