More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1452 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1452  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 196 aa  389  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.378488  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 249 aa  89.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2914  IclR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 249 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 249 aa  89.7  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1950  IclR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 249 aa  89.7  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400846  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 249 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 249 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 249 aa  89.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8325  transcriptional regulator, IclR family  39.46 
 
 		 234 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2234  IclR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 249 aa  89  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4142  IclR family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 250 aa  88.6  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5624  IclR family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 234 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2721  IclR family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4617  IclR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4961  IclR family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.790351  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5349  IclR family transcriptional regulator  35 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2968  IclR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.980752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4808  IclR family transcriptional regulator  35 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4039  transcriptional regulator, IclR family  35.45 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4142  putative IclR family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000218071  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4151  transcriptional regulator, IclR family  35.45 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4707  IclR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5463  IclR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5399  IclR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438865  decreased coverage  0.00269642 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4871  IclR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.721296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0454  transcriptional regulator, IclR family  49.47 
 
 		 246 aa  78.6  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6026  IclR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 236 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.221801 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4803  IclR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.898602 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4515  IclR family transcriptional regulator  43.09 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.390313  normal  0.426328 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5395  IclR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374154  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5466  IclR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1720  IclR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 249 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4281  IclR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4012  transcriptional regulator, IclR family  37.31 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3982  transcriptional regulator, IclR family  38.46 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4095  transcriptional regulator, IclR family  38.46 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267726  normal  0.126686 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0951  IclR family transcriptional regulator  36 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  37.37 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02910  IclR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186754 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7080  Transcriptional regulator  35.2 
 
 		 231 aa  62  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6316  IclR family transcriptional regulator  35 
 
 		 251 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  36.54 
 
 		 246 aa  61.6  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2883  IclR family transcriptional regulator  29 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0306717  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3103  transcriptional regulator, IclR family  29 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3089  transcriptional regulator, IclR family  29 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3098  IclR family transcriptional regulator  29 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0903257  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1499  IclR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985089  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2875  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3122  IclR family transcriptional regulator  29 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.255406  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3121  transcriptional regulator, IclR family  29 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  36.45 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2746  transcriptional regulator, IclR family  33.02 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.881679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4432  IclR family transcriptional regulator family  38 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.199706 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2850  IclR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526346  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3984  regulatory proteins, IclR  33.61 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104797  normal  0.0879634 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  32.14 
 
 		 257 aa  58.5  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0179  IclR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 294 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6015  IclR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 263 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4028  IclR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 263 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4338  IclR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 263 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7063  transcriptional regulator, IclR family  34.26 
 
 		 294 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5019  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  30.72 
 
 		 252 aa  57.8  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.563485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4237  IclR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3208  IclR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.129719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5574  IclR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  32.94 
 
 		 252 aa  57  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 267 aa  57  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0160  transcriptional regulator, IclR family  32.79 
 
 		 244 aa  57  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2370  IclR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5543  regulatory protein, IclR  28.12 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.452687  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2811  IclR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.667309  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2147  transcriptional regulator, IclR family  28 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2511  regulatory proteins, IclR  31.17 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.433919 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2503  regulatory proteins, IclR  31.17 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3492  regulatory proteins, IclR  33.87 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2466  IclR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2866  regulatory protein, IclR  29.87 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  31.71 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1546  IclR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00070993  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 278 aa  55.1  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 264 aa  55.1  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0839  IclR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 304 aa  54.7  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199028 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2287  transcriptional regulator, IclR family  35.85 
 
 		 267 aa  54.7  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  0.385963 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3729  IclR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 268 aa  54.7  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4411  regulatory proteins, IclR  36.7 
 
 		 267 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.547579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0315  IclR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 284 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.301467  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1332  IclR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 284 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02250  transcriptional regulator  36.43 
 
 		 237 aa  53.9  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1311  IclR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 284 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512593  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2498  IclR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 284 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1238  IclR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 284 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159312  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6800  transcriptional regulator, IclR family  30.52 
 
 		 252 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4675  transcriptional regulator, IclR family  34.12 
 
 		 272 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.236119  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0043  transcriptional regulator, IclR family  35.34 
 
 		 268 aa  53.9  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0591  IclR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 284 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211243  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0976  IclR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 284 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41754  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2032  transcriptional regulator, IclR family  34.11 
 
 		 254 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3947  IclR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 267 aa  53.9  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251831 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>