More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5810 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5810  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 286 aa  578  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3441  regulatory proteins, IclR  42.53 
 
 		 260 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3613  IclR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 317 aa  170  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0615  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  41.82 
 
 		 261 aa  162  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7431  Transcriptional regulator  38.43 
 
 		 257 aa  158  9e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3331  IclR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 284 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.181508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0340  IclR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 272 aa  132  5e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.151352  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5598  Transcriptional regulator  31.06 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0201808  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0993  IclR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.892724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6484  IclR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 242 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140944  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6719  IclR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 242 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.182238  normal  0.45322 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0473  regulatory protein IclR  29.75 
 
 		 244 aa  116  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3795  IclR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 247 aa  106  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433741 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  28.69 
 
 		 253 aa  92.4  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1955  putative transcriptional regulator  30.24 
 
 		 242 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6466  transcriptional regulator, IclR family  31.9 
 
 		 266 aa  89.4  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185933  normal  0.684135 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23190  putative transcriptional regulator  30.04 
 
 		 242 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  32.7 
 
 		 273 aa  85.5  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2324  regulatory protein IclR  28.14 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000642248  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05447  hypothetical protein  30.04 
 
 		 244 aa  82  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  29.82 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001509  transcriptional regulator  29.22 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2078  transcriptional regulator, IclR family  28.91 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.341471 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0105  putative transcriptional regulator  28.4 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2799  transcriptional regulator, IclR family  30.58 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  25.93 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2997  transcriptional regulator, IclR family  26.46 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000293237  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2785  IclR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253598  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2997  IclR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3033  IclR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000487376  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3031  transcriptional regulator, IclR family  26.85 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2248  transcriptional regulator, IclR family  26.98 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.000278056 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2715  IclR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000240532  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2392  transcriptional regulator, IclR family  30.99 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2995  transcriptional regulator, IclR family  26.46 
 
 		 249 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.71341e-17 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2734  IclR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.16584e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4409  transcriptional regulator, IclR family  30.05 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  25 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0160  transcriptional regulator, IclR family  28.77 
 
 		 244 aa  72  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  29.84 
 
 		 249 aa  72  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4161  IclR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2051  IclR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0630504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1041  IclR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0399426 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2810  IclR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 247 aa  68.9  0.00000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.162852  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1684  transcriptional regulator, IclR family  30.3 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0925752  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5545  regulatory protein, IclR  26.89 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0364  IclR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 265 aa  67  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2149  IclR family transcriptional regulator, putative  25.55 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1595  IclR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  25.88 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  31.02 
 
 		 252 aa  65.5  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0041  IclR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 288 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2370  IclR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4095  IclR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129203  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5560  IclR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.15712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1418  regulatory protein, IclR  25.11 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000240863  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2670  transcriptional regulator, IclR family  21.74 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6634  IclR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0992864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18740  transcriptional regulator  27.34 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.691347  normal  0.112015 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1795  IclR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0248874  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0162  transcriptional regulator, IclR family  26.61 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4172  transcriptional regulator, IclR family  28.78 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102148  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4961  IclR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.790351  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  26.89 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3411  transcription regulator protein  26.77 
 
 		 262 aa  62  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.531114 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  23.87 
 
 		 246 aa  62  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  25.23 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1830  transcriptional regulator, IclR family  30.81 
 
 		 264 aa  62  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135773  normal  0.345416 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  23.87 
 
 		 246 aa  62  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3303  IclR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 244 aa  62  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.870247  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30950  transcriptional regulator, IclR family  25.79 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2316  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812394  normal  0.959704 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2713  IclR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0235576  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2381  IclR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2778  IclR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0655324  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4884  transcriptional regulator, IclR family  28.31 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574165  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5543  regulatory protein, IclR  26.67 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.452687  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5574  IclR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  27.89 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1499  IclR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985089  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2746  transcriptional regulator, IclR family  27.2 
 
 		 274 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.881679  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3590  IclR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0190  IclR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.49367  normal  0.390724 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  24.65 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0951  IclR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 258 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2380  IclR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.610686  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3214  transcriptional regulator, IclR family  25.2 
 
 		 280 aa  58.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4515  IclR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.390313  normal  0.426328 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>