More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0105 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0105  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 244 aa  499  1e-140  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001509  transcriptional regulator  81.97 
 
 		 244 aa  418  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05447  hypothetical protein  80.74 
 
 		 244 aa  410  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23190  putative transcriptional regulator  38.98 
 
 		 242 aa  148  8e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144138 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2392  transcriptional regulator, IclR family  36.64 
 
 		 256 aa  144  9e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1955  putative transcriptional regulator  38.26 
 
 		 242 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2799  transcriptional regulator, IclR family  36.64 
 
 		 256 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4161  IclR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 247 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1041  IclR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 258 aa  125  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0399426 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0160  transcriptional regulator, IclR family  34.91 
 
 		 244 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2051  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 249 aa  122  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0630504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4409  transcriptional regulator, IclR family  32.91 
 
 		 249 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1595  IclR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0615  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  28.31 
 
 		 261 aa  87.8  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 257 aa  87  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1950  IclR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400846  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2234  IclR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2914  IclR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3441  regulatory proteins, IclR  26.61 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3331  IclR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.181508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1795  IclR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0248874  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5810  IclR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 286 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1720  IclR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3031  regulatory protein, IclR  29.33 
 
 		 276 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  32 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2670  transcriptional regulator, IclR family  23.55 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2407  IclR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  26.87 
 
 		 256 aa  75.1  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6211  IclR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 282 aa  75.5  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.253024 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  24.9 
 
 		 254 aa  75.1  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1550  IclR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2997  transcriptional regulator, IclR family  28.04 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000293237  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2324  regulatory protein IclR  29.25 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000642248  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4172  transcriptional regulator, IclR family  23.38 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102148  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0681  regulatory proteins, IclR  29.63 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2248  transcriptional regulator, IclR family  27.36 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.000278056 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3296  IclR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 250 aa  72  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0202  regulatory proteins, IclR  28.85 
 
 		 276 aa  72  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5598  Transcriptional regulator  28.37 
 
 		 246 aa  71.6  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0201808  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0381  IclR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0473  regulatory protein IclR  25.65 
 
 		 244 aa  71.6  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4416  transcriptional regulator, IclR family  27.56 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3795  IclR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433741 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6466  transcriptional regulator, IclR family  27.94 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185933  normal  0.684135 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0340  IclR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.151352  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1592  IclR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.885509 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0824  transcriptional regulator, IclR family  24.03 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4689  transcriptional regulator, IclR family  27.27 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3974  transcriptional regulator, IclR family  25.4 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.482822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  27.23 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2785  IclR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253598  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2997  IclR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4054  transcriptional regulator, IclR family  27.43 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4433  regulatory proteins, IclR  25.74 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343959  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2734  IclR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.16584e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4281  IclR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3984  regulatory proteins, IclR  28.3 
 
 		 270 aa  68.9  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104797  normal  0.0879634 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2995  transcriptional regulator, IclR family  26.85 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.71341e-17 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1112  IclR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 307 aa  68.6  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.794209 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 255 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3532  transcriptional regulator, IclR family  26.36 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2715  IclR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000240532  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3031  transcriptional regulator, IclR family  27.31 
 
 		 249 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1900  regulatory proteins, IclR  28.57 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.417398 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5128  transcriptional regulator, IclR family  26.97 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2316  IclR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812394  normal  0.959704 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1966  regulatory proteins, IclR  28.57 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1920  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245854  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4884  transcriptional regulator, IclR family  26.64 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574165  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2968  IclR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.980752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2134  regulatory proteins, IclR  29.03 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  24.2 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  28.19 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2854  transcriptional regulator, IclR family  25.41 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0813  transcriptional regulator, IclR family  28.77 
 
 		 249 aa  67  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225314  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7080  Transcriptional regulator  26.32 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3033  IclR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000487376  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3857  transcriptional regulator, IclR family  25.21 
 
 		 287 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2873  transcriptional regulator, IclR family  22.84 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0130818 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1407  transcriptional regulator, IclR family  23.35 
 
 		 257 aa  67  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3261  IclR family transcriptional regulator  28 
 
 		 284 aa  67  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4784  transcriptional regulator, IclR family  24.09 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.820047  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0276  IclR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 237 aa  67  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  24.23 
 
 		 261 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0625  regulatory proteins, IclR  31.14 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916177  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5069  transcriptional regulator, IclR family  28.51 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.469933  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30950  transcriptional regulator, IclR family  27.15 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648334  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>