More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_02250 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_02250  transcriptional regulator  100 
 
 
237 aa  461  1e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  30.36 
 
 
265 aa  80.9  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1072  IclR family transcriptional regulator  27.35 
 
 
256 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0478344  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  30.6 
 
 
276 aa  76.3  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  30.56 
 
 
281 aa  75.5  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  41.01 
 
 
266 aa  73.6  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  28.69 
 
 
263 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0741  IclR family transcriptional regulator  27.05 
 
 
255 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000156602  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3121  transcriptional regulator, IclR family  32.61 
 
 
250 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2031  IclR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
273 aa  73.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3122  IclR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
250 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.255406  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2850  IclR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
250 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526346  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3103  transcriptional regulator, IclR family  32.61 
 
 
250 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3089  transcriptional regulator, IclR family  32.39 
 
 
250 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  23.92 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  23.92 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  23.92 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  23.92 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  23.92 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  23.92 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  23.92 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  23.92 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2883  IclR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
250 aa  72  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0306717  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3098  IclR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
250 aa  72  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0903257  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  24.21 
 
 
263 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  24.21 
 
 
263 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  24.21 
 
 
263 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2875  IclR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
250 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  24.21 
 
 
263 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  24.21 
 
 
263 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  28.37 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  24.51 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  28.37 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  32.39 
 
 
257 aa  70.5  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3087  transcriptional regulator, TrmB  27.41 
 
 
267 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515072  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26680  transcriptional regulator  39.26 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0674048  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  28.37 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2147  transcriptional regulator, IclR family  26.69 
 
 
250 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  29.71 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2968  IclR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
243 aa  69.7  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.980752  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  29.71 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  23.41 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  25.17 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  24.6 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  33.77 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1115  transcriptional regulator, IclR family  28.93 
 
 
223 aa  68.9  0.00000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4994  transcriptional regulator, IclR family  32.38 
 
 
224 aa  68.6  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0276676  normal  0.0169874 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  28.99 
 
 
278 aa  68.6  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5758  IclR family transcriptional regulator  31.21 
 
 
292 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2811  IclR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
250 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.667309  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2170  IclR family transcriptional regulator  34.97 
 
 
252 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0569  transcriptional regulator, IclR family  23.33 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
257 aa  67.8  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  28.37 
 
 
263 aa  68.2  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2354  IclR family transcriptional regulator  27.13 
 
 
258 aa  67  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  37.41 
 
 
277 aa  67  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1418  regulatory protein, IclR  26.03 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000240863  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  27.66 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2234  IclR family transcriptional regulator  31 
 
 
249 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  33.8 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27090  transcriptional regulator  33.8 
 
 
268 aa  65.5  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  31.69 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 
254 aa  65.5  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  27.02 
 
 
261 aa  65.1  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2008  transcriptional regulator IclR  33.81 
 
 
260 aa  65.1  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  37.75 
 
 
252 aa  64.7  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
258 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  26.72 
 
 
260 aa  65.1  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  37.33 
 
 
277 aa  64.7  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  31.43 
 
 
258 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  33.81 
 
 
249 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2208  transcriptional regulator, IclR family  26.95 
 
 
290 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2063  transcriptional regulator IclR  28.99 
 
 
255 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0428372  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  24.89 
 
 
275 aa  63.9  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4281  IclR family transcriptional regulator  29.95 
 
 
266 aa  63.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  27.86 
 
 
252 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3701  transcriptional regulator, IclR family  28.15 
 
 
262 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  26.72 
 
 
260 aa  63.2  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1950  IclR family transcriptional regulator  30.57 
 
 
249 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400846  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1309  IclR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
262 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  30.57 
 
 
249 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
263 aa  63.5  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2914  IclR family transcriptional regulator  30.57 
 
 
249 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6969  IclR family transcriptional regulator  37.86 
 
 
283 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  30.57 
 
 
249 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3940  transcriptional regulator, IclR family  29.93 
 
 
256 aa  63.5  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  30.57 
 
 
249 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2185  transcriptional regulator, IclR family  38.93 
 
 
259 aa  63.2  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  30.57 
 
 
249 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  30.57 
 
 
249 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5123  transcriptional regulator, IclR family  35.04 
 
 
255 aa  62.8  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0724  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 
246 aa  62.8  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0508551 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1081  transcriptional regulator, IclR family  36.43 
 
 
259 aa  62.8  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.199562  normal  0.251697 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0547  transcriptional regulator, IclR family  33.57 
 
 
265 aa  62.8  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244078  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3407  transcriptional regulator, IclR family  28.47 
 
 
255 aa  62.8  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.351965  normal  0.802524 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  31.21 
 
 
255 aa  62.4  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2854  transcriptional regulator, IclR family  32.86 
 
 
285 aa  62.4  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  28.68 
 
 
254 aa  62.4  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1462  transcriptional regulator, TrmB  36.18 
 
 
261 aa  62.4  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1205  IclR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
261 aa  62.4  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230361  normal  0.161906 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>