More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2985 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2985  regulatory proteins, IclR  100 
 
 		 516 aa  1049    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1370  transcriptional regulator IclR-like protein  46.68 
 
 		 512 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874129  normal  0.612031 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0813  transcriptional regulator, IclR family  32.84 
 
 		 249 aa  85.5  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225314  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0364  IclR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 265 aa  75.1  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  30.58 
 
 		 254 aa  75.1  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6906  IclR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 264 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.162528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4374  transcriptional regulator, IclR family  30.41 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  30.86 
 
 		 256 aa  73.2  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2316  IclR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812394  normal  0.959704 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3974  transcriptional regulator, IclR family  26.27 
 
 		 266 aa  69.7  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.482822  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  29.36 
 
 		 274 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  29.36 
 
 		 274 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  29.36 
 
 		 274 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  29.36 
 
 		 274 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  29.36 
 
 		 274 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  29.36 
 
 		 274 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  29.36 
 
 		 274 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  29.36 
 
 		 274 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  29.01 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  31.51 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0697  IclR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 293 aa  67  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.734635  decreased coverage  0.00216711 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4416  transcriptional regulator, IclR family  32.1 
 
 		 251 aa  67  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  31.33 
 
 		 261 aa  66.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  26.87 
 
 		 254 aa  66.6  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19700  transcriptional regulator, IclR family  29.96 
 
 		 272 aa  66.6  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.089385  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 264 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 267 aa  65.5  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0327  transcriptional regulator, IclR family  34.27 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.720721 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0824  transcriptional regulator, IclR family  28.44 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6211  IclR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 282 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.253024 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0501  transcriptional regulator, IclR family  30.34 
 
 		 254 aa  65.1  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4716  transcriptional regulator, IclR family  29.73 
 
 		 245 aa  65.1  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2799  transcriptional regulator, IclR family  28.42 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0700  IclR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.456524  decreased coverage  0.00240678 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4376  transcriptional regulator, IclR family  28.27 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  28.22 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6219  IclR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 254 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0340  IclR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 260 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3676  IclR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 260 aa  63.2  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0314  transcriptional regulator IclR-like protein  23.92 
 
 		 269 aa  62.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4433  regulatory proteins, IclR  28.57 
 
 		 254 aa  63.2  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  28.71 
 
 		 274 aa  62.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5545  regulatory protein, IclR  25.88 
 
 		 251 aa  62.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  28.71 
 
 		 274 aa  62.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  28.71 
 
 		 274 aa  62.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4694  transcriptional regulator, IclR family  29.61 
 
 		 255 aa  62  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.116545  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  28.71 
 
 		 274 aa  62.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  28.71 
 
 		 274 aa  62.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  32.82 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  32.14 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1222  transcriptional regulator, IclR family  31.12 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2392  transcriptional regulator, IclR family  27.89 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  29.21 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  29.63 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  28.57 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4381  transcriptional regulator, IclR family  26.79 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4369  IclR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1041  IclR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0399426 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1638  transcriptional regulator IclR-like protein  28.5 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.318022  normal  0.187362 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3479  regulatory proteins, IclR  29.44 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0476526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0978  IclR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0639197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0340  IclR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.151352  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13880  transcriptional regulatory protein, IclR family  26.56 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176969  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30950  transcriptional regulator, IclR family  26.8 
 
 		 277 aa  59.7  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648334  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3802  transcriptional regulator, IclR family  28.43 
 
 		 264 aa  59.3  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434289  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1912  IclR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 283 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9117  IclR family transciptional regulator  25.3 
 
 		 252 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  28.65 
 
 		 255 aa  59.7  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3326  transcriptional regulator, IclR family  26.89 
 
 		 255 aa  59.7  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.021393  hitchhiker  0.00795692 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 254 aa  59.3  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3835  transcriptional regulator, IclR family  26.16 
 
 		 271 aa  58.9  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.790714  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  27.98 
 
 		 277 aa  59.3  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5946  IclR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 266 aa  58.9  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6634  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0992864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2575  transcriptional regulator, IclR family  27.78 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  29.75 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0947  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.264338 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6222  IclR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0713  IclR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.152863 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0605  regulatory proteins, IclR  30 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  33.01 
 
 		 273 aa  57  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2872  transcriptional regulator, IclR family  26.55 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4749  transcriptional regulator, IclR family  27.84 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4647  transcriptional regulator, IclR family  30.26 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4215  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 		 258 aa  57  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.0022938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5069  transcriptional regulator, IclR family  26.91 
 
 		 251 aa  57  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.469933  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 260 aa  57  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1796  IclR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 246 aa  57  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.043994  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4413  transcriptional regulator, IclR family  31.41 
 
 		 251 aa  57  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5397  transcriptional regulator, IclR family  30.4 
 
 		 261 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0868  IclR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 252 aa  56.6  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3800  putative transcriptional regulator  28.38 
 
 		 251 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3734  putative transcriptional regulator  28.38 
 
 		 251 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  29.44 
 
 		 266 aa  56.6  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  29.44 
 
 		 266 aa  56.6  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3842  putative transcriptional regulator  28.38 
 
 		 251 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312233  normal  0.510339 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3903  putative transcriptional regulator  28.38 
 
 		 251 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.575083  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 263 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>