More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5276 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5276  regulatory protein, IclR  100 
 
 		 271 aa  533  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.945753  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4930  putative IclR family transcriptional regulator  76.71 
 
 		 271 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.622933 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3598  transcriptional regulator, IclR family  72.97 
 
 		 273 aa  374  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5959  IclR family transcriptional regulator  66.79 
 
 		 271 aa  348  4e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0527246 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0724  IclR family transcriptional regulator  69.69 
 
 		 303 aa  327  9e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.778685  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0689  IclR family transcriptional regulator  64.91 
 
 		 274 aa  313  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.933931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0113  IclR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 277 aa  179  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0082  IclR family transcriptional regulator  43.8 
 
 		 285 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3279  putative transcriptional regulator  38.89 
 
 		 267 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38500  IclR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 267 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4622  IclR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0816  IclR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4482  IclR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 277 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1125  IclR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 259 aa  159  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4606  IclR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 262 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0481261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0448  IclR family transcriptional regulator  42.69 
 
 		 262 aa  157  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0909  IclR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 264 aa  157  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0302  transcription regulator protein  39.44 
 
 		 295 aa  156  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0741  IclR family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 260 aa  155  6e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3552  transcriptional regulator, IclR family  35.85 
 
 		 263 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4236  IclR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 299 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.375859 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3327  regulatory proteins, IclR  39.06 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736955 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0195  IclR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 296 aa  149  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0154  transcriptional regulator, IclR family  40.68 
 
 		 292 aa  149  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.351671 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0439  transcriptional regulator, IclR family  42.69 
 
 		 262 aa  149  6e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.545927  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0161  transcriptional regulator, IclR family  40.3 
 
 		 290 aa  149  7e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.567451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0163  transcriptional regulator, IclR family  36.4 
 
 		 302 aa  148  9e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0156  transcriptional regulator, IclR family  38.15 
 
 		 302 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0481  transcriptional regulator, IclR family  38.26 
 
 		 300 aa  142  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4674  putative transcriptional regulatory protein  36.72 
 
 		 263 aa  143  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1516  transcriptional regulator, IclR family  36.55 
 
 		 271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.371505  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0300  transcription regulator protein  40.84 
 
 		 290 aa  139  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.9672 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2825  IclR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 291 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.619636 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2928  IclR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 288 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1632  transcriptional regulator, IclR family  39.76 
 
 		 297 aa  137  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2299  IclR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 288 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0848  transcriptional regulator, IclR family  40.87 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.130407  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0391  IclR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 288 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797378  normal  0.0181315 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6256  IclR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 288 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2913  IclR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.464233  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0445  IclR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.915056 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0384  IclR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0235844  hitchhiker  0.00703834 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2962  IclR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 291 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1348  IclR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 317 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.102339  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0078  IclR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 315 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.493125  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0437  IclR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 317 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0246  IclR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 317 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3215  IclR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 317 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0417  IclR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 308 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0599  IclR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 315 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0361  IclR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 340 aa  132  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0293  transcriptional regulator, IclR family  35.77 
 
 		 287 aa  132  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0804  regulatory proteins, IclR  33.2 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000542062  unclonable  0.0000000637978 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1458  transcriptional regulator, IclR family  35.32 
 
 		 262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4298  IclR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4533  IclR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 276 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000115279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1712  IclR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 549 aa  125  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4302  IclR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 551 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.750126 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4064  IclR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 551 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0581  IclR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4052  IclR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 281 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000104088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3216  IclR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 547 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4215  IclR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4659  transcriptional regulator, IclR family  36.22 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880576  normal  0.215321 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4527  transcriptional regulator, IclR family  36.22 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0675359  normal  0.540679 
 
 
-
 
NC_003296  RS01745  transcription regulator protein  35.38 
 
 		 311 aa  116  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.264626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3720  IclR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 554 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.261625 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4304  IclR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 569 aa  115  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.443184 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4196  IclR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 576 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.858157  normal  0.133552 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4742  regulatory proteins, IclR  33.04 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7213  transcriptional regulator, IclR family  35.77 
 
 		 295 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.33644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0169  regulatory proteins, IclR  31.27 
 
 		 275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0336  IclR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 268 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4053  IclR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 269 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0738351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3889  IclR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 268 aa  107  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0628146  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3394  regulatory protein, IclR  33.19 
 
 		 265 aa  105  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101533  normal  0.0303831 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4216  IclR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 264 aa  102  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3632  putative transcription regulator protein  37.9 
 
 		 274 aa  102  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.266279 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0425  IclR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 296 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000742162  normal  0.768795 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7212  transcriptional regulator, IclR family  30.83 
 
 		 295 aa  99.8  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.858542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0426  IclR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 289 aa  95.5  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000895626  normal  0.732187 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3528  regulatory proteins, IclR  28.99 
 
 		 265 aa  89.4  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0735  regulatory protein, IclR  30.52 
 
 		 277 aa  87.4  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000567454 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4086  regulatory protein IclR  27.69 
 
 		 291 aa  86.3  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.406824  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1802  IclR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10190  putative transcriptional regulator  29.49 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.413507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  27.83 
 
 		 275 aa  82  0.000000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0337  IclR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 261 aa  78.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2258  transcriptional regulator, IclR family  24.36 
 
 		 280 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3148  IclR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174875  hitchhiker  0.0000000981116 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2311  IclR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.986469  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  24.41 
 
 		 265 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1560  regulatory proteins, IclR  30.33 
 
 		 286 aa  75.5  0.0000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  27.65 
 
 		 280 aa  75.5  0.0000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4432  IclR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  29.57 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  26.43 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0818  IclR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0589352  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0162  transcriptional regulator, IclR family  29.53 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>