More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2968 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2968  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 243 aa  480  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.980752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4515  IclR family transcriptional regulator  62.61 
 
 		 242 aa  292  3e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.390313  normal  0.426328 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0454  transcriptional regulator, IclR family  64.46 
 
 		 246 aa  288  8e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4961  IclR family transcriptional regulator  61.34 
 
 		 248 aa  261  8.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.790351  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4142  putative IclR family transcriptional regulator  58.16 
 
 		 258 aa  260  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000218071  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4039  transcriptional regulator, IclR family  45.78 
 
 		 264 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4151  transcriptional regulator, IclR family  45.78 
 
 		 264 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4012  transcriptional regulator, IclR family  44.91 
 
 		 254 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4803  IclR family transcriptional regulator  47.34 
 
 		 272 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.898602 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5395  IclR family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 272 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374154  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5466  IclR family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 272 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4281  IclR family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 266 aa  165  8e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1950  IclR family transcriptional regulator  44.6 
 
 		 249 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400846  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  44.6 
 
 		 249 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  44.6 
 
 		 249 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2914  IclR family transcriptional regulator  44.6 
 
 		 249 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  44.6 
 
 		 249 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  44.13 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  44.13 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5349  IclR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 273 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4808  IclR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 273 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5624  IclR family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 234 aa  159  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2234  IclR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 249 aa  158  9e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1720  IclR family transcriptional regulator  42.29 
 
 		 249 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4142  IclR family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 250 aa  157  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8325  transcriptional regulator, IclR family  39.05 
 
 		 234 aa  153  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7080  Transcriptional regulator  40.89 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3984  regulatory proteins, IclR  40.82 
 
 		 270 aa  142  5e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104797  normal  0.0879634 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6316  IclR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4617  IclR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2721  IclR family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 247 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4432  IclR family transcriptional regulator family  38.22 
 
 		 334 aa  122  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.199706 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4871  IclR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 236 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.721296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5463  IclR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 236 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5399  IclR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 236 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438865  decreased coverage  0.00269642 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3208  IclR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 256 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.129719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6026  IclR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 236 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.221801 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4707  IclR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 236 aa  105  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4095  transcriptional regulator, IclR family  36.41 
 
 		 236 aa  99.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267726  normal  0.126686 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3982  transcriptional regulator, IclR family  36.41 
 
 		 236 aa  99.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2803  IclR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 241 aa  99.4  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.323912 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0625  regulatory proteins, IclR  34.04 
 
 		 240 aa  98.6  8e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916177  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8019  putative transcriptional regulator, IclR  34.21 
 
 		 238 aa  97.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1148  IclR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 228 aa  97.4  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.554824  unclonable  0.0000000376636 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 252 aa  96.7  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11090  transcriptional regulator, IclR family  34.91 
 
 		 239 aa  96.7  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1592  IclR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 238 aa  96.3  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.885509 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1257  regulatory protein, IclR  33.19 
 
 		 228 aa  95.9  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411018  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1112  IclR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 307 aa  94.4  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.794209 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1595  IclR-type transcriptional regulator  31.6 
 
 		 266 aa  93.6  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1686  transcriptional regulator, IclR family  34.05 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.698509  normal  0.0109367 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18570  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 244 aa  92.8  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.424296  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2317  transcriptional regulator, IclR family  34.48 
 
 		 239 aa  92.8  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2134  regulatory proteins, IclR  33.8 
 
 		 233 aa  91.7  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  30 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0195  transcriptional regulator, IclR family  29.41 
 
 		 277 aa  90.1  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1830  transcriptional regulator, IclR family  31.82 
 
 		 264 aa  90.1  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135773  normal  0.345416 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2358  transcriptional regulator, IclR family  34.05 
 
 		 239 aa  89.7  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0650  transcriptional regulator, IclR family  32.03 
 
 		 263 aa  89  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0276  IclR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 237 aa  89  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3299  regulatory proteins, IclR  34.06 
 
 		 240 aa  88.6  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395884  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  30.34 
 
 		 295 aa  88.6  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08730  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00649547  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0184  transcriptional regulator, IclR family  32.59 
 
 		 244 aa  87.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1900  regulatory proteins, IclR  32.39 
 
 		 233 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.417398 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1920  IclR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 233 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1966  regulatory proteins, IclR  32.39 
 
 		 233 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  29.92 
 
 		 273 aa  87.8  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0416  regulatory proteins, IclR  23.18 
 
 		 246 aa  86.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000505949  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1572  transcriptional regulator, IclR family  32.76 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.358394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4054  transcriptional regulator, IclR family  34.07 
 
 		 233 aa  86.7  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3089  transcriptional regulator, IclR family  22.61 
 
 		 250 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 268 aa  85.5  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4081  IclR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3622  IclR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 235 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.464151 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  25.97 
 
 		 253 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4228  regulatory protein, IclR  32.24 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2520  IclR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.463274  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4506  transcriptional regulator, IclR family  30.68 
 
 		 275 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4638  transcriptional regulator, IclR family  30.68 
 
 		 275 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214771  normal  0.0505557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8050  transcriptional regulator, IclR family  32.89 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5000  transcriptional regulator, IclR family  30.84 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272233  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09050  transcriptional regulator  36.13 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.976325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3121  transcriptional regulator, IclR family  22.17 
 
 		 250 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0492  IclR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  25 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2257  transcriptional regulator, IclR family  34.06 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000173115 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2811  IclR family transcriptional regulator  22.17 
 
 		 250 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.667309  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3103  transcriptional regulator, IclR family  22.17 
 
 		 250 aa  82  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13004  transcriptional regulator  33.8 
 
 		 233 aa  81.6  0.000000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2883  IclR family transcriptional regulator  22.17 
 
 		 250 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0306717  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2850  IclR family transcriptional regulator  22.17 
 
 		 250 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526346  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3098  IclR family transcriptional regulator  22.17 
 
 		 250 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0903257  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3122  IclR family transcriptional regulator  21.74 
 
 		 250 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.255406  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3974  transcriptional regulator, IclR family  31.09 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.482822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2147  transcriptional regulator, IclR family  22.17 
 
 		 250 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2875  IclR family transcriptional regulator  22.17 
 
 		 250 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3857  transcriptional regulator, IclR family  31.43 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1955  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1357  Transcriptional regulator IclR  33.49 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.775388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>