More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_27090 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_27090  transcriptional regulator  100 
 
 		 268 aa  542  1e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1249  transcriptional regulator, IclR family  42.08 
 
 		 262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  32.41 
 
 		 276 aa  112  5e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  28.51 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  35.23 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  31.9 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  32.66 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  31.82 
 
 		 248 aa  106  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 261 aa  106  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  31.25 
 
 		 260 aa  105  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  32.91 
 
 		 265 aa  105  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  27.71 
 
 		 261 aa  105  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  32.26 
 
 		 260 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 272 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  30.4 
 
 		 259 aa  104  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 265 aa  102  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  32.47 
 
 		 280 aa  102  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 259 aa  102  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0115  transcriptional regulator, IclR family  32.51 
 
 		 279 aa  102  9e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  28.34 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1462  transcriptional regulator, TrmB  32.45 
 
 		 261 aa  100  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  27.68 
 
 		 276 aa  99.4  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  34.47 
 
 		 249 aa  99.4  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 262 aa  98.6  9e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 256 aa  98.6  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  31.45 
 
 		 281 aa  97.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  29.91 
 
 		 278 aa  97.4  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  29.2 
 
 		 251 aa  97.1  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  32.73 
 
 		 249 aa  97.1  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  27.41 
 
 		 277 aa  97.1  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 251 aa  95.9  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0265  transcriptional regulator, IclR family  33.19 
 
 		 264 aa  95.5  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 268 aa  95.5  8e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0741  IclR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 255 aa  95.1  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000156602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  36.24 
 
 		 255 aa  95.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  29.29 
 
 		 252 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  30.45 
 
 		 257 aa  94.7  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  32.88 
 
 		 258 aa  94.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  29.69 
 
 		 280 aa  94  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  28.74 
 
 		 280 aa  94.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  28.74 
 
 		 280 aa  94.4  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  28.74 
 
 		 280 aa  94.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08220  transcriptional regulator, IclR family  28.27 
 
 		 257 aa  93.2  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 275 aa  93.2  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 260 aa  93.2  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3031  regulatory protein, IclR  30.56 
 
 		 276 aa  92  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  28.1 
 
 		 252 aa  92  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  29.74 
 
 		 260 aa  92  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  26.94 
 
 		 277 aa  91.7  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  34.8 
 
 		 290 aa  91.3  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  25.56 
 
 		 276 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 261 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 260 aa  90.9  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  25.93 
 
 		 277 aa  90.1  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1072  IclR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 256 aa  89.7  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0478344  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1841  IclR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 261 aa  89.7  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.292515  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  28.95 
 
 		 253 aa  89.7  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  32.59 
 
 		 275 aa  89  7e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0155  regulatory proteins, IclR  31.38 
 
 		 243 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.269234  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  27.47 
 
 		 274 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  27.47 
 
 		 274 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2170  IclR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 252 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  29.03 
 
 		 274 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  29.03 
 
 		 274 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  27.47 
 
 		 274 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  27.47 
 
 		 274 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  27.47 
 
 		 274 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  27.47 
 
 		 274 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 260 aa  87.8  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  31.06 
 
 		 265 aa  88.2  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  30.18 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  29.03 
 
 		 274 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  29.03 
 
 		 274 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  27.47 
 
 		 274 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4346  regulatory protein, IclR  32.16 
 
 		 263 aa  88.6  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361524  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  29.03 
 
 		 274 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  27.47 
 
 		 274 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 265 aa  87.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  33.05 
 
 		 257 aa  87.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 283 aa  87.4  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0202  regulatory proteins, IclR  31.75 
 
 		 276 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  30.25 
 
 		 255 aa  86.7  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4893  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 262 aa  86.7  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 273 aa  86.3  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  28.63 
 
 		 275 aa  86.3  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 276 aa  85.9  6e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2875  IclR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 250 aa  85.9  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  28.46 
 
 		 279 aa  85.5  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  29.37 
 
 		 267 aa  85.5  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3174  regulatory protein, IclR  30.22 
 
 		 264 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3121  transcriptional regulator, IclR family  31.43 
 
 		 250 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3122  IclR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 250 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.255406  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2883  IclR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0306717  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3098  IclR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0903257  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  26.42 
 
 		 257 aa  85.1  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3089  transcriptional regulator, IclR family  31.1 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0211  transcriptional regulator IclR  31.53 
 
 		 262 aa  85.1  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>