More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3795 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3795  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 247 aa  498  1e-140  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433741 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0340  IclR family transcriptional regulator  45.49 
 
 		 272 aa  200  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.151352  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3613  IclR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 317 aa  142  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0993  IclR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 251 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.892724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3441  regulatory proteins, IclR  38.16 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7431  Transcriptional regulator  31.69 
 
 		 257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5598  Transcriptional regulator  34.08 
 
 		 246 aa  112  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0201808  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0615  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  35.78 
 
 		 261 aa  112  7.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6484  IclR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140944  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6719  IclR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.182238  normal  0.45322 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5810  IclR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 286 aa  106  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0160  transcriptional regulator, IclR family  33.16 
 
 		 244 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3331  IclR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 284 aa  104  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.181508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6466  transcriptional regulator, IclR family  33.8 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185933  normal  0.684135 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0473  regulatory protein IclR  24.38 
 
 		 244 aa  91.7  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4161  IclR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 247 aa  90.1  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2051  IclR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 249 aa  87  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0630504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1041  IclR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 258 aa  87  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0399426 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4409  transcriptional regulator, IclR family  29.7 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2392  transcriptional regulator, IclR family  28.51 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5886  transcriptional regulator, IclR family  30.37 
 
 		 252 aa  79  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2799  transcriptional regulator, IclR family  29.72 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0824  transcriptional regulator, IclR family  32.99 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23190  putative transcriptional regulator  29.27 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144138 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2803  IclR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.323912 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1955  putative transcriptional regulator  29.31 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6800  transcriptional regulator, IclR family  29.36 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8019  putative transcriptional regulator, IclR  30.41 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1592  IclR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.885509 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2810  IclR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 247 aa  72  0.000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.162852  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2316  IclR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 246 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812394  normal  0.959704 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3303  IclR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 244 aa  71.6  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.870247  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2287  transcriptional regulator, IclR family  28.23 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  0.385963 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1595  IclR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  30.54 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0105  putative transcriptional regulator  29.08 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6121  transcriptional regulator IclR family  27.83 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0625  regulatory proteins, IclR  31.05 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916177  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5543  regulatory protein, IclR  30.27 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.452687  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0043  transcriptional regulator, IclR family  32.18 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1830  transcriptional regulator, IclR family  28.75 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135773  normal  0.345416 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0808  transcriptional regulator, IclR family  28.1 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4595  IclR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05447  hypothetical protein  25.91 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2514  IclR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0302  transcription regulator protein  27.83 
 
 		 295 aa  67  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2078  transcriptional regulator, IclR family  30.77 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.341471 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0378  IclR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 263 aa  67  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.105767  normal  0.274067 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1930  IclR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20110  transcriptional regulator  29.78 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2324  regulatory protein IclR  25.93 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000642248  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2248  transcriptional regulator, IclR family  24.69 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.000278056 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1087  transcriptional regulator, IclR family  29.03 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2785  IclR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253598  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2997  IclR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  26.05 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3031  transcriptional regulator, IclR family  25.1 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  26.26 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2715  IclR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000240532  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2381  IclR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 279 aa  65.5  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1900  regulatory proteins, IclR  30.88 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.417398 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1920  IclR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1966  regulatory proteins, IclR  30.88 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1595  IclR-type transcriptional regulator  28.43 
 
 		 266 aa  65.1  0.0000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0184  transcriptional regulator, IclR family  28.38 
 
 		 244 aa  65.1  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2995  transcriptional regulator, IclR family  25.1 
 
 		 249 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.71341e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3033  IclR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000487376  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3299  regulatory proteins, IclR  29.46 
 
 		 240 aa  65.1  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395884  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  28.93 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3464  transcriptional regulator, IclR family  32.43 
 
 		 239 aa  65.1  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108588  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001509  transcriptional regulator  25.45 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  28.77 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3326  transcriptional regulator, IclR family  31.25 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.021393  hitchhiker  0.00795692 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2734  IclR family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.16584e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  26.17 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  22.36 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  22.36 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5091  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  29.38 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2380  IclR family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.102909  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1357  Transcriptional regulator IclR  32.11 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.775388 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5019  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  28.17 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.563485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2997  transcriptional regulator, IclR family  24.27 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000293237  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3036  IclR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0639  transcriptional regulator PcaR, putative  25.86 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3424  transcriptional regulator, IclR family  29.41 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  26.98 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0156  transcriptional regulator, IclR family  26.89 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0163  transcriptional regulator, IclR family  26.89 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  26.51 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18570  transcriptional regulator, IclR family  30.6 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.424296  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4440  regulatory protein IclR  24.3 
 
 		 276 aa  62  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5311  regulatory protein, IclR  25.57 
 
 		 282 aa  62  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>