More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_02910 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_02910  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 259 aa  508  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186754 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4910  IclR family transcriptional regulator  69.38 
 
 		 258 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30240  IclR family regulatory protein  71.71 
 
 		 258 aa  349  2e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0296  IclR family transcriptional regulator  66.28 
 
 		 260 aa  334  1e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3124  IclR family transcriptional regulator  68.22 
 
 		 258 aa  331  8e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.845824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2147  IclR family transcriptional regulator  69.38 
 
 		 258 aa  330  1e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197255 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2601  IclR family transcriptional regulator  68.22 
 
 		 258 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505615  normal  0.0687199 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3242  IclR family transcriptional regulator  69.77 
 
 		 258 aa  324  7e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.524532 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2707  regulatory protein IclR  52.59 
 
 		 292 aa  256  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6106  IclR family transcriptional regulator  49.62 
 
 		 280 aa  246  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.5704 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2088  transcriptional regulator, IclR family  56.63 
 
 		 273 aa  244  9e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4108  transcriptional regulator, IclR family  51.27 
 
 		 260 aa  238  8e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2705  regulatory proteins, IclR  50 
 
 		 284 aa  238  9e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.393671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5724  transcriptional regulator, IclR family  50.78 
 
 		 260 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5781  transcriptional regulator, IclR family  46.25 
 
 		 271 aa  224  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4650  IclR family transcriptional regulator  54.22 
 
 		 273 aa  223  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.455658 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2426  IclR family transcriptional regulator  51.65 
 
 		 269 aa  221  7e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.172825 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5796  IclR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 245 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5789  transcriptional regulator, IclR family  38.93 
 
 		 268 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  30.17 
 
 		 256 aa  125  6e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  33.47 
 
 		 280 aa  122  7e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  29.51 
 
 		 261 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  27.46 
 
 		 257 aa  108  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  30.36 
 
 		 277 aa  108  8.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  29.1 
 
 		 277 aa  108  9.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  29.39 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  30.08 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  29.51 
 
 		 259 aa  107  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  29.25 
 
 		 255 aa  105  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  28.74 
 
 		 280 aa  105  7e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  28.74 
 
 		 280 aa  105  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  28.74 
 
 		 280 aa  105  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2370  IclR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 268 aa  105  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  28.69 
 
 		 276 aa  105  8e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1072  IclR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0478344  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1166  IclR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 271 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  29.15 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  28.16 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  27.76 
 
 		 274 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  27.76 
 
 		 274 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  27.76 
 
 		 274 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  27.76 
 
 		 274 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  27.76 
 
 		 274 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  27.64 
 
 		 260 aa  102  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1087  transcriptional regulator, IclR family  33.76 
 
 		 258 aa  102  6e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  27.35 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  27.35 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  27.64 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  27.35 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  27.35 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  27.35 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  27.35 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  27.35 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  27.35 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4346  regulatory protein, IclR  30.2 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361524  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  27.76 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1604  IclR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.379428  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  30.08 
 
 		 260 aa  99.8  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 263 aa  99.8  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6015  IclR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 263 aa  99  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4028  IclR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 263 aa  99  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4338  IclR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 263 aa  99  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5574  IclR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 274 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4694  transcriptional regulator, IclR family  30.92 
 
 		 255 aa  96.7  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.116545  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2746  transcriptional regulator, IclR family  30.43 
 
 		 274 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.881679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 267 aa  96.7  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  31.69 
 
 		 251 aa  96.7  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6262  IclR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 260 aa  95.5  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1381  transcriptional regulator, IclR family  34.43 
 
 		 259 aa  95.5  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1499  IclR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 274 aa  94.7  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985089  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 275 aa  94.7  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 261 aa  94  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 268 aa  94  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 284 aa  94  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  33.06 
 
 		 257 aa  94  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  34.31 
 
 		 257 aa  93.2  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  28.63 
 
 		 280 aa  92.4  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  28.86 
 
 		 253 aa  92  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1375  pca regulon regulatory protein  27.87 
 
 		 291 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0822  transcriptional regulator, IclR family  32.35 
 
 		 258 aa  91.7  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4348  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  27.87 
 
 		 291 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.974938  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  27.24 
 
 		 257 aa  91.3  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  29.22 
 
 		 263 aa  91.3  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3407  transcriptional regulator, IclR family  30.36 
 
 		 255 aa  90.1  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.351965  normal  0.802524 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3411  transcription regulator protein  29.64 
 
 		 262 aa  90.1  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.531114 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3532  transcriptional regulator, IclR family  31.14 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6969  IclR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 283 aa  90.1  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4439  IclR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 291 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103527 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  28.86 
 
 		 252 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2575  transcriptional regulator, IclR family  32.03 
 
 		 262 aa  89.7  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  29.44 
 
 		 263 aa  89.7  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2259  IclR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 260 aa  89.4  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.10057  hitchhiker  0.0000000211035 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2466  IclR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 262 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2511  regulatory proteins, IclR  32.79 
 
 		 262 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.433919 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0115  transcriptional regulator, IclR family  30.08 
 
 		 279 aa  89  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 260 aa  89  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1015  IclR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 291 aa  89  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  hitchhiker  0.00000271522 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>