More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6316 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6316  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 251 aa  512  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4803  IclR family transcriptional regulator  73 
 
 		 272 aa  289  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.898602 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5395  IclR family transcriptional regulator  73 
 
 		 272 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374154  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5466  IclR family transcriptional regulator  73 
 
 		 272 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4808  IclR family transcriptional regulator  71 
 
 		 273 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5349  IclR family transcriptional regulator  71 
 
 		 273 aa  279  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4012  transcriptional regulator, IclR family  42.49 
 
 		 254 aa  152  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4142  putative IclR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000218071  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4151  transcriptional regulator, IclR family  41.45 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4039  transcriptional regulator, IclR family  41.45 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7080  Transcriptional regulator  40.93 
 
 		 231 aa  143  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1950  IclR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 249 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400846  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 249 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2914  IclR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 249 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 249 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 249 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2234  IclR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 249 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1720  IclR family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4961  IclR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 248 aa  135  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.790351  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2968  IclR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.980752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0454  transcriptional regulator, IclR family  41.11 
 
 		 246 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4515  IclR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 242 aa  125  9e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.390313  normal  0.426328 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4281  IclR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 266 aa  121  8e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2721  IclR family transcriptional regulator  38 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3984  regulatory proteins, IclR  35.27 
 
 		 270 aa  119  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104797  normal  0.0879634 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4871  IclR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 236 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.721296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5463  IclR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 236 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5399  IclR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 236 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438865  decreased coverage  0.00269642 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4617  IclR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 242 aa  112  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8325  transcriptional regulator, IclR family  35.33 
 
 		 234 aa  112  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4707  IclR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3208  IclR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 256 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.129719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6026  IclR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.221801 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4432  IclR family transcriptional regulator family  38.54 
 
 		 334 aa  108  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.199706 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4142  IclR family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 250 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5624  IclR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3982  transcriptional regulator, IclR family  31.44 
 
 		 236 aa  93.2  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4095  transcriptional regulator, IclR family  31.44 
 
 		 236 aa  93.2  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267726  normal  0.126686 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3326  transcriptional regulator, IclR family  30.73 
 
 		 255 aa  91.7  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.021393  hitchhiker  0.00795692 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0276  IclR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 237 aa  89.4  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0625  regulatory proteins, IclR  31.9 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916177  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  35.23 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2803  IclR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 241 aa  82  0.000000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.323912 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0416  regulatory proteins, IclR  25.7 
 
 		 246 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000505949  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0195  transcriptional regulator, IclR family  28.51 
 
 		 277 aa  80.5  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2078  transcriptional regulator, IclR family  29.79 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.341471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  30.81 
 
 		 273 aa  79.7  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1830  transcriptional regulator, IclR family  30.29 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135773  normal  0.345416 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4228  regulatory protein, IclR  31.11 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2849  transcriptional regulator, IclR family  30.06 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6634  IclR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 283 aa  78.6  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0992864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8019  putative transcriptional regulator, IclR  30.14 
 
 		 238 aa  78.6  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1239  IclR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1595  IclR-type transcriptional regulator  28.89 
 
 		 266 aa  77.4  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0184  transcriptional regulator, IclR family  31.53 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2134  regulatory proteins, IclR  30.56 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1920  IclR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1966  regulatory proteins, IclR  30.6 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1900  regulatory proteins, IclR  30.6 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.417398 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1357  Transcriptional regulator IclR  31.25 
 
 		 238 aa  75.1  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.775388 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  31.58 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13004  transcriptional regulator  30.73 
 
 		 233 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3299  regulatory proteins, IclR  30.99 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395884  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2520  IclR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.463274  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2257  transcriptional regulator, IclR family  30.56 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000173115 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1592  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.885509 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18570  transcriptional regulator, IclR family  30.1 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.424296  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3928  IclR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5543  regulatory protein, IclR  26.09 
 
 		 241 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.452687  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1686  transcriptional regulator, IclR family  30.56 
 
 		 246 aa  71.6  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.698509  normal  0.0109367 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3089  transcriptional regulator, IclR family  25.57 
 
 		 250 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3622  IclR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.464151 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3296  IclR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4054  transcriptional regulator, IclR family  30.1 
 
 		 233 aa  71.6  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2358  transcriptional regulator, IclR family  30.99 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1112  IclR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.794209 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11090  transcriptional regulator, IclR family  30.39 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3216  Transcriptional regulator IclR  31.32 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15602  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3730  regulatory protein IclR  29.07 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.619654 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3884  transcriptional regulator, IclR family  25.68 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2317  transcriptional regulator, IclR family  30.73 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3464  transcriptional regulator, IclR family  27.6 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108588  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3687  transcriptional regulator, IclR family  25.23 
 
 		 272 aa  68.9  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2850  IclR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 250 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526346  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  28.5 
 
 		 260 aa  68.6  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  25.86 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08730  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00649547  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1148  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 228 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.554824  unclonable  0.0000000376636 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1572  transcriptional regulator, IclR family  27.88 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.358394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3103  transcriptional regulator, IclR family  25.23 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  26.06 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  28.06 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1257  regulatory protein, IclR  30 
 
 		 228 aa  67  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411018  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  27.08 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2875  IclR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2883  IclR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 250 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0306717  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>