More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1099 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1099  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 257 aa  502  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.544817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5126  transcriptional regulator, IclR family  47.41 
 
 		 255 aa  205  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3648  transcriptional regulator, IclR family  46.27 
 
 		 263 aa  192  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1022  Transcriptional regulator IclR  46.03 
 
 		 255 aa  179  4e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.157086  normal  0.728656 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4608  IclR family transcriptional regulator  43.03 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249268  normal  0.348784 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7484  IclR family transcriptional regulator  43.03 
 
 		 261 aa  176  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0496  regulatory protein, IclR  43.03 
 
 		 287 aa  171  9e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5039  transcriptional regulator, IclR family  46.12 
 
 		 250 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5303  transcriptional regulator, IclR family  40.48 
 
 		 253 aa  145  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  32.94 
 
 		 261 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  32.93 
 
 		 255 aa  125  7e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  31.85 
 
 		 256 aa  122  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  35.48 
 
 		 280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  27.42 
 
 		 252 aa  118  9e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 261 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  32.53 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2259  IclR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 260 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.10057  hitchhiker  0.0000000211035 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  29.08 
 
 		 260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  34.8 
 
 		 269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  32.67 
 
 		 259 aa  108  6e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 254 aa  108  8.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 260 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  29.51 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 269 aa  107  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4095  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 269 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129203  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  28.69 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  28.69 
 
 		 260 aa  105  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  31.08 
 
 		 257 aa  105  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 267 aa  105  7e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2285  transcriptional regulator, IclR family  30.08 
 
 		 259 aa  105  7e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 272 aa  104  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5069  transcriptional regulator, IclR family  35.43 
 
 		 251 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.469933  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2670  transcriptional regulator, IclR family  27.8 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  29.3 
 
 		 258 aa  102  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0364  IclR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 265 aa  102  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  28.29 
 
 		 260 aa  102  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  33.86 
 
 		 256 aa  102  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1381  transcriptional regulator, IclR family  35.11 
 
 		 259 aa  102  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 268 aa  102  9e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  30.36 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0920  IclR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 282 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687031  normal  0.0182204 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 258 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6634  IclR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 283 aa  99.8  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0992864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  27.67 
 
 		 280 aa  99.4  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  27.67 
 
 		 280 aa  99.4  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  27.67 
 
 		 280 aa  99.4  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  29.55 
 
 		 257 aa  99.4  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  33.47 
 
 		 273 aa  99  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  34.54 
 
 		 266 aa  99  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  34.54 
 
 		 266 aa  99  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  32 
 
 		 261 aa  98.6  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  31.84 
 
 		 279 aa  97.8  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  36.05 
 
 		 258 aa  97.8  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1825  transcriptional regulator, IclR family  35.54 
 
 		 266 aa  98.2  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.191409  normal  0.0157827 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4201  transcriptional regulator, IclR family  31.62 
 
 		 254 aa  97.8  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  30.7 
 
 		 274 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  30.7 
 
 		 274 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 257 aa  97.4  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  34.2 
 
 		 257 aa  97.4  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  30.7 
 
 		 274 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  30.7 
 
 		 274 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  30.7 
 
 		 274 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 258 aa  97.1  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  30.7 
 
 		 274 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  30.7 
 
 		 274 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  30.7 
 
 		 274 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5102  transcriptional regulator, IclR family  34.84 
 
 		 268 aa  96.7  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.500204  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4346  regulatory protein, IclR  28.46 
 
 		 263 aa  97.1  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361524  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  29.64 
 
 		 275 aa  97.1  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2995  transcriptional regulator, IclR family  27.49 
 
 		 249 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.71341e-17 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  34.41 
 
 		 253 aa  95.9  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  29.72 
 
 		 263 aa  95.9  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  29.72 
 
 		 263 aa  95.9  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  29.72 
 
 		 263 aa  95.9  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  29.72 
 
 		 263 aa  95.9  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  29.72 
 
 		 263 aa  95.9  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3033  IclR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 249 aa  95.5  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000487376  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  26.21 
 
 		 252 aa  95.1  8e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2149  IclR family transcriptional regulator, putative  28.97 
 
 		 248 aa  95.1  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2785  IclR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 249 aa  95.1  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253598  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  31.28 
 
 		 308 aa  95.1  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2997  IclR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 249 aa  95.1  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4784  transcriptional regulator, IclR family  29.57 
 
 		 257 aa  95.1  9e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.820047  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  26.21 
 
 		 252 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  32.46 
 
 		 247 aa  94.7  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  28.32 
 
 		 254 aa  94.7  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  29.03 
 
 		 255 aa  95.1  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11734  transcriptional regulator  33.67 
 
 		 259 aa  94  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 284 aa  94  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 259 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2715  IclR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000240532  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  33.99 
 
 		 290 aa  93.6  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1166  IclR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 271 aa  93.6  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2997  transcriptional regulator, IclR family  26.29 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000293237  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 260 aa  93.2  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 261 aa  93.6  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>