More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4053 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4053  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 269 aa  527  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0738351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0425  IclR family transcriptional regulator  71.92 
 
 		 296 aa  386  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000742162  normal  0.768795 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7212  transcriptional regulator, IclR family  70.41 
 
 		 295 aa  381  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.858542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4215  IclR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 279 aa  343  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0336  IclR family transcriptional regulator  65.48 
 
 		 268 aa  315  5e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3216  IclR family transcriptional regulator  65.88 
 
 		 547 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4064  IclR family transcriptional regulator  65.88 
 
 		 551 aa  310  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4302  IclR family transcriptional regulator  65.88 
 
 		 551 aa  310  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.750126 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1712  IclR family transcriptional regulator  65.49 
 
 		 549 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4304  IclR family transcriptional regulator  67.45 
 
 		 569 aa  304  8.000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.443184 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3720  IclR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 554 aa  295  7e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.261625 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4196  IclR family transcriptional regulator  66.27 
 
 		 576 aa  294  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.858157  normal  0.133552 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4674  putative transcriptional regulatory protein  45.49 
 
 		 263 aa  209  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4052  IclR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 281 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000104088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4298  IclR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 279 aa  189  5e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0293  transcriptional regulator, IclR family  43.66 
 
 		 287 aa  186  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0848  transcriptional regulator, IclR family  43.45 
 
 		 275 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.130407  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4216  IclR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 264 aa  167  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0804  regulatory proteins, IclR  37.5 
 
 		 266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000542062  unclonable  0.0000000637978 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0113  IclR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 277 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0082  IclR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 285 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4533  IclR family transcriptional regulator  37.64 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000115279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7213  transcriptional regulator, IclR family  41.74 
 
 		 295 aa  159  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.33644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0581  IclR family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0154  transcriptional regulator, IclR family  37.26 
 
 		 292 aa  155  6e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.351671 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0161  transcriptional regulator, IclR family  36.5 
 
 		 290 aa  155  9e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.567451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0448  IclR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 262 aa  152  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1125  IclR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 259 aa  152  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0439  transcriptional regulator, IclR family  38.37 
 
 		 262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.545927  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0300  transcription regulator protein  35.06 
 
 		 290 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.9672 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0741  IclR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 260 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1516  transcriptional regulator, IclR family  35.94 
 
 		 271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.371505  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0361  IclR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 340 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4527  transcriptional regulator, IclR family  36 
 
 		 295 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0675359  normal  0.540679 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4659  transcriptional regulator, IclR family  36 
 
 		 295 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880576  normal  0.215321 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0481  transcriptional regulator, IclR family  33.85 
 
 		 300 aa  129  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_003296  RS01745  transcription regulator protein  35.18 
 
 		 311 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.264626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0384  IclR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 265 aa  129  7.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0235844  hitchhiker  0.00703834 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0599  IclR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0426  IclR family transcriptional regulator  44.98 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000895626  normal  0.732187 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2928  IclR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3215  IclR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0246  IclR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0078  IclR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.493125  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6256  IclR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2825  IclR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.619636 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1348  IclR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.102339  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0437  IclR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2299  IclR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0417  IclR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2913  IclR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.464233  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0445  IclR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 287 aa  127  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.915056 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4236  IclR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 299 aa  126  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.375859 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2962  IclR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 291 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0689  IclR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 274 aa  125  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.933931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0195  IclR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 296 aa  122  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0337  IclR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0391  IclR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 288 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797378  normal  0.0181315 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0156  transcriptional regulator, IclR family  33.59 
 
 		 302 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0163  transcriptional regulator, IclR family  33.59 
 
 		 302 aa  116  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0302  transcription regulator protein  32 
 
 		 295 aa  115  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5959  IclR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 271 aa  109  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0527246 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5276  regulatory protein, IclR  30.53 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.945753  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38500  IclR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 267 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3279  putative transcriptional regulator  31.95 
 
 		 267 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1458  transcriptional regulator, IclR family  29.59 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4482  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3598  transcriptional regulator, IclR family  31.2 
 
 		 273 aa  100  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1632  transcriptional regulator, IclR family  33.77 
 
 		 297 aa  100  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4930  putative IclR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 271 aa  98.6  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.622933 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3632  putative transcription regulator protein  37.01 
 
 		 274 aa  98.2  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.266279 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4622  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 277 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3394  regulatory protein, IclR  34.1 
 
 		 265 aa  97.4  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101533  normal  0.0303831 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0169  regulatory proteins, IclR  30.12 
 
 		 275 aa  97.1  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0724  IclR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 303 aa  95.1  9e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.778685  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0909  IclR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 264 aa  94  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3552  transcriptional regulator, IclR family  29.01 
 
 		 263 aa  94  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0816  IclR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 260 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4606  IclR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 262 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0481261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4742  regulatory proteins, IclR  27.46 
 
 		 281 aa  83.2  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0735  regulatory protein, IclR  29.49 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000567454 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3327  regulatory proteins, IclR  27.86 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736955 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2311  IclR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.986469  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  24.1 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  25.94 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3889  IclR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0628146  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2258  transcriptional regulator, IclR family  22.09 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2285  transcriptional regulator, IclR family  28.17 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3148  IclR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174875  hitchhiker  0.0000000981116 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1560  regulatory proteins, IclR  26.34 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3528  regulatory proteins, IclR  25.63 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  25.4 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3303  IclR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.870247  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10190  putative transcriptional regulator  29.13 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.413507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4086  regulatory protein IclR  28.33 
 
 		 291 aa  65.5  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.406824  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  23.92 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3858  IclR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.8679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0920  IclR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687031  normal  0.0182204 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>