More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMAA1950 on replicon NC_006349
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA1950  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 249 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400846  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 249 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2914  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 249 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 249 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 249 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  99.2 
 
 		 249 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  99.2 
 
 		 249 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2234  IclR family transcriptional regulator  97.99 
 
 		 249 aa  487  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1720  IclR family transcriptional regulator  73.03 
 
 		 249 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4142  putative IclR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000218071  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4039  transcriptional regulator, IclR family  41.88 
 
 		 264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4151  transcriptional regulator, IclR family  41.88 
 
 		 264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7080  Transcriptional regulator  41.7 
 
 		 231 aa  171  7.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4012  transcriptional regulator, IclR family  44.39 
 
 		 254 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4961  IclR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 248 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.790351  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2721  IclR family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 247 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5395  IclR family transcriptional regulator  42.08 
 
 		 272 aa  168  7e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374154  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5466  IclR family transcriptional regulator  42.08 
 
 		 272 aa  168  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4803  IclR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.898602 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4808  IclR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 273 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2968  IclR family transcriptional regulator  44.6 
 
 		 243 aa  161  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.980752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5349  IclR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 273 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4142  IclR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 250 aa  156  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4281  IclR family transcriptional regulator  40 
 
 		 266 aa  155  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5624  IclR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 234 aa  155  6e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8325  transcriptional regulator, IclR family  38.86 
 
 		 234 aa  151  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0454  transcriptional regulator, IclR family  40.51 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4515  IclR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 242 aa  145  6e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.390313  normal  0.426328 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6316  IclR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 251 aa  142  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3984  regulatory proteins, IclR  39.53 
 
 		 270 aa  142  6e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104797  normal  0.0879634 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4432  IclR family transcriptional regulator family  40.09 
 
 		 334 aa  139  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.199706 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3208  IclR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.129719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5463  IclR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 236 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5399  IclR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 236 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438865  decreased coverage  0.00269642 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4871  IclR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 236 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.721296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4617  IclR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 242 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6026  IclR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 236 aa  126  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.221801 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4707  IclR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 236 aa  125  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4095  transcriptional regulator, IclR family  37.05 
 
 		 236 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267726  normal  0.126686 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3982  transcriptional regulator, IclR family  37.05 
 
 		 236 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0625  regulatory proteins, IclR  32.08 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916177  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 257 aa  105  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2803  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.323912 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  31.54 
 
 		 252 aa  104  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0276  IclR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4247  regulatory proteins, IclR  35.96 
 
 		 244 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2399  regulatory protein, IclR  35.36 
 
 		 233 aa  98.6  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1592  IclR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 238 aa  97.8  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.885509 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4161  IclR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 247 aa  96.7  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3792  regulatory proteins, IclR  35.39 
 
 		 260 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.711541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3788  IclR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 260 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.65348  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3861  regulatory proteins, IclR  35.39 
 
 		 260 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1239  IclR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 252 aa  95.1  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1774  IclR family transcriptional regulator  35 
 
 		 246 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.227269  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0652  IclR family transcriptional regulator  35 
 
 		 246 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2384  IclR family transcriptional regulator  35 
 
 		 246 aa  93.2  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0811  IclR family transcriptional regulator  35 
 
 		 246 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1595  IclR-type transcriptional regulator  30.99 
 
 		 266 aa  93.6  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8019  putative transcriptional regulator, IclR  32.27 
 
 		 238 aa  92.4  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1171  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 246 aa  92  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1686  transcriptional regulator, IclR family  31.38 
 
 		 246 aa  91.7  9e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.698509  normal  0.0109367 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1095  IclR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 246 aa  92  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470095  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11090  transcriptional regulator, IclR family  31.38 
 
 		 239 aa  91.3  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18570  transcriptional regulator, IclR family  30.54 
 
 		 244 aa  90.9  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.424296  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1452  IclR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 196 aa  89.7  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.378488  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2358  transcriptional regulator, IclR family  31.03 
 
 		 239 aa  89.7  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  30.67 
 
 		 249 aa  89.7  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2078  transcriptional regulator, IclR family  29.8 
 
 		 270 aa  89.4  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.341471 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4054  transcriptional regulator, IclR family  30.6 
 
 		 233 aa  89.4  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2134  regulatory proteins, IclR  30.63 
 
 		 233 aa  89  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2317  transcriptional regulator, IclR family  30.96 
 
 		 239 aa  88.6  9e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08730  transcriptional regulator  31.74 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00649547  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0184  transcriptional regulator, IclR family  29.82 
 
 		 244 aa  87.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3299  regulatory proteins, IclR  30.13 
 
 		 240 aa  87.4  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395884  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8050  transcriptional regulator, IclR family  30.54 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1112  IclR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 307 aa  86.7  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.794209 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  24.9 
 
 		 259 aa  87  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1572  transcriptional regulator, IclR family  30.54 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.358394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  30.86 
 
 		 273 aa  86.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1900  regulatory proteins, IclR  28.24 
 
 		 233 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.417398 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1920  IclR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 233 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1966  regulatory proteins, IclR  28.24 
 
 		 233 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13004  transcriptional regulator  28.3 
 
 		 233 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  31.12 
 
 		 280 aa  85.5  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2520  IclR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 239 aa  85.5  8e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.463274  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2902  IclR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 248 aa  85.5  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2324  regulatory protein IclR  23.77 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000642248  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1041  IclR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0399426 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0105  putative transcriptional regulator  29.54 
 
 		 244 aa  84.7  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0650  transcriptional regulator, IclR family  29.3 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2257  transcriptional regulator, IclR family  30.54 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000173115 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3464  transcriptional regulator, IclR family  29.71 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108588  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4228  regulatory protein, IclR  29.86 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6906  IclR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.162528  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>