More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7484 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7484  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 261 aa  506  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4608  IclR family transcriptional regulator  76.86 
 
 		 255 aa  377  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249268  normal  0.348784 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0496  regulatory protein, IclR  76.47 
 
 		 287 aa  375  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5126  transcriptional regulator, IclR family  70.98 
 
 		 255 aa  364  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3648  transcriptional regulator, IclR family  57.41 
 
 		 263 aa  275  4e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1022  Transcriptional regulator IclR  56.13 
 
 		 255 aa  251  1e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.157086  normal  0.728656 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5039  transcriptional regulator, IclR family  55.2 
 
 		 250 aa  229  3e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5303  transcriptional regulator, IclR family  54.15 
 
 		 253 aa  221  6e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1099  transcriptional regulator, IclR family  43.03 
 
 		 257 aa  168  9e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.544817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  36.05 
 
 		 280 aa  135  8e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  34.51 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  33.92 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  32.13 
 
 		 261 aa  119  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4095  IclR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 269 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129203  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  31.2 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  29.32 
 
 		 256 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 260 aa  115  7.999999999999999e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  30.77 
 
 		 257 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  32.03 
 
 		 275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  32.53 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  32.69 
 
 		 265 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 272 aa  109  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  34.9 
 
 		 269 aa  109  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  30.86 
 
 		 252 aa  106  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1912  IclR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 283 aa  105  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  29.69 
 
 		 258 aa  105  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 275 aa  106  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  26.56 
 
 		 252 aa  105  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2149  IclR family transcriptional regulator, putative  30.77 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  36.95 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  31.14 
 
 		 252 aa  103  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 284 aa  103  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 254 aa  102  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  29.13 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30950  transcriptional regulator, IclR family  34.68 
 
 		 277 aa  102  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  31.08 
 
 		 276 aa  102  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  30.87 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3360  IclR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233757  normal  0.0607813 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  30.04 
 
 		 280 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  30.04 
 
 		 280 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  30.04 
 
 		 280 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  31.52 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1381  transcriptional regulator, IclR family  35.12 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 260 aa  99.8  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  37.5 
 
 		 266 aa  99.4  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  37.5 
 
 		 266 aa  99.4  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 260 aa  99  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2380  IclR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 291 aa  99  7e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.610686  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  31.3 
 
 		 274 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  31.3 
 
 		 274 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  31.3 
 
 		 274 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6262  IclR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 260 aa  98.2  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  30.86 
 
 		 274 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  30.86 
 
 		 274 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  30.86 
 
 		 274 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  31.3 
 
 		 274 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3639  IclR family transcriptional regulator family  35.27 
 
 		 303 aa  98.6  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  31.3 
 
 		 274 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6211  IclR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 282 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.253024 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  31.3 
 
 		 274 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 269 aa  98.2  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  31.3 
 
 		 274 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  31.3 
 
 		 274 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  30.86 
 
 		 274 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  30.86 
 
 		 274 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6634  IclR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 283 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0992864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  30.47 
 
 		 275 aa  97.1  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0262  IclR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 275 aa  96.3  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0549  DNA-binding transcriptional repressor AllR  30.65 
 
 		 256 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0607  DNA-binding transcriptional repressor AllR  30.65 
 
 		 256 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00456  DNA-binding transcriptional repressor  30.65 
 
 		 271 aa  95.9  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.832726  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3116  DNA-binding transcriptional repressor AllR  30.65 
 
 		 271 aa  95.9  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.129581 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3106  transcriptional regulator, IclR family  30.65 
 
 		 271 aa  95.9  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0580  DNA-binding transcriptional repressor AllR  30.65 
 
 		 271 aa  95.9  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00461  hypothetical protein  30.65 
 
 		 271 aa  95.9  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0543  DNA-binding transcriptional repressor AllR  30.65 
 
 		 271 aa  95.9  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4718  IclR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 275 aa  95.9  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  31.74 
 
 		 277 aa  95.5  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6015  IclR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 263 aa  95.5  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4028  IclR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 263 aa  95.5  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4338  IclR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 263 aa  95.5  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6106  IclR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 280 aa  95.5  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.5704 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  30.47 
 
 		 277 aa  94.7  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1930  IclR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 261 aa  94.7  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2466  IclR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 262 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2511  regulatory proteins, IclR  32.81 
 
 		 262 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.433919 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0202  regulatory proteins, IclR  32.68 
 
 		 276 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0480  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  32.68 
 
 		 261 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2503  regulatory proteins, IclR  32.81 
 
 		 262 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0382  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  32.68 
 
 		 261 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1491  IclR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 285 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5247  IclR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 262 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2997  IclR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 275 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>