More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1686 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1686  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 246 aa  477  1e-134  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.698509  normal  0.0109367 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11090  transcriptional regulator, IclR family  96.23 
 
 		 239 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2317  transcriptional regulator, IclR family  90.38 
 
 		 239 aa  431  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1572  transcriptional regulator, IclR family  90.38 
 
 		 240 aa  429  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.358394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2358  transcriptional regulator, IclR family  90.79 
 
 		 239 aa  429  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18570  transcriptional regulator, IclR family  83.05 
 
 		 244 aa  389  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.424296  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8050  transcriptional regulator, IclR family  82.77 
 
 		 238 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8019  putative transcriptional regulator, IclR  78.99 
 
 		 238 aa  373  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3299  regulatory proteins, IclR  78.75 
 
 		 240 aa  373  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395884  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2803  IclR family transcriptional regulator  77.22 
 
 		 241 aa  365  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.323912 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2520  IclR family transcriptional regulator  75.73 
 
 		 239 aa  358  5e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.463274  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2257  transcriptional regulator, IclR family  75.31 
 
 		 239 aa  357  8e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000173115 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0625  regulatory proteins, IclR  72.27 
 
 		 240 aa  335  2.9999999999999997e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916177  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3464  transcriptional regulator, IclR family  74.79 
 
 		 239 aa  335  5.999999999999999e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108588  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08730  transcriptional regulator  71.67 
 
 		 258 aa  333  2e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00649547  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1357  Transcriptional regulator IclR  73.52 
 
 		 238 aa  318  3e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.775388 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0184  transcriptional regulator, IclR family  69.2 
 
 		 244 aa  319  3e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1595  IclR-type transcriptional regulator  67.81 
 
 		 266 aa  316  2e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1592  IclR family transcriptional regulator  69.49 
 
 		 238 aa  311  9e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.885509 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1148  IclR family transcriptional regulator  64.32 
 
 		 228 aa  262  4.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.554824  unclonable  0.0000000376636 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1257  regulatory protein, IclR  63.44 
 
 		 228 aa  260  1e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411018  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5000  transcriptional regulator, IclR family  59.91 
 
 		 232 aa  245  4e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272233  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1112  IclR family transcriptional regulator  60.26 
 
 		 307 aa  239  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.794209 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3216  Transcriptional regulator IclR  56.34 
 
 		 244 aa  220  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15602  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2134  regulatory proteins, IclR  57.41 
 
 		 233 aa  217  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4228  regulatory protein, IclR  56.94 
 
 		 233 aa  217  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1900  regulatory proteins, IclR  55.56 
 
 		 233 aa  215  4e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.417398 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3622  IclR family transcriptional regulator  60.27 
 
 		 235 aa  216  4e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.464151 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1920  IclR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 233 aa  215  4e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1966  regulatory proteins, IclR  55.56 
 
 		 233 aa  215  4e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0276  IclR family transcriptional regulator  55.74 
 
 		 237 aa  215  5e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1477  transcriptional regulator, IclR family  58.33 
 
 		 237 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.958166  normal  0.570733 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6007  transcriptional regulator, IclR family  55.56 
 
 		 233 aa  207  9e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.325748  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4054  transcriptional regulator, IclR family  54.47 
 
 		 233 aa  205  6e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13004  transcriptional regulator  54.63 
 
 		 233 aa  204  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09050  transcriptional regulator  54.55 
 
 		 220 aa  197  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.976325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2849  transcriptional regulator, IclR family  53.98 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  35.91 
 
 		 252 aa  105  8e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4515  IclR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.390313  normal  0.426328 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3984  regulatory proteins, IclR  36.49 
 
 		 270 aa  98.6  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104797  normal  0.0879634 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4281  IclR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 266 aa  98.2  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2968  IclR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 243 aa  94  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.980752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 249 aa  91.7  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1950  IclR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 249 aa  91.7  9e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400846  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 249 aa  91.7  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2914  IclR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 249 aa  91.7  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 249 aa  91.7  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2234  IclR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 249 aa  91.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5349  IclR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 273 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4142  putative IclR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 258 aa  90.9  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000218071  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4961  IclR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 248 aa  90.1  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.790351  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4808  IclR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 273 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4039  transcriptional regulator, IclR family  32.86 
 
 		 264 aa  89  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4151  transcriptional regulator, IclR family  32.86 
 
 		 264 aa  89  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 249 aa  88.6  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 249 aa  88.6  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1720  IclR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 249 aa  88.6  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4803  IclR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 272 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.898602 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2981  transcriptional regulator, IclR family  35.24 
 
 		 285 aa  85.9  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3842  putative transcriptional regulator  28.12 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312233  normal  0.510339 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  31.92 
 
 		 249 aa  85.1  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3734  putative transcriptional regulator  28.12 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3800  putative transcriptional regulator  28.12 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5395  IclR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 272 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374154  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3903  putative transcriptional regulator  28.12 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.575083  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0454  transcriptional regulator, IclR family  32.64 
 
 		 246 aa  85.1  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5466  IclR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 272 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1381  transcriptional regulator, IclR family  32.64 
 
 		 259 aa  83.6  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0195  transcriptional regulator, IclR family  28.22 
 
 		 277 aa  82.8  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  30.74 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4617  IclR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0091  transcriptional regulator, IclR family  31.3 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  32.23 
 
 		 273 aa  79.7  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4012  transcriptional regulator, IclR family  29.11 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7080  Transcriptional regulator  26.53 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1830  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135773  normal  0.345416 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  34.36 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2270  transcriptional regulator, IclR family  31.36 
 
 		 269 aa  77  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2721  IclR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4142  IclR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  34.98 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 276 aa  75.9  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2380  IclR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 291 aa  75.1  0.0000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.610686  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4574  IclR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0696248  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2370  IclR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4923  regulatory proteins, IclR  30.62 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2078  transcriptional regulator, IclR family  32.05 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.341471 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4707  IclR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  27.43 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4432  IclR family transcriptional regulator family  31.12 
 
 		 334 aa  72.8  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.199706 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3729  IclR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  32.39 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0724  transcriptional regulator, IclR family  32.08 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0508551 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5397  transcriptional regulator, IclR family  31.63 
 
 		 261 aa  72  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0050  IclR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 257 aa  72  0.000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5624  IclR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 234 aa  72  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8325  transcriptional regulator, IclR family  29.24 
 
 		 234 aa  72  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3676  IclR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>