More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8050 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8050  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 238 aa  461  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1686  transcriptional regulator, IclR family  82.77 
 
 		 246 aa  389  1e-107  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.698509  normal  0.0109367 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2317  transcriptional regulator, IclR family  81.78 
 
 		 239 aa  381  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11090  transcriptional regulator, IclR family  81.78 
 
 		 239 aa  381  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1572  transcriptional regulator, IclR family  82.2 
 
 		 240 aa  384  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.358394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2358  transcriptional regulator, IclR family  80.93 
 
 		 239 aa  373  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8019  putative transcriptional regulator, IclR  79.83 
 
 		 238 aa  373  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2803  IclR family transcriptional regulator  80.08 
 
 		 241 aa  370  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.323912 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18570  transcriptional regulator, IclR family  80.43 
 
 		 244 aa  370  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.424296  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3299  regulatory proteins, IclR  79.66 
 
 		 240 aa  370  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395884  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2520  IclR family transcriptional regulator  76.47 
 
 		 239 aa  353  1e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.463274  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2257  transcriptional regulator, IclR family  76.05 
 
 		 239 aa  352  2e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000173115 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0625  regulatory proteins, IclR  74.37 
 
 		 240 aa  342  2.9999999999999997e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916177  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3464  transcriptional regulator, IclR family  76.47 
 
 		 239 aa  340  1e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108588  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0184  transcriptional regulator, IclR family  74.26 
 
 		 244 aa  332  2e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08730  transcriptional regulator  69.79 
 
 		 258 aa  321  7e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00649547  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1357  Transcriptional regulator IclR  73.97 
 
 		 238 aa  316  2e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.775388 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1592  IclR family transcriptional regulator  71.61 
 
 		 238 aa  314  7e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.885509 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1595  IclR-type transcriptional regulator  65.65 
 
 		 266 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1148  IclR family transcriptional regulator  67.84 
 
 		 228 aa  265  5e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.554824  unclonable  0.0000000376636 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1257  regulatory protein, IclR  67.84 
 
 		 228 aa  264  1e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411018  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5000  transcriptional regulator, IclR family  62.5 
 
 		 232 aa  250  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272233  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1112  IclR family transcriptional regulator  60.26 
 
 		 307 aa  241  6e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.794209 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3622  IclR family transcriptional regulator  62.1 
 
 		 235 aa  228  5e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.464151 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1966  regulatory proteins, IclR  58.33 
 
 		 233 aa  222  4e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1920  IclR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 233 aa  222  4e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245854  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1900  regulatory proteins, IclR  58.33 
 
 		 233 aa  222  4e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.417398 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2134  regulatory proteins, IclR  59.26 
 
 		 233 aa  221  7e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1477  transcriptional regulator, IclR family  59.91 
 
 		 237 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.958166  normal  0.570733 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3216  Transcriptional regulator IclR  57.75 
 
 		 244 aa  219  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15602  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4228  regulatory protein, IclR  59.26 
 
 		 233 aa  218  6e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4054  transcriptional regulator, IclR family  56.6 
 
 		 233 aa  211  5.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0276  IclR family transcriptional regulator  55.74 
 
 		 237 aa  210  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6007  transcriptional regulator, IclR family  57.41 
 
 		 233 aa  209  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.325748  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13004  transcriptional regulator  57.87 
 
 		 233 aa  208  7e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09050  transcriptional regulator  58.53 
 
 		 220 aa  206  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.976325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2849  transcriptional regulator, IclR family  56.47 
 
 		 241 aa  203  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  36.24 
 
 		 252 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4515  IclR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 242 aa  96.7  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.390313  normal  0.426328 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3984  regulatory proteins, IclR  36.97 
 
 		 270 aa  96.3  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104797  normal  0.0879634 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5349  IclR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 273 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4039  transcriptional regulator, IclR family  33.81 
 
 		 264 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4151  transcriptional regulator, IclR family  33.81 
 
 		 264 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  35.75 
 
 		 273 aa  93.6  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4281  IclR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 266 aa  92.4  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4808  IclR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 273 aa  92  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4803  IclR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 272 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.898602 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2981  transcriptional regulator, IclR family  35.66 
 
 		 285 aa  89.4  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4961  IclR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 248 aa  88.6  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.790351  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5395  IclR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 272 aa  88.6  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374154  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5466  IclR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 272 aa  88.6  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1720  IclR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 249 aa  87.8  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 249 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 249 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1950  IclR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 249 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400846  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 249 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2914  IclR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 249 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4142  putative IclR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 258 aa  87.8  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000218071  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2234  IclR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 249 aa  86.7  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0195  transcriptional regulator, IclR family  30.73 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2968  IclR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.980752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7080  Transcriptional regulator  27.23 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4095  IclR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129203  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4012  transcriptional regulator, IclR family  29.36 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  31.46 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4142  IclR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 250 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0454  transcriptional regulator, IclR family  32.2 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3734  putative transcriptional regulator  29.02 
 
 		 251 aa  79.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3903  putative transcriptional regulator  29.02 
 
 		 251 aa  79.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.575083  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3842  putative transcriptional regulator  29.02 
 
 		 251 aa  79.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312233  normal  0.510339 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3800  putative transcriptional regulator  29.02 
 
 		 251 aa  79.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1381  transcriptional regulator, IclR family  33.94 
 
 		 259 aa  79  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0091  transcriptional regulator, IclR family  31.17 
 
 		 266 aa  79  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 262 aa  78.6  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  33.48 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4432  IclR family transcriptional regulator family  31.65 
 
 		 334 aa  77.4  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.199706 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  29.44 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2380  IclR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.610686  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  30.09 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1309  IclR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2270  transcriptional regulator, IclR family  30.89 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5624  IclR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1608  transcriptional regulator, IclR family  32.89 
 
 		 265 aa  75.5  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0247666  normal  0.511449 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1936  transcriptional regulator, IclR family  32.89 
 
 		 265 aa  75.5  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00885833 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1205  IclR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 261 aa  75.1  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230361  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4617  IclR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19700  transcriptional regulator, IclR family  35.59 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.089385  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2721  IclR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4433  regulatory proteins, IclR  28.82 
 
 		 254 aa  75.1  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343959  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1610  transcription regulator protein  32.46 
 
 		 266 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4891  IclR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4707  IclR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3676  IclR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4923  regulatory proteins, IclR  31.65 
 
 		 266 aa  73.9  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877822  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>