More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3299 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3299  regulatory proteins, IclR  100 
 
 		 240 aa  459  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395884  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2317  transcriptional regulator, IclR family  80.67 
 
 		 239 aa  376  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2358  transcriptional regulator, IclR family  81.43 
 
 		 239 aa  377  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1686  transcriptional regulator, IclR family  78.75 
 
 		 246 aa  373  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.698509  normal  0.0109367 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1572  transcriptional regulator, IclR family  79.24 
 
 		 240 aa  369  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.358394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11090  transcriptional regulator, IclR family  79.32 
 
 		 239 aa  368  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8050  transcriptional regulator, IclR family  79.66 
 
 		 238 aa  370  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8019  putative transcriptional regulator, IclR  77.64 
 
 		 238 aa  367  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2803  IclR family transcriptional regulator  76.79 
 
 		 241 aa  363  2e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.323912 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18570  transcriptional regulator, IclR family  76.05 
 
 		 244 aa  361  5.0000000000000005e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.424296  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2520  IclR family transcriptional regulator  73.73 
 
 		 239 aa  345  4e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.463274  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2257  transcriptional regulator, IclR family  73.31 
 
 		 239 aa  344  5e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000173115 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0625  regulatory proteins, IclR  74.79 
 
 		 240 aa  340  1e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916177  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3464  transcriptional regulator, IclR family  75.21 
 
 		 239 aa  337  9.999999999999999e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108588  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0184  transcriptional regulator, IclR family  73 
 
 		 244 aa  326  2.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08730  transcriptional regulator  69.53 
 
 		 258 aa  319  1.9999999999999998e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00649547  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1357  Transcriptional regulator IclR  73.97 
 
 		 238 aa  314  8e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.775388 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1595  IclR-type transcriptional regulator  65.67 
 
 		 266 aa  312  1.9999999999999998e-84  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1592  IclR family transcriptional regulator  69.75 
 
 		 238 aa  310  2e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.885509 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1257  regulatory protein, IclR  63.88 
 
 		 228 aa  249  3e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411018  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1148  IclR family transcriptional regulator  63.44 
 
 		 228 aa  248  5e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.554824  unclonable  0.0000000376636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5000  transcriptional regulator, IclR family  60.34 
 
 		 232 aa  240  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272233  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1112  IclR family transcriptional regulator  60.26 
 
 		 307 aa  237  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.794209 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3216  Transcriptional regulator IclR  60.09 
 
 		 244 aa  234  7e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15602  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3622  IclR family transcriptional regulator  62.1 
 
 		 235 aa  228  6e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.464151 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1477  transcriptional regulator, IclR family  60.19 
 
 		 237 aa  223  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.958166  normal  0.570733 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1966  regulatory proteins, IclR  56.02 
 
 		 233 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1920  IclR family transcriptional regulator  56.02 
 
 		 233 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245854  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4228  regulatory protein, IclR  57.41 
 
 		 233 aa  223  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1900  regulatory proteins, IclR  56.02 
 
 		 233 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.417398 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2134  regulatory proteins, IclR  56.02 
 
 		 233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2849  transcriptional regulator, IclR family  57.39 
 
 		 241 aa  215  4e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6007  transcriptional regulator, IclR family  56.48 
 
 		 233 aa  213  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.325748  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09050  transcriptional regulator  57.08 
 
 		 220 aa  207  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.976325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13004  transcriptional regulator  55.56 
 
 		 233 aa  204  8e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0276  IclR family transcriptional regulator  54.04 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4054  transcriptional regulator, IclR family  54.04 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  34.16 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4142  putative IclR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 258 aa  102  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000218071  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4961  IclR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 248 aa  96.7  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.790351  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  36.74 
 
 		 273 aa  96.7  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4515  IclR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 242 aa  95.9  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.390313  normal  0.426328 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0195  transcriptional regulator, IclR family  31.51 
 
 		 277 aa  94.7  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3984  regulatory proteins, IclR  35.81 
 
 		 270 aa  92.4  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104797  normal  0.0879634 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5349  IclR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 273 aa  92  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4808  IclR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 273 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2968  IclR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 243 aa  88.6  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.980752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1720  IclR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 249 aa  88.2  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 249 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 249 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2914  IclR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 249 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1950  IclR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 249 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400846  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 249 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2234  IclR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 249 aa  87  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4803  IclR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 272 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.898602 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 262 aa  85.9  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 249 aa  85.5  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 249 aa  85.5  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4039  transcriptional regulator, IclR family  32.39 
 
 		 264 aa  85.1  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4151  transcriptional regulator, IclR family  32.39 
 
 		 264 aa  85.1  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  35.11 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5395  IclR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 272 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374154  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5466  IclR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 272 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4281  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  33.2 
 
 		 276 aa  83.2  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  33.8 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  28.63 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  30.64 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4142  IclR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3341  IclR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7080  Transcriptional regulator  27.23 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3842  putative transcriptional regulator  28.31 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312233  normal  0.510339 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3734  putative transcriptional regulator  28.31 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3903  putative transcriptional regulator  28.31 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.575083  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3800  putative transcriptional regulator  28.31 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0454  transcriptional regulator, IclR family  31.8 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 256 aa  78.6  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  36.4 
 
 		 257 aa  78.6  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4923  regulatory proteins, IclR  31.78 
 
 		 266 aa  78.6  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1830  transcriptional regulator, IclR family  32.71 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135773  normal  0.345416 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2981  transcriptional regulator, IclR family  32.55 
 
 		 285 aa  78.2  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  29.61 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2031  IclR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1381  transcriptional regulator, IclR family  32.91 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  28.69 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4433  regulatory proteins, IclR  28.94 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4012  transcriptional regulator, IclR family  28.51 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 255 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 255 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 255 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6316  IclR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3729  IclR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2078  transcriptional regulator, IclR family  35.61 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.341471 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  29.64 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>