More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4617 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4617  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 242 aa  490  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6026  IclR family transcriptional regulator  68.94 
 
 		 236 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.221801 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4871  IclR family transcriptional regulator  68.09 
 
 		 236 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.721296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5399  IclR family transcriptional regulator  68.09 
 
 		 236 aa  310  9e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438865  decreased coverage  0.00269642 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5463  IclR family transcriptional regulator  68.09 
 
 		 236 aa  310  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4707  IclR family transcriptional regulator  66.38 
 
 		 236 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4095  transcriptional regulator, IclR family  71.19 
 
 		 236 aa  300  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267726  normal  0.126686 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3982  transcriptional regulator, IclR family  71.19 
 
 		 236 aa  300  1e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2721  IclR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 247 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5624  IclR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8325  transcriptional regulator, IclR family  40.09 
 
 		 234 aa  156  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4142  IclR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 250 aa  156  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4432  IclR family transcriptional regulator family  38.18 
 
 		 334 aa  135  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.199706 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4142  putative IclR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 258 aa  132  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000218071  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4961  IclR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.790351  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1950  IclR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 249 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400846  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2914  IclR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 249 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 249 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 249 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 249 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2234  IclR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 249 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 249 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4151  transcriptional regulator, IclR family  37.89 
 
 		 264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2968  IclR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.980752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 249 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4039  transcriptional regulator, IclR family  37.89 
 
 		 264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4515  IclR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 242 aa  124  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.390313  normal  0.426328 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5349  IclR family transcriptional regulator  39 
 
 		 273 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4808  IclR family transcriptional regulator  39 
 
 		 273 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7080  Transcriptional regulator  34.65 
 
 		 231 aa  123  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4803  IclR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 272 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.898602 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5395  IclR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374154  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5466  IclR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4281  IclR family transcriptional regulator  36 
 
 		 266 aa  119  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4012  transcriptional regulator, IclR family  32.23 
 
 		 254 aa  116  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6316  IclR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 251 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0454  transcriptional regulator, IclR family  37.44 
 
 		 246 aa  112  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3984  regulatory proteins, IclR  35.98 
 
 		 270 aa  112  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104797  normal  0.0879634 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1720  IclR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 249 aa  111  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725475  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2803  IclR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 241 aa  98.2  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.323912 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3208  IclR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.129719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8019  putative transcriptional regulator, IclR  35.19 
 
 		 238 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0184  transcriptional regulator, IclR family  32.75 
 
 		 244 aa  88.2  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0625  regulatory proteins, IclR  32.09 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916177  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3464  transcriptional regulator, IclR family  32.41 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108588  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2520  IclR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.463274  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2257  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000173115 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1595  IclR-type transcriptional regulator  29.68 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1452  IclR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.378488  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0276  IclR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1686  transcriptional regulator, IclR family  33.18 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.698509  normal  0.0109367 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11090  transcriptional regulator, IclR family  33.18 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1592  IclR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.885509 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2358  transcriptional regulator, IclR family  33.18 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0195  transcriptional regulator, IclR family  26.97 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2317  transcriptional regulator, IclR family  33.64 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1148  IclR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.554824  unclonable  0.0000000376636 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1357  Transcriptional regulator IclR  32.38 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.775388 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1257  regulatory protein, IclR  30.84 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411018  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2031  IclR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 273 aa  73.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8050  transcriptional regulator, IclR family  31.78 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3174  regulatory protein, IclR  43.1 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5000  transcriptional regulator, IclR family  32.27 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272233  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1572  transcriptional regulator, IclR family  31.31 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.358394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1900  regulatory proteins, IclR  29.91 
 
 		 233 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.417398 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1920  IclR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 233 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245854  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3299  regulatory proteins, IclR  31.02 
 
 		 240 aa  72  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395884  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1966  regulatory proteins, IclR  29.91 
 
 		 233 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  28.17 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4749  transcriptional regulator, IclR family  29.32 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2032  transcriptional regulator, IclR family  36.88 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08730  transcriptional regulator  30.52 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00649547  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3622  IclR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.464151 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18570  transcriptional regulator, IclR family  30.09 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.424296  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1112  IclR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.794209 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  27.71 
 
 		 266 aa  68.6  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  27.71 
 
 		 266 aa  68.6  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1830  transcriptional regulator, IclR family  25.49 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135773  normal  0.345416 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  33.57 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  39.62 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 268 aa  65.5  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09640  transcriptional regulator, IclR family  37.96 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1648  regulatory proteins, IclR  36.79 
 
 		 270 aa  65.5  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1846  IclR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 263 aa  65.1  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762112  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3216  Transcriptional regulator IclR  29.73 
 
 		 244 aa  65.1  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15602  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  28.69 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  34.32 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  25.98 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1041  IclR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0399426 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  28 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1130  transcriptional regulator, IclR family  32.65 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3884  transcriptional regulator, IclR family  24.56 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1309  IclR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  23.69 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1205  IclR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230361  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2078  transcriptional regulator, IclR family  29.76 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.341471 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1936  transcriptional regulator, IclR family  28.25 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00885833 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>