More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5102 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5102  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 268 aa  533  1e-150  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.500204  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5123  transcriptional regulator, IclR family  34.65 
 
 		 255 aa  118  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  31.54 
 
 		 265 aa  107  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  31.98 
 
 		 256 aa  106  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 268 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 272 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  30.28 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  26.27 
 
 		 256 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3913  transcriptional regulator, IclR family  25 
 
 		 262 aa  99  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4105  transcriptional regulator, IclR family  25.2 
 
 		 262 aa  99  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 260 aa  98.6  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  26.23 
 
 		 263 aa  97.8  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  26.23 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 263 aa  97.8  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  30.28 
 
 		 261 aa  98.6  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4784  transcriptional regulator, IclR family  31.6 
 
 		 257 aa  97.8  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.820047  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  33.03 
 
 		 248 aa  96.7  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  29.2 
 
 		 257 aa  95.9  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.23 
 
 		 263 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  26.23 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  26.23 
 
 		 263 aa  94.7  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  26.23 
 
 		 263 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  26.23 
 
 		 263 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  26.23 
 
 		 263 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  26.23 
 
 		 263 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 263 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  33.18 
 
 		 276 aa  93.6  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1099  transcriptional regulator, IclR family  34.84 
 
 		 257 aa  92.4  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.544817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  24.59 
 
 		 254 aa  92.4  6e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 258 aa  92.8  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08220  transcriptional regulator, IclR family  31.75 
 
 		 257 aa  92  8e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  26.64 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2873  IclR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 269 aa  91.3  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  27.17 
 
 		 280 aa  90.9  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  25.51 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3261  IclR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 284 aa  90.1  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  25 
 
 		 263 aa  90.1  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 259 aa  89.7  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6211  IclR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 282 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.253024 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0547  transcriptional regulator, IclR family  29.18 
 
 		 265 aa  89.7  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  32.29 
 
 		 279 aa  89.7  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  32.13 
 
 		 258 aa  89  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  23.62 
 
 		 252 aa  88.6  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  25.41 
 
 		 263 aa  88.2  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 260 aa  87.8  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2466  IclR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 262 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2511  regulatory proteins, IclR  32.88 
 
 		 262 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.433919 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2503  regulatory proteins, IclR  32.88 
 
 		 262 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  29.03 
 
 		 260 aa  87.8  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  25.1 
 
 		 263 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  25.1 
 
 		 263 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  25.1 
 
 		 263 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  25.1 
 
 		 263 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  32 
 
 		 247 aa  87.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  25.1 
 
 		 263 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  24.59 
 
 		 278 aa  87  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  31.28 
 
 		 265 aa  87  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  28.38 
 
 		 308 aa  87  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  25.41 
 
 		 263 aa  85.9  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  28.79 
 
 		 262 aa  85.5  8e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  29.44 
 
 		 249 aa  85.5  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4923  regulatory proteins, IclR  31.53 
 
 		 266 aa  85.5  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2208  transcriptional regulator, IclR family  25.4 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 251 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0198  Transcriptional regulator IclR  28.24 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101079  normal  0.134776 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4475  transcriptional regulator, IclR family  28.51 
 
 		 258 aa  84.3  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0192379  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  30.81 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  29.64 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0265  transcriptional regulator, IclR family  31.25 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2287  transcriptional regulator, IclR family  28.97 
 
 		 267 aa  82.8  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  0.385963 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 269 aa  82  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  26.32 
 
 		 260 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2713  IclR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0235576  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0041  IclR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 288 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  30.58 
 
 		 246 aa  81.3  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2238  transcriptional regulator, IclR family  31.08 
 
 		 251 aa  81.6  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.399676  normal  0.216558 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  22.95 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1166  IclR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3965  IclR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4694  transcriptional regulator, IclR family  26.01 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.116545  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0696  IclR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.32521  hitchhiker  0.00513536 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38230  Transcriptional regulator PcaR  28.5 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  26.32 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  26.36 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  26.32 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5758  IclR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4374  transcriptional regulator, IclR family  26.91 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4375  transcriptional regulator, IclR family  30.18 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0211  transcriptional regulator IclR  23.29 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  24.22 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1265  IclR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 280 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  30.81 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3087  transcriptional regulator, TrmB  31.25 
 
 		 267 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515072  normal  0.390338 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>