More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0340 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0340  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 272 aa  561  1.0000000000000001e-159  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.151352  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3795  IclR family transcriptional regulator  45.49 
 
 		 247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433741 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7431  Transcriptional regulator  32.8 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3613  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0993  IclR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 251 aa  136  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.892724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5810  IclR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 286 aa  132  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5598  Transcriptional regulator  33.33 
 
 		 246 aa  124  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0201808  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3331  IclR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 284 aa  122  6e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.181508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6484  IclR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 242 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140944  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6719  IclR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 242 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.182238  normal  0.45322 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3441  regulatory proteins, IclR  31.2 
 
 		 260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0473  regulatory protein IclR  27.7 
 
 		 244 aa  105  7e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0615  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  29.55 
 
 		 261 aa  102  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1041  IclR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 258 aa  87.8  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0399426 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2051  IclR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 249 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0630504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0160  transcriptional regulator, IclR family  27.75 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0625  regulatory proteins, IclR  28.35 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916177  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05447  hypothetical protein  26.78 
 
 		 244 aa  83.2  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0222  Transcriptional regulator IclR  30.14 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.300165  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6466  transcriptional regulator, IclR family  28.51 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185933  normal  0.684135 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001509  transcriptional regulator  25.14 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0349  IclR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000127041  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4161  IclR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1955  putative transcriptional regulator  26.19 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4409  transcriptional regulator, IclR family  25.73 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2803  IclR family transcriptional regulator  28 
 
 		 241 aa  75.1  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.323912 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2324  regulatory protein IclR  25.98 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000642248  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23190  putative transcriptional regulator  25.57 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144138 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2799  transcriptional regulator, IclR family  26.78 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2392  transcriptional regulator, IclR family  26.72 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0105  putative transcriptional regulator  24.59 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1595  IclR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0373  IclR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1796  IclR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.043994  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0587  transcriptional regulator, IclR family  25.31 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0391803 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0091  transcriptional regulator, IclR family  31.21 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2785  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253598  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 258 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2997  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0184  transcriptional regulator, IclR family  27.39 
 
 		 244 aa  67  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0813  transcriptional regulator, IclR family  25.81 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225314  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2997  transcriptional regulator, IclR family  24.6 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000293237  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0381  IclR family transcriptional regulator  22.98 
 
 		 301 aa  67  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7080  Transcriptional regulator  23.04 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1795  IclR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0248874  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3031  transcriptional regulator, IclR family  24.6 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3326  transcriptional regulator, IclR family  27.68 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.021393  hitchhiker  0.00795692 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  26.61 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2995  transcriptional regulator, IclR family  24.6 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.71341e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2715  IclR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000240532  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  22.79 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3033  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000487376  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2734  IclR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.16584e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1130  transcriptional regulator, IclR family  24.6 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3826  transcriptional regulator, IclR family  26.51 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4961  IclR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.790351  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4000  regulatory proteins, IclR  26.85 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3464  transcriptional regulator, IclR family  26.79 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108588  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2873  IclR family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20110  transcriptional regulator  26.86 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2248  transcriptional regulator, IclR family  24.21 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.000278056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8019  putative transcriptional regulator, IclR  26.22 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4172  transcriptional regulator, IclR family  28.02 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102148  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2285  transcriptional regulator, IclR family  24.58 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  25.45 
 
 		 265 aa  62  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0951  IclR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 268 aa  62  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3089  transcriptional regulator, IclR family  25.12 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0134  IclR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 268 aa  62  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272177  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0190  IclR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 241 aa  62  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.49367  normal  0.390724 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1583  IclR-type transcriptional regulator  25.21 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3214  transcriptional regulator, IclR family  27.36 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18570  transcriptional regulator, IclR family  26.32 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.424296  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  25.45 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2380  IclR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.610686  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4374  transcriptional regulator, IclR family  25.1 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0492  IclR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  27.31 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3002  transcriptional regulator, IclR family  27.8 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169737  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6267  transcriptional regulator, IclR family  25 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6028  transcriptional regulator, IclR family  25.96 
 
 		 546 aa  60.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0187184  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3345  regulatory protein, IclR  24.89 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4894  regulatory proteins, IclR  27.35 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2985  regulatory proteins, IclR  31.13 
 
 		 516 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3080  transcriptional regulator, IclR family  24.42 
 
 		 281 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3299  regulatory proteins, IclR  25.89 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395884  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1592  IclR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.885509 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  23.25 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4229  IclR family transcriptional regulator  23.17 
 
 		 318 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.423697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0501  transcriptional regulator, IclR family  25 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2358  transcriptional regulator, IclR family  26.09 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0198  Transcriptional regulator IclR  27.57 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101079  normal  0.134776 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0808  transcriptional regulator, IclR family  25.41 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0195  transcriptional regulator, IclR family  24.47 
 
 		 277 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4142  putative IclR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000218071  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  26.85 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3303  IclR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.870247  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  27.7 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>